appendix v-1

This is an appendix to: On The Origin of The Containment Entity - 2

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Link: KR265770.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
ATA(8), AUU(11), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(11), CTA(10), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(11), CUC(11),
CUA(10), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(11), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(11), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),

Total Codons: 905

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Link: MH726384.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(8), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(12), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(12), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(10), CCC(7), CCA(8), CCG(9), CCU(10),
CAA(10), CAG(9), CGT(9), CGC(9), CGA(7), CGG(8), AGA(11),
AGG(8), CGU(9), TCT(12), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(9), UCU(12), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(9), ACA(9), ACG(7), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 900

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Link: KM609206.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 894

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Link: MF769437.1
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(9),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(8), GGC(8), GGA(8),
GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(9), ATC(10),
ATA(9), AUU(9), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(9), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(9), CUU(11), CUC(9),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(9), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(8), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(8),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(7), AGA(10),
AGG(9), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(8), UCU(11), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(10), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 879

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Link: MH726387.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(8), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(12), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(12), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(10), CCC(7), CCA(8), CCG(9), CCU(10),
CAA(10), CAG(9), CGT(9), CGC(9), CGA(7), CGG(8), AGA(11),
AGG(8), CGU(9), TCT(12), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(9), UCU(12), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(9), ACA(9), ACG(7), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 900

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Link: GQ427175.1
Turkey coronavirus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(11), GAC(8), GAU(11), GAA(8), GAG(8),
TTT(9), TTC(9), UUU(9), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(8), CTA(11), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(8),
CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(7), CGA(8), CGG(8), AGA(10),
AGG(9), CGU(9), TCT(9), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(9), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),

Total Codons: 884

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Link: KX252787.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(9), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(9),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(8), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(8), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),

Total Codons: 881

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Link: MF598673.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 913

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Link: LC063812.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(10), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
ATA(8), AUU(11), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(10),
CTC(9), CTA(10), CTG(10), TTA(9), TTG(10), CUU(10), CUC(9),
CUA(10), CUG(10), UUA(9), UUG(10), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(10), CCG(10), CCU(10),
CAA(11), CAG(8), CGT(9), CGC(10), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
AGG(8), CGU(9), TCT(9), TCC(11), TCA(9), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(9), UCC(11), UCA(9), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(10), GTT(9), GTC(11), GTA(9),
GTG(10), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),

Total Codons: 896

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Link: MK211369.1
Coronavirus BtSk-AlphaCoV/GX2018A
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(8), GCA(9), GCG(6), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(8), GGA(8),
GGG(8), GGU(9), CAT(8), CAC(9), CAU(8), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(9), CTA(11), CTG(9), TTA(11), TTG(10), CUU(11), CUC(9),
CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(9), CCC(7), CCA(8), CCG(8), CCU(9),
CAA(10), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(7), AGA(10),
AGG(9), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(9),
GTG(10), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(11), TAC(9), UAU(11), UAC(9),

Total Codons: 888

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Link: MT490315.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(8), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(10), CAC(7), CAU(10), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(11), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(8), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 890

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Link: NC_028806.1
Swine enteric coronavirus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(8), GCA(8), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(10), GAG(10),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(8), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(10), ATC(10),
ATA(9), AUU(10), AUC(10), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(10),
CTC(10), CTA(11), CTG(8), TTA(10), TTG(10), CUU(10), CUC(10),
CUA(11), CUG(8), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(10), AAU(9), CCT(9), CCC(8), CCA(8), CCG(7), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(9), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(9), AGT(11),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(9), AGU(11), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(10),
GTG(11), GUU(9), GUC(9), GUA(10), GUG(11), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 884

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Link: MT490316.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(8), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(8), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 889

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Link: MN611521.1
Scotophilus kuhlii bat coronavirus 512-related
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(8), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(11), GAC(8), GAU(11), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(8), GGA(8),
GGG(8), GGU(9), CAT(8), CAC(9), CAU(8), ATT(10), ATC(10),
ATA(10), AUU(10), AUC(10), AUA(10), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(8), TTA(10), TTG(9), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(8), UUA(10), UUG(9), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(9), CCC(8), CCA(8), CCG(8), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(7), AGA(9),
AGG(9), CGU(9), TCT(12), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(8), UCU(12), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(12), TAC(9), UAU(12), UAC(9),

Total Codons: 881

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Link: MF598704.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 913

---

Link: KX064280.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
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AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 890

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Link: EU022526.1
Turkey coronavirus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
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CTC(9), CTA(12), CTG(9), TTA(10), TTG(11), CUU(10), CUC(9),
CUA(12), CUG(9), UUA(10), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(7), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(8), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(7), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(7), AGU(9), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),

