Thursday, December 1, 2022

appendix v-200

This is an appendix to: On The Origin of The Containment Entity - 2


Link: MK032691.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(6), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 888

Link: MG812377.1
Sparrow deltacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(11), GCC(9), GCA(8), GCG(9), GCU(11), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(8), GAG(7),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(9), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(9), ATC(9),
ATA(8), AUU(9), AUC(9), AUA(8), AAA(7), AAG(8), CTT(12),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(12), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(7), AUG(7), AAT(9),
AAC(8), AAU(9), CCT(10), CCC(9), CCA(10), CCG(10), CCU(10),
CAA(8), CAG(10), CGT(10), CGC(10), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
AGG(10), CGU(10), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(10), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(10), AGU(9), ACT(9),
ACC(11), ACA(9), ACG(8), ACU(9), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),
Total Codons: 884

Link: KF600652.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(11),
UGU(10), UGC(11), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(9), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(10), ATC(8),
ATA(10), AUU(10), AUC(8), AUA(10), AAA(10), AAG(9), CTT(12),
CTC(10), CTA(9), CTG(10), TTA(11), TTG(12), CUU(12), CUC(10),
CUA(9), CUG(10), UUA(11), UUG(12), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(9), CCC(8), CCA(8), CCG(8), CCU(9),
CAA(9), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(9), CGG(9), AGA(9),
AGG(9), CGU(10), TCT(10), TCC(8), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(8), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(11), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(11), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 905

Link: KP868573.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(8), GAG(8),
TTT(9), TTC(9), UUU(9), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(11), CAC(9), CAU(11), ATT(9), ATC(9),
ATA(11), AUU(9), AUC(9), AUA(11), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(8), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(10), CUU(11), CUC(8),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(7), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(8),
AGG(9), CGU(8), TCT(8), TCC(10), TCA(9), TCG(7), AGT(9),
AGC(10), UCU(8), UCC(10), UCA(9), UCG(7), AGU(9), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(10), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 876

Link: MW351624.1
Avian coronavirus (ACoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(8), GAG(9),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(10), AAG(8), CTT(10),
CTC(9), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(9),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(10), CGU(8), TCT(9), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(9), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 882

Link: KR822424.1
European turkey coronavirus 080385d
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(9), TGT(9), TGC(9),
UGU(9), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(9), TTC(9), UUU(9), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(8), ATC(8),
ATA(9), AUU(8), AUC(8), AUA(9), AAA(10), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(9), CTG(9), TTA(10), TTG(9), CUU(10), CUC(8),
CUA(9), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(8), AUG(8), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(9),
CAA(8), CAG(9), CGT(8), CGC(8), CGA(7), CGG(9), AGA(8),
AGG(9), CGU(8), TCT(8), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(8), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),
Total Codons: 835

Link: MG912597.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912

Link: KX252783.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(11),
UGU(9), UGC(11), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(9), TTC(9), UUU(9), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(11), CUU(10), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 885

Link: MN692780.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(10),
CAA(10), CAG(9), CGT(9), CGC(9), CGA(7), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(8), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 890

Link: KT368908.1
Camel alphacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(10), GAG(9),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(9), ATC(9),
ATA(10), AUU(9), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(10), CTT(12),
CTC(9), CTA(11), CTG(9), TTA(11), TTG(10), CUU(12), CUC(9),
CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(10), AAU(9), CCT(8), CCC(6), CCA(8), CCG(8), CCU(8),
CAA(9), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(9), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(8), TCA(9), TCG(9), AGT(11),
AGC(8), UCU(11), UCC(8), UCA(9), UCG(9), AGU(11), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(11), GTA(8),
GTG(10), GUU(9), GUC(11), GUA(8), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 884

Link: KT368834.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912

Link: MF598706.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 913

Link: MG011348.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(9), GGU(9), CAT(9), CAC(11), CAU(9), ATT(10), ATC(10),
ATA(9), AUU(10), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(12),
CTC(11), CTA(9), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
CUA(9), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(9), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 907

