Friday, January 21, 2022

Appendix IITG2 A

This is an appendix to: It's In The GenBank - 2


SARS-CoV-2 Gene Analysis (by Country, 2020-2021)

Legend:

Columns:
Country = where virus was collected;
Version = NIH GenBank Identifier;
A,C,T, and G = column of molecule type;
gene = gene number a molecule type is in;
(example: gene = '1', A column = '6445'
there are 6,445 'A' molecules in gene 1.)

Focus on changes:
Each virus per country, is compared to the
Wuhan China original SARS-CoV-2 virus. And when
the numbers don't match, the count number is bold
otherwise the molecule count matches the original.


Country Version A C T G gene number
Aland MZ331872.1 6425 3742 6890 4227 1
1124 723 1271 703 2
225 174 276 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 316 264 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331873.1 6424 3742 6892 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ331913.1 6424 3739 6899 4227 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
398 315 265 281 10
35 21 42 18 11

 MZ331884.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ331876.1 6424 3743 6891 4228 1
1124 722 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 212 139 5
67 26 66 26 6
107 78 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331877.1 6425 3743 6892 4229 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
107 78 119 61 7
30 24 60 17 8
100 66 133 66 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331901.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
169 146 213 140 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331880.1 6423 3740 6895 4227 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
169 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 60 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
397 315 265 282 10
35 21 42 18 11

 MZ331897.1 6423 3743 6891 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 175 275 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331900.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 722 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331902.1 6423 3741 6893 4231 1
1123 722 1273 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
106 80 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 OK427031.1 6425 3739 6894 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331881.1 6405 3734 6880 4224 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331882.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331894.1 6425 3742 6893 4229 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
107 78 119 61 7
30 24 60 17 8
100 66 133 66 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331895.1 6425 3742 6893 4229 1
1123 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 78 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 133 66 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331896.1 6423 3742 6892 4231 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331898.1 6425 3742 6895 4227 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
398 315 265 281 10
35 21 42 18 11

 MZ331899.1 6424 3744 6890 4230 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331886.1 6423 3742 6893 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331887.1 6423 3740 6893 4227 1
1124 723 1270 703 2
224 175 275 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331888.1 6423 3742 6893 4231 1
1123 722 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331889.1 6423 3743 6893 4230 1
1125 723 1271 702 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331890.1 6423 3743 6893 4230 1
1125 723 1271 702 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 OK426408.1 6423 3741 6895 4230 1
1123 723 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11
Argentina MW553299.1 6426 3738 6896 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 25 67 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW553295.1 6425 3737 6897 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 25 67 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW553296.1 6425 3738 6896 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 147 213 138 5
67 25 67 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW553297.1 6425 3738 6896 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 25 67 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW553298.1 6425 3738 6896 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 25 67 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW553300.1 6425 3738 6896 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 25 67 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW553303.1 6425 3737 6897 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 25 67 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW553304.1 6425 3738 6896 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 25 67 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW553305.1 6426 3738 6896 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 25 67 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW553306.1 6425 3738 6896 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 25 67 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW553307.1 6425 3738 6896 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 25 67 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW553308.1 6425 3738 6896 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
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 MT969828.1 6423 3741 6896 4229 1
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67 26 66 26 6
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 MW672358.1 6425 3742 6894 4228 1
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 MW672375.1 6423 3737 6903 4226 1
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35 21 42 18 11
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