Total Codons: 885

---

Link: JQ989270.1
Rousettus bat coronavirus HKU10
Codon (Counts):

GCT(8), GCC(8), GCA(9), GCG(9), GCU(8), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(10), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
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GGG(9), GGU(9), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(11), ATC(9),
ATA(8), AUU(11), AUC(9), AUA(8), AAA(9), AAG(9), CTT(10),
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CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(10), AUG(10), AAT(9),
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GTG(11), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(11), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 891

---

Link: KX512809.1
Ferret enteric coronavirus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
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GGG(7), GGU(9), CAT(11), CAC(9), CAU(11), ATT(10), ATC(9),
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CTC(10), CTA(11), CTG(8), TTA(11), TTG(9), CUU(10), CUC(10),
CUA(11), CUG(8), UUA(11), UUG(9), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(9), CCC(6), CCA(10), CCG(8), CCU(9),
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AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(10), UCG(8), AGU(11), ACT(9),
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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(8), UGG(8),
TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),

Total Codons: 889

---

Link: KT368869.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 909

---

Link: MN655011.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 912

---

Link: KF958702.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(11), GAG(8),
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GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
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CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(10), TTG(11), CUU(12), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
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AGC(11), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 909

---

Link: MF598679.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
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CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
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AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 913

---

Link: MW030108.1
Feline coronavirus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(8), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(11), TGC(9),
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GTG(11), GUU(9), GUC(10), GUA(10), GUG(11), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 889

---

Link: MF598691.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 912

---

Link: MF598644.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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Total Codons: 913

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Link: MN611525.1
Hipposideros pomona bat coronavirus CHB25
Codon (Counts):

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Total Codons: 896

---

Link: KJ156949.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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AAC(10), AAU(10), CCT(9), CCC(8), CCA(8), CCG(8), CCU(9),
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AGG(9), CGU(9), TCT(10), TCC(8), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(8), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 903

---

Link: KP118890.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(8), TCG(8), AGT(9),
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Total Codons: 877

---

Link: KJ650098.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 911

---

Link: KJ425495.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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Total Codons: 887

---

Link: JQ088078.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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Total Codons: 896

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Link: NC_016994.1
Night heron coronavirus HKU19
Codon (Counts):

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Total Codons: 878

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Link: KX839251.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 890

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Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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Total Codons: 881

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Link: MW532103.1
Human coronavirus 229E
Codon (Counts):

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Total Codons: 878

---

Link: JQ989268.1
Hipposideros bat coronavirus HKU10
Codon (Counts):

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Total Codons: 895

---

Link: KJ020932.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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Link: KT368878.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 912

---

Link: MG912603.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 912

---

Link: KR265856.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(8), GCG(9), GCU(10), TGT(8), TGC(10),
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Total Codons: 880

---

Link: MK032177.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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Total Codons: 878

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Link: MH687958.1
Alphacoronavirus sp.
Codon (Counts):

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Total Codons: 898

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Link: KM975738.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
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Total Codons: 890

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Link: MK720946.1
Rhinolophus bat coronavirus HKU32
Codon (Counts):

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Total Codons: 898

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Link: MG448607.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 877

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Link: KT852992.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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Total Codons: 887

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Link: MK953937.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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Total Codons: 889

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Link: MG546690.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 897

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Link: KX259255.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
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Total Codons: 885

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Link: KJ645646.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(8),
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CTC(11), CTA(11), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
CUA(11), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
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Total Codons: 900

---

Link: MF598617.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
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AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 912

---

Link: MF598714.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
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GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
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ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 912

---

Link: KX219794.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
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Total Codons: 881

---

Link: JN634064.1
Feline coronavirus
Codon (Counts):

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TAT(10), TAC(8), UAU(10), UAC(8),

Total Codons: 891

---

Link: MK071629.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
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ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(10), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 889

---

Link: MF598657.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
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CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 912

---

Link: MF769439.1
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(9),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(8), GGC(8), GGA(8),
GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(9), ATC(10),
ATA(9), AUU(9), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(9), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(9), CUU(11), CUC(9),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(9), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(8), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(8),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(7), AGA(10),
AGG(9), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(8), UCU(11), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(10), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 879

---

Link: MK032179.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(11),
UGU(9), UGC(11), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(9), UUU(11), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(9), CTA(10), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(10), CUC(9),
CUA(10), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
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CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
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Total Codons: 888

---

Link: KX108938.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(11), CTA(10), CTG(9), TTA(10), TTG(11), CUU(11), CUC(11),
CUA(10), CUG(9), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(9), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 902

