Thursday, December 1, 2022

appendix v-2100

This is an appendix to: On The Origin of The Containment Entity - 2



Link: KT368829.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 913


Link: MF598694.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: KR265781.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
ATA(8), AUU(11), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(11), CTA(10), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(11), CUC(11),
CUA(10), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(11), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(11), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 905


Link: KR265801.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
ATA(8), AUU(11), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(11), CTA(10), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(11), CUC(11),
CUA(10), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(11), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(11), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 905


Link: JF828981.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(11), GAC(9), GAU(11), GAA(8), GAG(8),
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CTC(8), CTA(11), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(8),
CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(7), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(9), CGU(8), TCT(9), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(9), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 887


Link: KM015348.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(11),
UGU(10), UGC(11), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
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CUA(9), CUG(10), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
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CAA(9), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(9), CGG(8), AGA(9),
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AGC(10), UCU(10), UCC(8), UCA(9), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(11), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(11), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 906


Link: KX275391.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
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CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
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AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
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GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 881


Link: KU252649.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
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GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(10),
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CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
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AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(8), AGT(9),
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GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(11), UAU(10), UAC(11),
Total Codons: 894


Link: MK462256.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: MT387202.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
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CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(8),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
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GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 910


Link: MK357908.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(11),
UGU(10), UGC(11), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
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CAA(9), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(9), CGG(9), AGA(9),
AGG(9), CGU(10), TCT(10), TCC(8), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
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ACC(9), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(11), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(11), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 909


Link: KX252780.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(11),
UGU(10), UGC(11), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
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AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
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GTG(10), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 892


Link: MG428706.1
Human coronavirus NL63 (HCoV-NL63)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(8), GCA(10), GCG(7), GCU(9), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(7),
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GGG(7), GGU(9), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(12), ATC(8),
ATA(9), AUU(12), AUC(8), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(8),
CTC(7), CTA(11), CTG(11), TTA(10), TTG(11), CUU(8), CUC(7),
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ACC(8), ACA(9), ACG(7), ACU(9), GTT(10), GTC(11), GTA(9),
GTG(11), GUU(10), GUC(11), GUA(9), GUG(11), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 885


Link: KM027259.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(11),
UGU(10), UGC(11), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(9), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(10), ATC(8),
ATA(10), AUU(10), AUC(8), AUA(10), AAA(10), AAG(9), CTT(12),
CTC(10), CTA(9), CTG(10), TTA(11), TTG(12), CUU(12), CUC(10),
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TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 903


Link: KX252788.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(9), TTC(9), UUU(9), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(10),
ATA(11), AUU(11), AUC(10), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(9), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(9),
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Link: KT886454.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Feline coronavirus
Codon (Counts):
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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: MG197727.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Total Codons: 890


Link: LR812930.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: MW086527.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 915


Link: KF468754.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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Total Codons: 889


Link: KR061459.1
Swine enteric coronavirus
Codon (Counts):
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Link: KJ645673.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: KT368866.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Link: KP118886.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(8), GCU(10), TGT(9), TGC(11),
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Total Codons: 888


Link: KT121576.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 913


Link: MF598626.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 913


Link: MN548287.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Link: LC063819.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Link: KM609211.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: MK211371.1
Coronavirus BtSk-AlphaCoV/GX2018C
Codon (Counts):
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Link: KY929405.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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Total Codons: 892


Link: KM609204.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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Link: MN531555.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
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GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
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CUA(10), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
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Link: KY581700.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 913


Link: LC364343.1
Houbara coronavirus UAE-HKU28
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(7), GCU(10), TGT(9), TGC(9),
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Link: MG837012.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: MF598685.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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Link: MN757859.1
Avian coronavirus (ACoV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 895


Link: MW545528.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(11), CTA(10), CTG(9), TTA(10), TTG(11), CUU(11), CUC(11),
CUA(10), CUG(9), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(9), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(9), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 899


Link: MN942260.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(8), TGC(9),
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GGG(9), GGU(9), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(10), ATC(9),
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CUA(11), CUG(8), UUA(10), UUG(9), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(9), CCC(9), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(8),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(10), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(10), UCU(10), UCC(10), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(9),
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GTG(9), GUU(9), GUC(8), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 864


Link: MG757604.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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AGG(9), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
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GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 907


Link: LC063839.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(10), CCG(10), CCU(10),
CAA(11), CAG(8), CGT(9), CGC(10), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
AGG(8), CGU(9), TCT(9), TCC(11), TCA(9), TCG(9), AGT(9),
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TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 896


Link: KR265800.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
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CUA(10), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(11), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
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GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 905


Link: MN654977.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 910


Link: GU393335.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
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TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
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CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 887


Link: KJ645697.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(8),
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CTC(11), CTA(11), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
CUA(11), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 900


