Friday, January 21, 2022

Appendix IITG2 DE

This is an appendix to: It's In The GenBank - 2


SARS-CoV-2 Gene Analysis (by Country, 2020-2021)

Legend:

Columns:
Country = where virus was collected;
Version = NIH GenBank Identifier;
A,C,T, and G = column of molecule type;
gene = gene number a molecule type is in;
(example: gene = '1', A column = '6445'
there are 6,445 'A' molecules in gene 1.)

Focus on changes:
Each virus per country, is compared to the
Wuhan China original SARS-CoV-2 virus. And when
the numbers don't match, the count number is bold
otherwise the molecule count matches the original.


Country Version A C T G gene number
Denmark MZ049597.1 6425 3741 6894 4229 1
1124 722 1272 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 MT919525.1 6423 3741 6894 4231 1
1122 722 1272 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT919526.1 6423 3741 6894 4231 1
1122 722 1272 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT919527.1 6424 3741 6894 4230 1
1122 722 1272 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT919531.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 703 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 138 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT919532.1 6424 3741 6894 4230 1
1122 722 1272 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT919534.1 6424 3740 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 276 10
35 21 42 18 11

 MT919535.1 6424 3741 6894 4230 1
1122 723 1271 703 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT919536.1 6424 3741 6894 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT919529.1 6424 3741 6894 4230 1
1122 723 1272 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ049598.1 6425 3741 6893 4230 1
1115 717 1264 698 2
224 175 276 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 MT919528.1 6424 3741 6894 4230 1
1122 722 1272 703 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT919530.1 6424 3741 6894 4230 1
1122 722 1272 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT919533.1 6424 3741 6894 4230 1
1122 722 1272 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OK041529.1 6425 3738 6890 4227 1
1122 720 1267 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
106 79 119 61 7
30 24 60 17 8
24 14 30 12 9
401 316 266 276 10
35 21 42 18 11
Djibouti MZ970746.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 723 1272 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ970747.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 723 1272 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ970732.1 6423 3736 6899 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 MZ517138.1 6423 3739 6898 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ517139.1 6423 3739 6898 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ517140.1 6423 3739 6898 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ517141.1 6423 3739 6898 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ517142.1 6423 3739 6898 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ517143.1 6423 3739 6898 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ517144.1 6423 3739 6898 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ517145.1 6423 3739 6898 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ970729.1 6423 3739 6898 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ970730.1 6423 3739 6898 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ970731.1 6423 3739 6898 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ970761.1 6423 3739 6898 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ970763.1 6423 3739 6898 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ519389.1 6422 3741 6896 4230 1
1123 722 1271 705 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
23 18 54 15 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ970743.1 6422 3738 6897 4232 1
1123 724 1271 703 2
224 175 275 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 313 267 279 10
35 21 42 18 11

 MZ970749.1 6426 3738 6899 4226 1
1123 723 1272 703 2
224 174 278 151 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 62 136 67 9
399 313 267 280 10
35 21 42 18 11

 MZ970748.1 6422 3738 6897 4232 1
1123 724 1271 703 2
224 175 275 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 313 267 279 10
35 21 42 18 11

 MZ970751.1 6422 3738 6897 4232 1
1123 724 1271 703 2
224 175 275 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 313 267 279 10
35 21 42 18 11

 MZ970742.1 6422 3738 6897 4232 1
1123 724 1271 703 2
224 175 275 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
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35 21 42 18 11

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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT655135.1 6424 3743 6892 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
171 146 213 138 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW375730.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11
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