Link: MW086529.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(10), GCU(10), TGT(12), TGC(11),
UGU(12), UGC(11), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(8), GAG(9),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(10), GGC(10), GGA(10),
GGG(9), GGU(10), CAT(10), CAC(11), CAU(10), ATT(11), ATC(9),
ATA(9), AUU(11), AUC(9), AUA(9), AAA(8), AAG(8), CTT(10),
CTC(10), CTA(10), CTG(11), TTA(9), TTG(11), CUU(10), CUC(10),
CUA(10), CUG(11), UUA(9), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(9), CCC(7), CCA(8), CCG(8), CCU(9),
CAA(9), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
AGG(9), CGU(10), TCT(11), TCC(8), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(8), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(10), ACG(8), ACU(10), GTT(12), GTC(10), GTA(10),
GTG(11), GUU(12), GUC(10), GUA(10), GUG(11), TGG(11), UGG(11),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 915

Link: KY581692.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
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ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
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Total Codons: 913

Link: JF330899.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
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Link: MN037494.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: KY799582.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Link: KJ645671.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 913

Link: KY581699.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 913

Link: JQ065048.1
Wigeon coronavirus HKU20
Codon (Counts):
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Link: KR265776.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
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Link: LR812932.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 889

Link: MK211370.1
Coronavirus BtSk-AlphaCoV/GX2018B
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(8), GCA(9), GCG(6), GCU(9), TGT(12), TGC(10),
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Total Codons: 895

Link: MF598669.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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Link: LC063846.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
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Link: KT368827.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Link: KJ645700.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 899

Link: KJ425492.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
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Total Codons: 887

Link: MH004417.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 896

Link: KJ425501.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Link: MN517816.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Alphacoronavirus sp.
Codon (Counts):
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Link: MK564474.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Link: KX077987.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Total Codons: 882

Link: MN654992.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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Total Codons: 912

Link: MF598637.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 913

Link: KP719927.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(10), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
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GGG(7), GGU(11), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(8), ATC(10),
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CTC(10), CTA(9), CTG(11), TTA(9), TTG(9), CUU(10), CUC(10),
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Link: KX108944.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Link: MG011341.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Link: MG923479.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 907

Link: KM027255.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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CUA(9), CUG(10), UUA(11), UUG(12), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
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CAA(9), CAG(10), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(9), AGA(9),
AGG(9), CGU(9), TCT(10), TCC(8), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(8), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
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Total Codons: 903

Link: KX834352.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
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Total Codons: 870

Link: KT121572.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Link: JQ065043.2
Porcine coronavirus HKU15
Codon (Counts):
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Link: FJ904723.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Link: MT701511.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Link: KU297956.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: MK071627.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: KY007140.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: KM089829.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: JX503060.1
Human coronavirus 229E
Codon (Counts):
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
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Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Feline coronavirus
Codon (Counts):
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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Link: MK558089.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: MW532107.1
Human coronavirus 229E
Codon (Counts):
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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: KX302875.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Link: EU420138.1
Miniopterus bat coronavirus 1
Codon (Counts):
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
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Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(8),
ATA(9), AUU(10), AUC(8), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 889

Link: MT820627.1
Lucheng Rn rat coronavirus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(10),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(11), GGC(8), GGA(9),
GGG(10), GGU(11), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(9), AAG(10), CTT(10),
CTC(9), CTA(10), CTG(9), TTA(10), TTG(9), CUU(10), CUC(9),
CUA(10), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(8), AUG(8), AAT(8),
AAC(9), AAU(8), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(8), CGT(10), CGC(9), CGA(9), CGG(10), AGA(9),
AGG(10), CGU(10), TCT(11), TCC(10), TCA(8), TCG(10), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(10), UCA(8), UCG(10), AGU(9), ACT(9),
ACC(9), ACA(9), ACG(10), ACU(9), GTT(10), GTC(11), GTA(10),
GTG(10), GUU(10), GUC(11), GUA(10), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 896

Link: KU893862.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(10), CTA(12), CTG(9), TTA(9), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(12), CUG(9), UUA(9), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(10),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(10), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 890