Link: MN690608.1
Bottlenose dolphin coronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(8), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(11), TGC(8),
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GGG(9), GGU(10), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(11), ATC(9),
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CTC(9), CTA(9), CTG(9), TTA(10), TTG(11), CUU(10), CUC(9),
CUA(9), CUG(9), UUA(10), UUG(11), ATG(7), AUG(7), AAT(11),
AAC(9), AAU(11), CCT(10), CCC(10), CCA(9), CCG(9), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(9), CGA(9), CGG(9), AGA(8),
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GTG(11), GUU(10), GUC(9), GUA(8), GUG(11), TGG(10), UGG(10),
TAT(11), TAC(9), UAU(11), UAC(9),
Total Codons: 899


Link: KU893863.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(9), GAC(10), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
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CUA(12), CUG(9), UUA(9), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
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Total Codons: 889


Link: KP719930.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(10), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
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Total Codons: 902


Link: KY581689.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 913


Link: LC063820.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(10), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
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TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 896


Link: MN655004.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: KT021229.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
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Total Codons: 894


Link: KX236002.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(11),
UGU(9), UGC(11), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(11), CUU(10), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(7), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 884


Link: MW351629.1
Avian coronavirus (ACoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(8), GAG(9),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(10), AAG(8), CTT(10),
CTC(9), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(9),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(10), CGU(8), TCT(9), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(9), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 882


Link: MN654998.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(8),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 911


Link: MK625640.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(8), TGC(9),
UGU(8), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(9), TTC(10), UUU(9), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(9), GGU(9), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(10), ATC(9),
ATA(10), AUU(10), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(10), CTT(9),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(9), CUU(9), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(9), CCC(9), CCA(10), CCG(9), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(7), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(10), TCA(9), TCG(7), AGT(10),
AGC(10), UCU(10), UCC(10), UCA(9), UCG(7), AGU(10), ACT(9),
ACC(10), ACA(10), ACG(7), ACU(9), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 866


Link: MF598634.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
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CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 913


Link: KP118885.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(11), CAC(9), CAU(11), ATT(9), ATC(9),
ATA(11), AUU(9), AUC(9), AUA(11), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(8), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(10), CUU(11), CUC(8),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(7), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(8),
AGG(9), CGU(8), TCT(8), TCC(9), TCA(9), TCG(7), AGT(9),
AGC(10), UCU(8), UCC(9), UCA(9), UCG(7), AGU(9), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(10), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 876


Link: AJ271965.2
Transmissible gastroenteritis virus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(8), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(9), GAG(10),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(8), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(10), ATC(10),
ATA(9), AUU(10), AUC(10), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(9), CTA(11), CTG(8), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(9),
CUA(11), CUG(8), UUA(10), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(9),
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CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(8), AGA(9),
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ACC(9), ACA(9), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(10),
GTG(11), GUU(9), GUC(9), GUA(10), GUG(11), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 887


Link: MH004420.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(9), TGT(9), TGC(9),
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CAA(9), CAG(10), CGT(11), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(11), TCT(11), TCC(11), TCA(8), TCG(9), AGT(10),
AGC(9), UCU(11), UCC(11), UCA(8), UCG(9), AGU(10), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(7), ACU(10), GTT(11), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(11), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(11), UGG(11),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 896


Link: MK071638.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(8),
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CUA(10), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
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CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
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ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(10), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 889


Link: KX364294.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(11), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
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GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 881


Link: MK482397.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
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AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
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TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 892


Link: MH726376.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
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AAC(9), AAU(9), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(10),
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ACC(9), ACA(9), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 895


Link: MT438698.1
Human coronavirus 229E
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(10), GAG(9),
TTT(11), TTC(9), UUU(11), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(8),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(10),
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CUA(12), CUG(8), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(10), AAU(9), CCT(8), CCC(6), CCA(8), CCG(9), CCU(8),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(11),
AGG(8), CGU(9), TCT(12), TCC(8), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(8), UCU(12), UCC(8), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(9),
ACC(8), ACA(10), ACG(9), ACU(9), GTT(10), GTC(10), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(10), GUA(9), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 885


Link: KT121577.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(9), GAG(9),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(11), GGC(10), GGA(10),
GGG(9), GGU(11), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(8), AAG(8), CTT(9),
CTC(10), CTA(10), CTG(11), TTA(9), TTG(11), CUU(9), CUC(10),
CUA(10), CUG(11), UUA(9), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(9), CCC(7), CCA(8), CCG(8), CCU(9),
CAA(10), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
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TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 913


Link: KT368861.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: KJ435286.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(9), CTA(12), CTG(9), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(9),
CUA(12), CUG(9), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(11),
AAC(9), AAU(11), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(7), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(8), CGA(7), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 884


Link: MT176422.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(11),
UGU(9), UGC(11), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(12), AUU(11), AUC(9), AUA(12), AAA(10), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(11), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(10), CUC(8),
CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(11),
AAC(9), AAU(11), CCT(10), CCC(9), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(9), TCC(10), TCA(9), TCG(7), AGT(9),
AGC(10), UCU(9), UCC(10), UCA(9), UCG(7), AGU(9), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(9), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(12), TAC(10), UAU(12), UAC(10),
Total Codons: 894


Link: MF598664.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
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CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
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AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: FJ904721.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(11), GAC(8), GAU(11), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(10), ATC(10),
ATA(11), AUU(10), AUC(10), AUA(11), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(9), CTA(11), CTG(9), TTA(11), TTG(10), CUU(11), CUC(9),
CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(7), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(8), CGA(7), CGG(8), AGA(10),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(10), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(10), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 885


