appendix v-2000

This is an appendix to: On The Origin of The Containment Entity - 2

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Link: KM586818.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(11),
UGU(9), UGC(11), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(8), CAC(10), CAU(8), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(10), CTG(11), TTA(11), TTG(11), CUU(10), CUC(8),
CUA(10), CUG(11), UUA(11), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(11), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(11), TAC(10), UAU(11), UAC(10),

Total Codons: 889

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Link: KY063618.2
Canine coronavirus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(9), TGT(9), TGC(9),
UGU(9), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(12), GAG(10),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(8), CAC(10), CAU(8), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(11), AAG(9), CTT(10),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(9), TTG(11), CUU(10), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(9), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(12), AAU(10), CCT(9), CCC(8), CCA(11), CCG(8), CCU(9),
CAA(11), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(10), CGG(9), AGA(9),
AGG(10), CGU(9), TCT(10), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(9), UCU(10), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(10), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(9),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(11), TAC(8), UAU(11), UAC(8),

Total Codons: 903

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Link: KJ473797.1
BtMf-AlphaCoV/GD2012
Codon (Counts):

GCT(8), GCC(9), GCA(9), GCG(10), GCU(8), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(9), GAC(11), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(9), TTC(9), UUU(9), UUC(9), GGT(10), GGC(9), GGA(8),
GGG(8), GGU(10), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(9), ATC(11),
ATA(10), AUU(9), AUC(11), AUA(10), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(9), CCC(9), CCA(10), CCG(9), CCU(9),
CAA(8), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(10), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(10), TCC(10), TCA(9), TCG(9), AGT(9),
AGC(8), UCU(10), UCC(10), UCA(9), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(8), ACG(10), ACU(11), GTT(11), GTC(9), GTA(9),
GTG(9), GUU(11), GUC(9), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 895

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Link: MK052676.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 913

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Link: MN758606.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 912

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Link: KF650373.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 889

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Link: MH726397.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 893

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Link: KT861627.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(9), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(12),
CTC(11), CTA(9), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
CUA(9), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(9), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),

Total Codons: 905

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Link: MT460496.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(11), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(8),
CUA(11), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(11),
AAC(9), AAU(11), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(8), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(8), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),

Total Codons: 882

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Link: KR265854.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(8), GCG(9), GCU(10), TGT(8), TGC(10),
UGU(8), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(10), CAU(10), ATT(11), ATC(10),
ATA(9), AUU(11), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(10),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(11), TTG(9), CUU(10), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(9), ATG(7), AUG(7), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(10), CCC(10), CCA(10), CCG(9), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(8),
AGG(10), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(9), TCG(8), AGT(11),
AGC(9), UCU(11), UCC(10), UCA(9), UCG(8), AGU(11), ACT(8),
ACC(10), ACA(9), ACG(7), ACU(8), GTT(10), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),

Total Codons: 880

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Link: MT226601.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 912

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Link: MG011345.2
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(9), GGU(9), CAT(9), CAC(11), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(12),
CTC(11), CTA(9), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
CUA(9), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(9), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),

Total Codons: 907

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Link: MF598676.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 913

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Link: MG366880.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
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CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
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AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 912

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Link: MN199463.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(10), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(8), GAC(8), GAU(8), GAA(8), GAG(8),
TTT(9), TTC(10), UUU(9), UUC(10), GGT(11), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(11), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(10), ATC(8),
ATA(9), AUU(10), AUC(8), AUA(9), AAA(10), AAG(8), CTT(11),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(10), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(9),
AAC(10), AAU(9), CCT(11), CCC(8), CCA(10), CCG(9), CCU(11),
CAA(9), CAG(11), CGT(8), CGC(8), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
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AGC(9), UCU(9), UCC(10), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(10),
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Total Codons: 891

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Link: KX348117.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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Total Codons: 886

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Link: MF598648.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 912

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Link: GQ504720.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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Link: LC063835.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 912

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Link: MN654985.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 911

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Link: MK841494.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
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AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(11),
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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
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Total Codons: 899

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Link: KR011756.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 888

---

Link: MG912596.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
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Total Codons: 912

---

Link: KJ645645.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 897

---

Link: MH004414.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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ACC(9), ACA(10), ACG(7), ACU(10), GTT(11), GTC(10), GTA(8),
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Total Codons: 896

---

Link: KJ778615.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
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CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 890

---

Link: MF737355.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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Total Codons: 893

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Link: KC461236.1
Feline infectious peritonitis virus
Codon (Counts):

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Total Codons: 895

---

Link: MH052689.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
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Total Codons: 889

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Link: KU893864.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 892

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Link: MH539771.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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Total Codons: 885

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Link: MG011356.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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Link: JX261936.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 896

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Link: KY793536.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 898

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Link: FJ904714.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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Total Codons: 882

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Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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Link: LC260039.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):

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---

Link: KR265773.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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Link: KY688118.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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AGC(10), UCU(10), UCC(8), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 901

---

Link: MN654987.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(10), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 910

