Thursday, December 1, 2022

appendix v-500

This is an appendix to: On The Origin of The Containment Entity - 2



Link: KF377577.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(11), CAC(9), CAU(11), ATT(9), ATC(9),
ATA(11), AUU(9), AUC(9), AUA(11), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(8), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(10), CUU(11), CUC(8),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(7), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(8),
AGG(9), CGU(8), TCT(8), TCC(9), TCA(9), TCG(7), AGT(9),
AGC(10), UCU(8), UCC(9), UCA(9), UCG(7), AGU(9), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(10), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 876


Link: LM645058.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 891


Link: MT226602.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: KR265796.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
ATA(8), AUU(11), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(11), CTA(10), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(11), CUC(11),
CUA(10), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(11), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(11), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 905


Link: KJ645654.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(8),
ATA(8), AUU(10), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(12),
CTC(11), CTA(11), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
CUA(11), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 899


Link: KJ425486.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(11), GAC(9), GAU(11), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(8), CTA(11), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(8),
CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 888


Link: KJ645683.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(8),
ATA(8), AUU(10), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(12),
CTC(11), CTA(11), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
CUA(11), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 899


Link: KM392224.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(10), CTA(12), CTG(9), TTA(9), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(12), CUG(9), UUA(9), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(10),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(10), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 890


Link: KR265792.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
ATA(8), AUU(11), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(11), CTA(10), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(11), CUC(11),
CUA(10), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(11), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
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GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 905


Link: MF598643.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
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AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: NC_039208.1
Porcine coronavirus HKU15
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(8), TGC(9),
UGU(8), UGC(9), GAT(9), GAC(10), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(10), AUU(10), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(10), CTT(10),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(9), CUU(10), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(7), AUG(7), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(9), CCC(9), CCA(10), CCG(9), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(11), TCC(10), TCA(9), TCG(7), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(9), UCG(7), AGU(10), ACT(9),
ACC(10), ACA(9), ACG(7), ACU(9), GTT(10), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(8), UGG(8),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 869


Link: NC_009657.1
Scotophilus bat coronavirus 512
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(8), GCA(9), GCG(6), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(11), GAC(10), GAU(11), GAA(9), GAG(7),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(8), GGA(8),
GGG(8), GGU(9), CAT(8), CAC(9), CAU(8), ATT(11), ATC(9),
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CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
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GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 887


Link: MN692777.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(8),
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AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 900


Link: KJ960180.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
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TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 894


Link: KF760557.2
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
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ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 895


Link: KM027260.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
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Total Codons: 909


Link: MK071630.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 898


Link: MN654970.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 916


Link: MH726403.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(6), CCA(9), CCG(8), CCU(9),
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AGG(9), CGU(9), TCT(12), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(12), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 894


Link: KY369911.1
Human coronavirus 229E
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(8), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(9), GAG(10),
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TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 870


Link: LC260042.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
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ACC(11), ACA(9), ACG(7), ACU(8), GTT(10), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),
Total Codons: 882


Link: MT226600.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
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AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: KU982973.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
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GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(8),
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CTC(11), CTA(10), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(11), CUC(11),
CUA(10), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(12), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(12), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 889


Link: AB257344.1
SARS coronavirus Frankfurt 1
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(8), GCU(10), TGT(12), TGC(10),
UGU(12), UGC(10), GAT(11), GAC(9), GAU(11), GAA(10), GAG(9),
TTT(9), TTC(10), UUU(9), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(8),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(8), ATC(11),
ATA(9), AUU(8), AUC(11), AUA(9), AAA(11), AAG(9), CTT(11),
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ACC(9), ACA(9), ACG(10), ACU(10), GTT(10), GTC(10), GTA(11),
GTG(10), GUU(10), GUC(10), GUA(11), GUG(10), TGG(8), UGG(8),
TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),
Total Codons: 907


Link: MN197549.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(11), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(11), TGT(10), TGC(11),
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Total Codons: 890


Link: MF598605.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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Total Codons: 913


Link: MW436704.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(11), GAC(9), GAU(11), GAA(8), GAG(8),
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GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 888


Link: MH052683.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
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Total Codons: 891


Link: MG011355.2
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
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Total Codons: 907


Link: KT368824.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 911


Link: MN758608.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
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GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 913


Link: MN654988.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 914


Link: KU851864.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
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CUA(9), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(9), CGG(8), AGA(9),
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GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 907


Link: MH052685.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 889


Link: MH726391.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 900


Link: MH726401.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
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CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
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GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 893


Link: JQ989271.1
Rousettus bat coronavirus HKU10
Codon (Counts):
GCT(8), GCC(8), GCA(9), GCG(9), GCU(8), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(10), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(8), GGA(9),
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CAA(9), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(8),
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AGC(8), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(9), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(9),
GTG(11), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(11), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 891


Link: MK071267.1
Avian coronavirus (ACoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
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CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(7), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(9), CGU(8), TCT(9), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(9), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 887