---

Link: MF769422.1
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(9),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(8), GGC(8), GGA(8),
GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(9), ATC(10),
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CTC(9), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(9), CUU(11), CUC(9),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(9), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(8), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(8),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(7), AGA(10),
AGG(9), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(8), UCU(11), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(10), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 879

---

Link: MF769434.1
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(9),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(8), GGC(8), GGA(8),
GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(9), ATC(10),
ATA(9), AUU(9), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(9), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(9), CUU(11), CUC(9),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(9), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(8), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(8),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(7), AGA(10),
AGG(9), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(8), UCU(11), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(10), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 879

---

Link: KJ645675.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(8),
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CTC(11), CTA(11), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
CUA(11), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),

Total Codons: 899

---

Link: KT021232.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 894

---

Link: MG742313.1
Porcine enteric alphacoronavirus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(9),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(8), GGA(7),
GGG(7), GGU(9), CAT(8), CAC(9), CAU(8), ATT(9), ATC(10),
ATA(9), AUU(9), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
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CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(9), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(9), CCC(8), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
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AGG(9), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(8), UCU(11), UCC(10), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
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GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(8), UGG(8),
TAT(11), TAC(10), UAU(11), UAC(10),

Total Codons: 882

---

Link: KR265777.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
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GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
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CAA(11), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
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GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),

Total Codons: 905

---

Link: KX434788.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
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GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
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AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
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GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),

Total Codons: 882

---

Link: KY486713.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
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CTC(9), CTA(10), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(9),
CUA(10), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(10), CCC(7), CCA(8), CCG(9), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
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GTG(9), GUU(11), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),

Total Codons: 894

---

Link: MH726398.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
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CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
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GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 895

---

Link: KR265817.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
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TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),

Total Codons: 905

---

Link: KX259252.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
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Total Codons: 881

---

Link: KJ473807.1
BtRf-AlphaCoV/HuB2013
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(9), TGC(9),
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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(11), UGG(11),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 884

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Link: GQ504724.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(11), GAC(8), GAU(11), GAA(8), GAG(8),
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GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(10), ATC(10),
ATA(11), AUU(10), AUC(10), AUA(11), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
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CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 885

---

Link: MK211373.1
Coronavirus BtRs-AlphaCoV/YN2018
Codon (Counts):

GCT(8), GCC(8), GCA(9), GCG(8), GCU(8), TGT(11), TGC(9),
UGU(11), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(9), GAG(9),
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GGG(8), GGU(9), CAT(11), CAC(9), CAU(11), ATT(9), ATC(11),
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Total Codons: 902

---

Link: KM392231.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),

Total Codons: 893

---

Link: MH726362.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
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TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 898

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Link: MK039552.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 913

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Link: MF598696.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 912

---

Link: MF462814.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 893

---

Link: MN692776.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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Total Codons: 900

---

Link: KR265774.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
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GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),

Total Codons: 905

---

Link: MG546331.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
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GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 912

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Link: KY983586.1
Human coronavirus NL63 (HCoV-NL63)
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(8), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(11), TGC(9),
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GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(10), ATC(8),
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CTC(9), CTA(11), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(10), CUC(9),
CUA(11), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(11), AAU(10), CCT(9), CCC(5), CCA(8), CCG(6), CCU(9),
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AGC(8), UCU(11), UCC(9), UCA(11), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(11), GTT(10), GTC(11), GTA(9),
GTG(11), GUU(10), GUC(11), GUA(9), GUG(11), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 876

---

Link: KX683006.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
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CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 890

---

Link: KX219796.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(11),
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Total Codons: 890

---

Link: MK071631.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(10), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),

Total Codons: 890

---

Link: MT602520.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
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ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(10),
CAA(10), CAG(9), CGT(9), CGC(9), CGA(7), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(8), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),

Total Codons: 890

---

Link: KT368913.1
Camel alphacoronavirus
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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GTG(10), GUU(9), GUC(11), GUA(8), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),

Total Codons: 884

---

Link: MT843280.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(11), GAC(9), GAU(11), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(8), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(10),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(9), TTG(10), CUU(10), CUC(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),

Total Codons: 886

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Link: MN365233.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 912

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Link: MK071621.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 887

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Link: KM392225.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 896

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Link: KR265797.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
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Total Codons: 905

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Link: MG757597.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
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GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),

Total Codons: 905

---

Link: MG837011.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
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Total Codons: 896

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Link: MH004412.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 897

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Link: MG923472.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
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Total Codons: 902

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Link: KJ650296.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):

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Link: KJ645640.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):

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Total Codons: 900

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Link: DQ001338.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):

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CUA(11), CUG(9), UUA(12), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
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CAA(8), CAG(9), CGT(8), CGC(8), CGA(7), CGG(8), AGA(10),
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ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),

Total Codons: 888