Link: KX236009.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 881

Link: MK581205.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(8), GCC(10), GCA(10), GCG(8), GCU(8), TGT(9), TGC(9),
UGU(9), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(10), GAG(9),
TTT(9), TTC(8), UUU(9), UUC(8), GGT(11), GGC(10), GGA(11),
GGG(10), GGU(11), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(9), ATC(9),
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CTC(8), CTA(9), CTG(9), TTA(9), TTG(8), CUU(8), CUC(8),
CUA(9), CUG(9), UUA(9), UUG(8), ATG(9), AUG(9), AAT(8),
AAC(10), AAU(8), CCT(9), CCC(8), CCA(10), CCG(7), CCU(9),
CAA(10), CAG(11), CGT(8), CGC(8), CGA(7), CGG(9), AGA(11),
AGG(12), CGU(8), TCT(7), TCC(8), TCA(8), TCG(7), AGT(9),
AGC(10), UCU(7), UCC(8), UCA(8), UCG(7), AGU(9), ACT(9),
ACC(9), ACA(10), ACG(10), ACU(9), GTT(8), GTC(8), GTA(10),
GTG(10), GUU(8), GUC(8), GUA(10), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 854

Link: MG837133.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(6), GCA(8), GCG(6), GCU(9), TGT(7), TGC(8),
UGU(7), UGC(8), GAT(8), GAC(6), GAU(8), GAA(6), GAG(8),
TTT(8), TTC(7), UUU(8), UUC(7), GGT(6), GGC(6), GGA(6),
GGG(6), GGU(6), CAT(7), CAC(7), CAU(7), ATT(9), ATC(7),
ATA(7), AUU(9), AUC(7), AUA(7), AAA(7), AAG(6), CTT(8),
CTC(9), CTA(8), CTG(7), TTA(9), TTG(8), CUU(8), CUC(9),
CUA(8), CUG(7), UUA(9), UUG(8), ATG(9), AUG(9), AAT(7),
AAC(7), AAU(7), CCT(8), CCC(7), CCA(7), CCG(6), CCU(8),
CAA(7), CAG(7), CGT(7), CGC(6), CGA(6), CGG(7), AGA(6),
AGG(5), CGU(7), TCT(9), TCC(7), TCA(7), TCG(8), AGT(7),
AGC(8), UCU(9), UCC(7), UCA(7), UCG(8), AGU(7), ACT(7),
ACC(8), ACA(7), ACG(6), ACU(7), GTT(8), GTC(7), GTA(5),
GTG(6), GUU(8), GUC(7), GUA(5), GUG(6), TGG(6), UGG(6),
TAT(7), TAC(8), UAU(7), UAC(8),
Total Codons: 688

Link: KP719932.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(10), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(9), GAG(9),
TTT(9), TTC(10), UUU(9), UUC(10), GGT(11), GGC(10), GGA(9),
GGG(7), GGU(11), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(8), ATC(10),
ATA(8), AUU(8), AUC(10), AUA(8), AAA(10), AAG(10), CTT(10),
CTC(10), CTA(9), CTG(11), TTA(9), TTG(9), CUU(10), CUC(10),
CUA(9), CUG(11), UUA(9), UUG(9), ATG(10), AUG(10), AAT(8),
AAC(9), AAU(8), CCT(9), CCC(8), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(9), CGT(10), CGC(9), CGA(9), CGG(8), AGA(9),
AGG(10), CGU(10), TCT(11), TCC(8), TCA(10), TCG(9), AGT(8),
AGC(10), UCU(11), UCC(8), UCA(10), UCG(9), AGU(8), ACT(10),
ACC(10), ACA(9), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(10),
GTG(12), GUU(9), GUC(10), GUA(10), GUG(12), TGG(11), UGG(11),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 900

Link: MH061341.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 889

Link: KT368915.1
Camel alphacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(10), GAG(9),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(9), ATC(9),
ATA(10), AUU(9), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(10), CTT(12),
CTC(9), CTA(11), CTG(9), TTA(11), TTG(10), CUU(12), CUC(9),
CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(10), AAU(9), CCT(8), CCC(6), CCA(8), CCG(8), CCU(8),
CAA(9), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(9), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(8), TCA(9), TCG(9), AGT(11),
AGC(8), UCU(11), UCC(8), UCA(9), UCG(9), AGU(11), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(11), GTA(8),
GTG(10), GUU(9), GUC(11), GUA(8), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 884