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Link: MT239440.1
Feline coronavirus
Codon (Counts):

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CTC(10), CTA(11), CTG(8), TTA(10), TTG(10), CUU(10), CUC(10),
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Total Codons: 889

---

Link: KX443143.2
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(8), TGC(9),
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TTT(9), TTC(10), UUU(9), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
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CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
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TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),

Total Codons: 866

---

Link: MG923475.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 907

---

Link: KU851862.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
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TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),

Total Codons: 907

---

Link: MK334044.1
Human coronavirus NL63 (HCoV-NL63)
Codon (Counts):

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TAT(11), TAC(9), UAU(11), UAC(9),

Total Codons: 869

---

Link: KT368901.1
Camel alphacoronavirus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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Total Codons: 884

---

Link: KX364296.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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Total Codons: 886

---

Link: KJ769231.1
Swine deltacoronavirus OhioCVM1/2014
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(8), TGC(9),
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TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),

Total Codons: 867

---

Link: KT806049.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 905

---

Link: MZ313556.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 891

---

Link: MN987231.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
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CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
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Total Codons: 884

---

Link: MN199464.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 892

---

Link: MK330604.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(8), TGC(9),
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TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),

Total Codons: 862

---

Link: KJ158152.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 890

---

Link: MK309398.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(8), GCU(10), TGT(9), TGC(11),
UGU(9), UGC(11), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(10), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(11),
AAC(9), AAU(11), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
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TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),

Total Codons: 885

---

Link: OK078017.1
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
Codon (Counts):

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GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 883

---

Link: KJ645691.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),

Total Codons: 899

---

Link: KJ128295.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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Total Codons: 887

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Link: KX722530.1
Feline coronavirus
Codon (Counts):

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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 892

---

Link: KT368830.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 913

---

Link: KR265818.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),

Total Codons: 904

---

Link: KT368912.1
Camel alphacoronavirus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(10), GAG(9),
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TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),

Total Codons: 884

---

Link: KM242131.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 889

---

Link: MH020185.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
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AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
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GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),

Total Codons: 880

---

Link: MF598655.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
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CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 913

---

Link: KR265814.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
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GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),

Total Codons: 905

---

Link: JQ065044.1
White-eye coronavirus HKU16
Codon (Counts):

GCT(11), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(11), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(10), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
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TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),

Total Codons: 885

---

Link: KU900741.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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TAT(10), TAC(11), UAU(10), UAC(11),

Total Codons: 892

---

Link: KJ556336.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(8), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(9), GAG(8),
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TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 899

---

Link: KP790145.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(8), GCU(10), TGT(9), TGC(11),
UGU(9), UGC(11), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
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Total Codons: 889

---

Link: MN692778.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),

Total Codons: 900

---

Link: KC962433.1
Transmissible gastroenteritis virus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(8), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(9), GAG(10),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(8), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(10), ATC(10),
ATA(9), AUU(10), AUC(10), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(9), CTA(11), CTG(8), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(9),
CUA(11), CUG(8), UUA(10), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(9),
AAC(10), AAU(9), CCT(9), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(9), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(9), ACA(9), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(10),
GTG(11), GUU(9), GUC(9), GUA(10), GUG(11), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 887

---

Link: GQ504721.2
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(8), GAG(8),
TTT(9), TTC(9), UUU(9), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(8), ATC(11),
ATA(11), AUU(8), AUC(11), AUA(11), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
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CUA(11), CUG(10), UUA(11), UUG(9), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(9), CCC(8), CCA(9), CCG(7), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(9), CGU(9), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(10),
GTG(9), GUU(10), GUC(9), GUA(10), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 887

---

Link: KR153326.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(8),
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CTC(10), CTA(11), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(9), CCC(7), CCA(8), CCG(10), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(10), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),

Total Codons: 893

---

Link: KJ645652.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(8),
ATA(8), AUU(10), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(12),
CTC(11), CTA(11), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
CUA(11), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),

Total Codons: 899

---

Link: KT368848.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
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CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 912

---

Link: KT266822.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(8), TGC(9),
UGU(8), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(9), TTC(10), UUU(9), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(9), GGU(9), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(10), ATC(9),
ATA(10), AUU(10), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(9), CTT(9),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(9), CUU(9), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(9), CCC(9), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(11), TCC(10), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(9),
ACC(10), ACA(10), ACG(7), ACU(9), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),

Total Codons: 869

---

Link: KM347965.1
Ferret coronavirus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(8), GCA(8), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(9), GAG(10),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(9), ATC(9),
ATA(10), AUU(9), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(10), AAU(9), CCT(9), CCC(8), CCA(9), CCG(7), CCU(9),
CAA(9), CAG(8), CGT(10), CGC(8), CGA(7), CGG(7), AGA(8),
AGG(8), CGU(10), TCT(10), TCC(9), TCA(10), TCG(8), AGT(11),
AGC(11), UCU(10), UCC(9), UCA(10), UCG(8), AGU(11), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(11),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(11), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),