Link: MG912598.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
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GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: MN611522.1
Rhinolophus affinis bat coronavirus HKU2-related
Codon (Counts):
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CUA(10), CUG(9), UUA(9), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(11), CGC(9), CGA(8), CGG(7), AGA(8),
AGG(9), CGU(11), TCT(9), TCC(11), TCA(10), TCG(10), AGT(10),
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TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 895


Link: MN758612.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: KU982975.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
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GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(8),
ATA(8), AUU(10), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(11), CTA(10), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(11), CUC(11),
CUA(10), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(12), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(12), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 890


Link: MH779856.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(10), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(10), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(10), ATC(8),
ATA(10), AUU(10), AUC(8), AUA(10), AAA(10), AAG(8), CTT(11),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(11), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(11), CCG(8), CCU(10),
CAA(10), CAG(10), CGT(9), CGC(9), CGA(7), CGG(9), AGA(9),
AGG(9), CGU(9), TCT(9), TCC(10), TCA(9), TCG(7), AGT(10),
AGC(9), UCU(9), UCC(10), UCA(9), UCG(7), AGU(10), ACT(11),
ACC(10), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(10), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 896


Link: KX839249.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
ATA(9), AUU(11), AUC(8), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(9), CTA(10), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(9),
CUA(10), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(10), CCC(7), CCA(8), CCG(9), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(10), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(9), UCU(10), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(11), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(11), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),
Total Codons: 892


Link: MH061340.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(8), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
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CTC(10), CTA(12), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(12), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(8), CCU(9),
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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 898


Link: MG021452.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 894


Link: MZ325297.1
Avian coronavirus (ACoV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 884


Link: KM213963.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Link: KJ645647.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 900


Link: KJ645703.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 899


Link: KU900740.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
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Total Codons: 890


Link: MN654993.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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Total Codons: 910


Link: MW545527.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
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CUA(10), CUG(9), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
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GTG(9), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 899


Link: KJ713295.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
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GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
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Total Codons: 913


Link: MH432120.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: LC215871.1
Ferret coronavirus
Codon (Counts):
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TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),
Total Codons: 889


Link: KX154687.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(9), GGU(9), CAT(9), CAC(11), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
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AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
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TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 905


Link: KX534205.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 891


Link: MN654979.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
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Total Codons: 910


Link: KT253327.1
Camel alphacoronavirus Camel229E
Codon (Counts):
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TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 886


Link: KY967357.1
Human coronavirus 229E
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 884


Link: MN690611.1
Bottlenose dolphin coronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(8), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(11), TGC(8),
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Total Codons: 899


Link: KM027261.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(11),
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GTG(10), GUU(11), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 900


Link: KT368836.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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Total Codons: 912


Link: GQ504725.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 880


Link: LC063823.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 896


Link: MK462245.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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Total Codons: 912


Link: KF600612.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
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TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 901


Link: KJ645658.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 899


Link: KT368877.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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Total Codons: 910


Link: KR265808.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 905


Link: KR265844.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
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Link: KT374055.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 903


Link: KJ650295.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(11), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(11), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
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Link: MN306018.1
Human coronavirus NL63 (HCoV-NL63)
Codon (Counts):
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Link: KT323979.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: LC634083.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Link: MK581203.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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GTG(10), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
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Total Codons: 895


Link: KX259250.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
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GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
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Total Codons: 881


Link: MH243319.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 890


Link: HM245924.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
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CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(8), CGA(7), CGG(8), AGA(8),
AGG(9), CGU(8), TCT(9), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(10), UCU(9), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(11), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(11), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(11), UAU(10), UAC(11),
Total Codons: 885


Link: MK071622.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(9),
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Link: KY420075.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
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AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(8), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 893


Link: LC063838.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(10), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
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CAA(11), CAG(8), CGT(9), CGC(10), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
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GTG(10), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
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Total Codons: 896


Link: KU982981.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
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GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 889


Link: MH061342.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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AGC(9), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 896


Link: MF598680.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: MW792511.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(11),
UGU(9), UGC(11), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
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GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
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Total Codons: 889


Link: MW165329.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(11), UGG(11),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 900


Link: KY581690.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 913


Link: MK581208.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Total Codons: 898


Link: MZ325299.1
Avian coronavirus (ACoV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 882


Link: MG912608.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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Total Codons: 908


Link: KX364290.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 883


Link: KX247128.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
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AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
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ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 881


Link: MG757595.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
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CAA(8), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(9), CGG(8), AGA(9),
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Total Codons: 908


Link: MK651076.1
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(9),
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GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(9), ATC(10),
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CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(7), AGA(10),
AGG(9), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(8), UCU(11), UCC(10), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(10), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 883


Link: KR265831.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
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GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
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CUA(10), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
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GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 905


Link: MN655001.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
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CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: LC216914.1
Coronavirus HKU15
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(8), TGC(9),
UGU(8), UGC(9), GAT(9), GAC(10), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(10), AUU(10), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(10), CTT(10),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(9), CUU(10), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(7), AUG(7), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(9), CCC(9), CCA(10), CCG(9), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(11), TCC(10), TCA(9), TCG(7), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(9), UCG(7), AGU(10), ACT(9),
ACC(10), ACA(9), ACG(7), ACU(9), GTT(10), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(8), UGG(8),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 869

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