Link: MN971595.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
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CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 890


Link: KJ960179.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(8), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(12), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(12), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(8), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(12), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(9), UCU(12), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 894


Link: KJ361503.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(11),
UGU(10), UGC(11), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(9), UUU(11), UUC(9), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(9), GGU(9), CAT(10), CAC(10), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
ATA(10), AUU(11), AUC(8), AUA(10), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(9), CTA(9), CTG(10), TTA(11), TTG(12), CUU(11), CUC(9),
CUA(9), CUG(10), UUA(11), UUG(12), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(9), CCC(8), CCA(8), CCG(8), CCU(9),
CAA(9), CAG(10), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(9), AGA(9),
AGG(9), CGU(9), TCT(10), TCC(8), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(8), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
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GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 899


Link: FJ904717.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(8),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
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CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(10),
AGG(9), CGU(8), TCT(9), TCC(9), TCA(10), TCG(7), AGT(9),
AGC(10), UCU(9), UCC(9), UCA(10), UCG(7), AGU(9), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(9), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 888


Link: KM027262.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(9), GAG(9),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(11), GGC(10), GGA(10),
GGG(9), GGU(11), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(11), ATC(9),
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CUA(10), CUG(11), UUA(9), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
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TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 913


Link: MZ327724.1
Guinea fowl coronavirus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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CTC(8), CTA(10), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(10), CUC(8),
CUA(10), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
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CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(8), TCC(10), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(10), UCU(8), UCC(10), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(10), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(11), TAC(10), UAU(11), UAC(10),
Total Codons: 881


Link: MN654995.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
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CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: MH715491.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(8), TGC(9),
UGU(8), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
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GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 866


Link: MN120514.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: KX034100.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: KF411040.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
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AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(10), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(10), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 886


Link: MG912599.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912


Link: KX839248.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(8), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(8), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
ATA(9), AUU(11), AUC(8), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(9), CTA(10), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(9),
CUA(10), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(10), CCC(7), CCA(8), CCG(9), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(10), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(9), UCU(10), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(11), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(11), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),
Total Codons: 890


Link: MF769420.1
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(9),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(8), GGC(8), GGA(8),
GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(9), ATC(10),
ATA(9), AUU(9), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(9), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(9), CUU(11), CUC(9),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(9), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(8), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(8),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(7), AGA(10),
AGG(9), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(8), UCU(11), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(10), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 879


Link: KF272920.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 890


Link: KM609208.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
ATA(9), AUU(11), AUC(8), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(10), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),
Total Codons: 894


Link: MT906865.1
Canine coronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(8), GCA(8), GCG(9), GCU(9), TGT(11), TGC(9),
UGU(11), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(10), GAG(10),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(8), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(9), ATC(10),
ATA(9), AUU(9), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(10),
CTC(10), CTA(11), CTG(8), TTA(10), TTG(10), CUU(10), CUC(10),
CUA(11), CUG(8), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(10), AAU(9), CCT(9), CCC(8), CCA(10), CCG(8), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(11), CGC(8), CGA(9), CGG(8), AGA(10),
AGG(9), CGU(11), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(10), AGT(10),
AGC(11), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(10), AGU(10), ACT(11),
ACC(10), ACA(9), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(11), GTA(10),
GTG(10), GUU(9), GUC(11), GUA(10), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 900


Link: KX219795.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(10), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(10), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 882


Link: MG832584.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(8), TGC(9),
UGU(8), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(9), TTC(10), UUU(9), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(9), GGU(9), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(10), ATC(9),
ATA(10), AUU(10), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(9), CTT(9),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(9), CUU(9), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(9), CCC(9), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(10), TCA(9), TCG(7), AGT(10),
AGC(10), UCU(10), UCC(10), UCA(9), UCG(7), AGU(10), ACT(9),
ACC(10), ACA(10), ACG(7), ACU(9), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 865


Link: KR265832.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
ATA(8), AUU(11), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(11), CTA(10), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(11), CUC(11),
CUA(10), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(11), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(11), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 905


Link: KT021234.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(8), TGC(9),
UGU(8), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(9), TTC(10), UUU(9), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(9), GGU(9), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(10), ATC(9),
ATA(10), AUU(10), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(9), CTT(9),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(9), CUU(9), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(9), CCC(9), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(10), TCA(9), TCG(7), AGT(10),
AGC(10), UCU(10), UCC(10), UCA(9), UCG(7), AGU(10), ACT(9),
ACC(10), ACA(10), ACG(7), ACU(9), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 865


Link: KY421673.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(11), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(12),
UGU(9), UGC(12), GAT(8), GAC(8), GAU(8), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(9), UUU(11), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(10),
ATA(10), AUU(11), AUC(10), AUA(10), AAA(10), AAG(8), CTT(11),
CTC(9), CTA(10), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(11), CUC(9),
CUA(10), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(11), CCC(9), CCA(9), CCG(8), CCU(11),
CAA(9), CAG(10), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 893

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