Total Codons: 887

---

Link: MF113046.1
Alphacoronavirus Mink/China/1/2016
Codon (Counts):

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UGU(11), UGC(10), GAT(9), GAC(7), GAU(9), GAA(8), GAG(9),
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GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(10), ATC(8),
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CTC(10), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(10), AAU(9), CCT(9), CCC(8), CCA(10), CCG(8), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(11), CGC(8), CGA(7), CGG(7), AGA(8),
AGG(9), CGU(11), TCT(10), TCC(8), TCA(10), TCG(8), AGT(10),
AGC(10), UCU(10), UCC(8), UCA(10), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
ACC(10), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(11),
GTG(11), GUU(9), GUC(10), GUA(11), GUG(11), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),

Total Codons: 894

---

Link: MK472067.1
Alphacoronavirus sp.
Codon (Counts):

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UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(10), GAG(11),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(8), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(10), AUU(10), AUC(9), AUA(10), AAA(11), AAG(11), CTT(10),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(10), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(7), AGA(11),
AGG(9), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(8), UCU(11), UCC(10), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 888

---

Link: LC364342.1
Falcon coronavirus UAE-HKU27
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(10), GAU(9), GAA(7), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(8), GGA(8),
GGG(9), GGU(9), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(10), AUU(10), AUC(9), AUA(10), AAA(11), AAG(10), CTT(10),
CTC(9), CTA(10), CTG(8), TTA(9), TTG(10), CUU(10), CUC(9),
CUA(10), CUG(8), UUA(9), UUG(10), ATG(7), AUG(7), AAT(9),
AAC(10), AAU(9), CCT(9), CCC(8), CCA(10), CCG(9), CCU(9),
CAA(12), CAG(9), CGT(7), CGC(10), CGA(9), CGG(7), AGA(7),
AGG(9), CGU(7), TCT(8), TCC(10), TCA(9), TCG(9), AGT(10),
AGC(9), UCU(8), UCC(10), UCA(9), UCG(9), AGU(10), ACT(9),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(9), GTT(11), GTC(8), GTA(9),
GTG(10), GUU(11), GUC(8), GUA(9), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 871

---

Link: KX900398.1
Transmissible gastroenteritis virus
Codon (Counts):

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GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(10), ATC(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 888

---

Link: MT438699.1
Human coronavirus 229E
Codon (Counts):

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AGC(8), UCU(12), UCC(8), UCA(10), UCG(8), AGU(10), ACT(9),
ACC(8), ACA(10), ACG(8), ACU(9), GTT(10), GTC(10), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(10), GUA(9), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),

Total Codons: 886

---

Link: KT374054.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(11), CTA(10), CTG(9), TTA(10), TTG(12), CUU(11), CUC(11),
CUA(10), CUG(9), UUA(10), UUG(12), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(9), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 903

---

Link: AY994055.1
Feline infectious peritonitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(11), TGC(9),
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ATA(9), AUU(10), AUC(8), AUA(9), AAA(10), AAG(11), CTT(10),
CTC(10), CTA(11), CTG(8), TTA(10), TTG(10), CUU(10), CUC(10),
CUA(11), CUG(8), UUA(10), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(9),
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GTG(11), GUU(9), GUC(10), GUA(10), GUG(11), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 895

---

Link: KR265780.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
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GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
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AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(11), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),

Total Codons: 905

---

Link: KX580953.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 894

---

Link: MN315264.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(11), GAC(9), GAU(11), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(8), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(8), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(8), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 890

---

Link: MH310912.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(9), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(9), CTT(12),
CTC(11), CTA(9), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
CUA(9), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(9), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 909

---

Link: KX375805.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(9), TTC(9), UUU(9), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(10),
ATA(11), AUU(11), AUC(10), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(10), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(10),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(7), CGG(8), AGA(10),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),

Total Codons: 885

---

Link: KJ425509.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(11), GAC(9), GAU(11), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(8), CTA(11), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(8),
CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 888

---

Link: MF769442.1
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(9),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(8), GGC(8), GGA(8),
GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(9), ATC(10),
ATA(9), AUU(9), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(9), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(9), CUU(11), CUC(9),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(9), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(8), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(8),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(7), AGA(10),
AGG(9), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(8), UCU(11), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(10), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 879

---

Link: JQ023161.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(10),
ATA(9), AUU(10), AUC(10), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 894

---

Link: KT029139.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 912

---

Link: KJ156952.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(12), TTC(9), UUU(12), UUC(9), GGT(10), GGC(10), GGA(9),
GGG(9), GGU(10), CAT(10), CAC(10), CAU(10), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(9), CTA(9), CTG(10), TTA(12), TTG(11), CUU(11), CUC(9),
CUA(9), CUG(10), UUA(12), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(9), CCC(8), CCA(8), CCG(8), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(9), AGA(8),
AGG(9), CGU(9), TCT(10), TCC(8), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(8), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(10), GTT(10), GTC(9), GTA(10),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(10), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 903

---

Link: KT021228.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 894

---

Link: KP890336.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 893