Link: KX252782.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(11), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(10), CUC(8),
CUA(11), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(11),
AAC(9), AAU(11), CCT(10), CCC(9), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 883

Link: MG011358.2
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(9), GGU(9), CAT(9), CAC(11), CAU(9), ATT(10), ATC(10),
ATA(9), AUU(10), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(12),
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CUA(9), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
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GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 907

Link: KJ645669.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(8),
ATA(8), AUU(10), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(12),
CTC(11), CTA(11), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
CUA(11), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
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ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 899

Link: MT226605.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912

Link: KT368855.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
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ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(8), UAU(10), UAC(8),
Total Codons: 910

Link: KJ473795.1
BtMf-AlphaCoV/AH2011
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(8),
ATA(10), AUU(10), AUC(8), AUA(10), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(9), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(9),
CAA(10), CAG(9), CGT(9), CGC(7), CGA(8), CGG(8), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(10), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(8), UCU(10), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(12),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(12), GTT(9), GTC(10), GTA(9),
GTG(10), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(11), UAU(10), UAC(11),
Total Codons: 893

Link: KY407557.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(11), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(8),
CUA(11), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 882

Link: MF769429.1
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(9),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(8), GGC(8), GGA(8),
GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(9), ATC(10),
ATA(9), AUU(9), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(9), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(9), CUU(11), CUC(9),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(9), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(8), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(8),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(7), AGA(10),
AGG(9), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(8), UCU(11), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(10), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 879

Link: KT368889.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912

Link: MH891589.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 889

Link: KX998969.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(8), TGC(9),
UGU(8), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(9), TTC(10), UUU(9), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(9), GGU(9), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(10), ATC(9),
ATA(10), AUU(10), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(9), CTT(9),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(9), CUU(9), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(9), CCC(9), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(11), TCC(10), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(9),
ACC(10), ACA(10), ACG(7), ACU(9), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 869

Link: MH779857.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(10), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(10), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(10), ATC(8),
ATA(10), AUU(10), AUC(8), AUA(10), AAA(10), AAG(8), CTT(11),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(11), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(11), CCG(8), CCU(10),
CAA(10), CAG(10), CGT(9), CGC(9), CGA(7), CGG(9), AGA(9),
AGG(9), CGU(9), TCT(9), TCC(10), TCA(9), TCG(7), AGT(10),
AGC(9), UCU(9), UCC(10), UCA(9), UCG(7), AGU(10), ACT(11),
ACC(10), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(10), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 896

Link: MN655012.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(9), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(10), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(10), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 910

Link: NC_010646.1
Beluga whale coronavirus SW1
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(8), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(11), TGC(8),
UGU(11), UGC(8), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(9), GAG(9),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(10), GGC(9), GGA(9),
GGG(9), GGU(10), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(9), AAG(8), CTT(10),
CTC(9), CTA(9), CTG(9), TTA(10), TTG(11), CUU(10), CUC(9),
CUA(9), CUG(9), UUA(10), UUG(11), ATG(7), AUG(7), AAT(11),
AAC(10), AAU(11), CCT(10), CCC(10), CCA(9), CCG(9), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(9), CGA(9), CGG(9), AGA(9),
AGG(9), CGU(9), TCT(9), TCC(9), TCA(10), TCG(10), AGT(9),
AGC(8), UCU(9), UCC(9), UCA(10), UCG(10), AGU(9), ACT(9),
ACC(10), ACA(10), ACG(9), ACU(9), GTT(10), GTC(9), GTA(8),
GTG(11), GUU(10), GUC(9), GUA(8), GUG(11), TGG(10), UGG(10),
TAT(11), TAC(9), UAU(11), UAC(9),
Total Codons: 900

Link: KX236012.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(9), TGC(11),
UGU(9), UGC(11), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(11), CTG(10), TTA(11), TTG(11), CUU(10), CUC(8),
CUA(11), CUG(10), UUA(11), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 886

Link: KX252776.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(10), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(11),
AAC(9), AAU(11), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(8), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(8), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(9), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 881

Link: KC667074.1
Human betacoronavirus 2c England-Qatar/2012
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 913
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