Friday, January 21, 2022

Appendix IITG2 FG

This is an appendix to: It's In The GenBank - 2


SARS-CoV-2 Gene Analysis (by Country, 2020-2021)

Legend:

Columns:
Country = where virus was collected;
Version = NIH GenBank Identifier;
A,C,T, and G = column of molecule type;
gene = gene number a molecule type is in;
(example: gene = '1', A column = '6445'
there are 6,445 'A' molecules in gene 1.)

Focus on changes:
Each virus per country, is compared to the
Wuhan China original SARS-CoV-2 virus. And when
the numbers don't match, the count number is bold
otherwise the molecule count matches the original.


Country Version A C T G gene number
Finland MT020781.2 6424 3744 6891 4230 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW718191.1 6424 3744 6891 4230 1
1118 718 1269 701 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW718192.1 6424 3744 6891 4230 1
1118 718 1269 701 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW718193.1 6424 3744 6891 4230 1
1118 718 1269 701 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW718194.1 6424 3744 6891 4230 1
1118 718 1269 701 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ683495.1 6424 3744 6891 4230 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ934691.1 6424 3744 6891 4230 1
1118 718 1269 701 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW717675.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 175 275 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ683496.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 175 275 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ934692.1 6424 3742 6893 4230 1
1117 718 1269 702 2
224 175 275 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ683497.1 6423 3742 6893 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ683498.1 6424 3742 6894 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 MW718188.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW718189.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW718190.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ962407.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW717676.1 6423 3740 6894 4232 1
1124 721 1272 704 2
224 174 278 151 3
48 44 93 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
398 315 267 279 10
35 21 42 18 11

 MW717677.1 6426 3736 6890 4228 1
1121 719 1269 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
24 14 30 12 9
401 316 266 276 10
35 21 42 18 11

 OK448476.1 6423 3738 6892 4227 1
1120 721 1269 702 2
224 173 278 152 3
48 43 94 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 OK448477.1 6426 3738 6888 4228 1
1122 719 1269 702 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 23 61 17 8
24 14 30 12 9
401 316 266 276 10
35 21 42 18 11

 OK448478.1 6423 3736 6891 4230 1
1121 719 1269 703 2
222 175 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 78 119 61 7
30 24 60 17 8
24 14 30 12 9
402 314 268 275 10
35 21 42 18 11

 OK638135.1 6422 3735 6893 4230 1
1120 721 1269 702 2
224 174 276 153 3
48 44 93 42 4
170 147 212 139 5
67 26 63 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
398 312 265 281 10
35 21 42 18 11

 MZ944846.1 6423 3739 6891 4227 1
1120 721 1268 703 2
224 173 278 152 3
48 43 94 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ944886.1 6425 3738 6889 4228 1
1121 720 1268 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 23 61 17 8
24 14 30 12 9
401 316 266 276 10
35 21 42 18 11
France MT320538.2 6423 3741 6894 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT470100.1 6423 3742 6894 4230 1
1124 723 1273 701 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT470101.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT470102.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT470103.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT470104.1 6423 3742 6894 4230 1
1124 722 1272 703 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT470105.1 6424 3742 6894 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT470106.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
101 64 134 66 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT470107.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 67 25 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT470108.1 6423 3742 6894 4230 1
1124 723 1272 702 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT470109.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT470110.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT470111.1 6425 3741 6894 4229 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
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 MT459907.1 6424 3742 6893 4230 1
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35 21 42 18 11

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67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT459915.1 6424 3741 6894 4230 1
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48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT459916.1 6401 3731 6863 4215 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT459917.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT459919.1 6391 3724 6857 4209 1
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30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT459852.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1272 703 2
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
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401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT459853.1 6423 3742 6893 4231 1
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67 26 66 26 6
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35 21 42 18 11

 MT459854.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT459864.1 6426 3744 6891 4228 1
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT459910.1 6425 3742 6893 4229 1
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170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT459912.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT459913.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
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170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11
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