Friday, January 21, 2022

Appendix IITG2 RS

This is an appendix to: It's In The GenBank - 2


SARS-CoV-2 Gene Analysis (by Country, 2020-2021)

Legend:

Columns:
Country = where virus was collected;
Version = NIH GenBank Identifier;
A,C,T, and G = column of molecule type;
gene = gene number a molecule type is in;
(example: gene = '1', A column = '6445'
there are 6,445 'A' molecules in gene 1.)

Focus on changes:
Each virus per country, is compared to the
Wuhan China original SARS-CoV-2 virus. And when
the numbers don't match, the count number is bold
otherwise the molecule count matches the original.


Country Version A C T G gene number
Russia MW305250.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW305251.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW332239.1 6427 3739 6892 4231 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW332227.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW332231.1 6423 3746 6888 4232 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW332230.1 6423 3742 6893 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT635445.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT637143.1 6425 3741 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW332240.1 6424 3739 6891 4235 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 20 43 18 11

 MW332228.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW332225.1 6423 3742 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT890462.1 6424 3743 6892 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ044345.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ047312.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW332232.1 6424 3741 6893 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 315 266 277 10
35 21 42 18 11

 MW332235.1 6424 3743 6892 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 78 119 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW332229.1 6424 3745 6891 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW514307.1 6424 3742 6894 4229 1
1116 716 1264 698 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 78 119 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 315 266 277 10
35 21 42 18 11

 MW741552.1 6424 3744 6891 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 119 60 7
30 24 60 17 8
100 64 135 66 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW332238.1 6425 3739 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW332236.1 6423 3740 6896 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW332226.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
402 316 266 275 10
35 21 42 18 11

 MW332233.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 266 276 10
35 21 42 18 11

 MW332237.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 147 213 138 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW332241.1 6423 3737 6899 4230 1
1116 718 1269 703 2
224 174 277 152 3
49 44 93 41 4
169 148 212 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11
Saudi Arabia MT755883.1 6422 3740 6895 4232 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT755884.1 6423 3741 6894 4231 1
1123 724 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT755885.1 6425 3739 6896 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT755886.1 6423 3740 6895 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 278 151 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT755887.1 6425 3739 6897 4228 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT755888.1 6424 3741 6894 4230 1
1122 722 1272 705 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT755889.1 6423 3740 6896 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT755890.1 6425 3741 6893 4230 1
1123 722 1272 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 313 267 280 10
35 21 42 18 11

 MT755891.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 722 1272 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 78 119 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 313 267 280 10
35 21 42 18 11

 MT755892.1 6423 3741 6894 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MT755893.1 6424 3741 6894 4230 1
1122 722 1272 705 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT755894.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 78 119 61 7
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 MT755898.1 6424 3741 6894 4230 1
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35 21 42 18 11

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 MW266956.1 6425 3739 6899 4226 1
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35 21 42 18 11

 MW327516.1 6425 3740 6895 4229 1
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 MW327539.1 6425 3740 6895 4229 1
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 MW127520.1 6424 3741 6895 4229 1
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 MT450872.1 6424 3741 6894 4230 1
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35 21 42 18 11
Sierra Leone MT872497.1 6423 3742 6895 4229 1
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35 21 42 18 11

 MT872502.1 6424 3742 6893 4230 1
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67 26 66 26 6
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100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT872493.1 6425 3742 6893 4229 1
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35 21 42 18 11

 MT872494.1 6424 3742 6893 4230 1
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401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT872495.1 6423 3742 6893 4231 1
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35 21 42 18 11

 MT872498.1 6424 3741 6895 4229 1
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100 65 133 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 MT872499.1 6424 3740 6895 4230 1
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399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT872501.1 6425 3741 6894 4229 1
1124 723 1272 702 2
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67 27 65 26 6
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30 24 60 17 8
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 MZ411527.1 6425 3736 6900 4228 1
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 MZ411524.1 6425 3736 6900 4228 1
1122 722 1273 704 2
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 MZ411525.1 6424 3740 6894 4231 1
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35 21 42 18 11

 MZ436883.1 6425 3739 6895 4230 1
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35 21 42 18 11

 MZ436893.1 6425 3741 6894 4229 1
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 MZ436899.1 6425 3738 6896 4230 1
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 MZ436894.1 6425 3740 6893 4231 1
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 MZ436895.1 6425 3740 6894 4230 1
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35 21 42 18 11

 MZ436887.1 6424 3739 6896 4230 1
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 MZ436896.1 6425 3740 6895 4229 1
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35 21 42 18 11

 MZ436898.1 6425 3740 6894 4230 1
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 MZ436884.1 6424 3739 6897 4229 1
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35 21 42 18 11

 MZ436891.1 6425 3739 6895 4230 1
1124 723 1273 701 2
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401 315 268 275 10
35 21 42 18 11
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