Friday, January 21, 2022

Appendix IITG2 P

This is an appendix to: It's In The GenBank - 2


SARS-CoV-2 Gene Analysis (by Country, 2020-2021)

Legend:

Columns:
Country = where virus was collected;
Version = NIH GenBank Identifier;
A,C,T, and G = column of molecule type;
gene = gene number a molecule type is in;
(example: gene = '1', A column = '6445'
there are 6,445 'A' molecules in gene 1.)

Focus on changes:
Each virus per country, is compared to the
Wuhan China original SARS-CoV-2 virus. And when
the numbers don't match, the count number is bold
otherwise the molecule count matches the original.


Country Version A C T G gene number
Pakistan MT262993.1 6418 3738 6872 4225 1
3948 2329 4271 2654 2
1124 723 1271 703 3
224 174 276 153 4
48 45 92 42 5
170 146 213 139 6
67 26 66 26 7
107 79 118 61 8
30 24 60 17 9
100 64 134 67 10
399 315 265 280 11

 MT500122.1 6423 3742 6892 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW433736.1 6425 3742 6895 4227 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
49 45 92 41 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
398 316 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW433740.1 6425 3742 6895 4227 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
49 45 92 41 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
398 316 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT730114.1 6417 3736 6891 4225 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT730115.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT730117.1 6424 3743 6892 4230 1
1124 723 1272 702 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 MT730116.1 6424 3743 6892 4230 1
1124 723 1272 702 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 MW433725.1 6425 3739 6898 4227 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 23 61 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MT731277.1 6415 3735 6879 4216 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 267 279 10
35 21 42 18 11

 MW031799.1 6425 3739 6897 4228 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW031800.1 6425 3739 6897 4228 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW031801.1 6425 3739 6897 4228 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW031802.1 6425 3739 6897 4228 1
1124 722 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW031803.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 315 266 277 10
35 21 42 18 11

 MT879619.1 6426 3741 6896 4226 1
1123 722 1272 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 43 17 11

 MT729995.1 6423 3740 6898 4228 1
1123 722 1272 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 314 266 279 10
35 21 42 18 11

 MW433687.1 6424 3740 6896 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 267 279 10
35 21 42 18 11

 MW242667.1 6424 3742 6894 4229 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
399 313 267 280 10
35 21 43 17 11

 MW400961.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 724 1272 702 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW426405.1 6424 3740 6896 4229 1
1123 722 1273 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
99 64 134 68 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MW433685.1 6424 3740 6896 4229 1
1122 723 1271 705 2
223 174 277 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW490572.1 6424 3739 6896 4230 1
1123 724 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 144 215 139 5
67 26 67 25 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 MW433741.1 6425 3741 6894 4229 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 25 60 16 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW433721.1 6425 3737 6897 4230 1
1123 722 1272 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 313 267 280 10
35 21 42 18 11
Peru MT263074.1 6423 3742 6893 4231 1
3948 2330 4282 2657 2
1123 724 1270 704 3
224 174 276 153 4
48 45 92 42 5
170 146 213 139 6
67 26 66 26 7
107 79 118 61 8
30 24 60 17 9
100 64 134 67 10
401 316 265 277 11

 MW030220.1 6423 3741 6894 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW030214.1 6424 3744 6892 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW030211.1 6424 3743 6892 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 78 119 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW030219.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW030204.1 6292 3668 6729 4154 1
1109 711 1256 698 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
162 145 205 134 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
34 21 42 18 11

 MW030205.1 6251 3642 6695 4135 1
1107 708 1245 694 2
224 174 276 153 3
47 40 75 38 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
30 19 36 14 11

 MW030206.1 6423 3741 6894 4231 1
1123 723 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW030207.1 6425 3739 6897 4228 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW030200.1 6416 3730 6881 4223 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
93 64 96 50 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW030202.1 6424 3743 6892 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW030203.1 6425 3742 6893 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
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170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
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35 21 42 18 11

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67 26 66 26 6
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399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW030227.1 6424 3741 6894 4230 1
1122 723 1271 705 2
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100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW030197.1 6425 3740 6895 4229 1
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
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401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW030208.1 6425 3741 6893 4230 1
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
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35 21 42 18 11

 MW030209.1 6425 3741 6893 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
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67 26 66 26 6
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35 21 42 18 11

 MW030210.1 6425 3741 6893 4230 1
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35 21 42 18 11

 MW030218.1 6423 3742 6893 4231 1
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67 26 66 26 6
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35 21 42 18 11

 MW030221.1 6425 3742 6894 4228 1
1123 723 1271 704 2
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67 26 66 26 6
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100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW030215.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW030217.1 6425 3742 6893 4229 1
1123 723 1271 704 2
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
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35 21 42 18 11

 MW030222.1 6401 3728 6862 4216 1
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170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW030216.1 6423 3742 6893 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
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100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11
Philippines MW243995.1 6424 3736 6898 4231 1
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 MT919769.1 6424 3740 6896 4229 1
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66 27 66 26 6
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35 21 42 18 11

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1123 723 1271 704 2
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30 24 60 17 8
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 MT919772.1 6423 3743 6893 4230 1
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 315 266 277 10
35 21 42 18 11

 MT919774.1 6424 3740 6896 4229 1
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66 27 66 26 6
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35 21 42 18 11

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35 21 42 18 11

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35 21 42 18 11

 MT919778.1 6426 3740 6895 4228 1
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35 21 42 18 11

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35 21 42 18 11

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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
397 308 261 272 10
35 21 42 18 11

 MT919781.1 6423 3741 6895 4230 1
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35 21 42 18 11

 MT919782.1 6424 3738 6895 4229 1
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 MT919784.1 6424 3738 6897 4230 1
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35 21 42 18 11

 MT919785.1 6425 3739 6898 4227 1
1123 723 1270 705 2
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48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT919786.1 6424 3740 6896 4229 1
1123 722 1272 704 2
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66 27 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
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35 21 42 18 11

 MT919787.1 6424 3741 6895 4229 1
1123 722 1272 704 2
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35 21 42 18 11

 MT919788.1 6422 3742 6895 4230 1
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 MT919789.1 6422 3742 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
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100 63 135 67 9
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 MT919790.1 6424 3741 6894 4230 1
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100 64 134 67 9
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 MW273807.1 6424 3742 6893 4230 1
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 MW556272.1 6424 3742 6893 4230 1
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35 21 42 18 11

 MW556273.1 6417 3739 6891 4229 1
1123 723 1272 703 2
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48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW556274.1 6424 3742 6893 4230 1
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 MW556275.1 6416 3738 6887 4229 1
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 MW556276.1 6424 3742 6893 4230 1
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 MW556277.1 6417 3739 6892 4229 1
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 MW556278.1 6424 3742 6893 4230 1
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399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

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399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

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 MW556283.1 6422 3740 6893 4230 1
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35 21 42 18 11

 MW556287.1 6421 3740 6894 4228 1
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35 21 42 18 11

 MW556288.1 6422 3738 6887 4225 1
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Puerto Rico MT419810.1 6421 3740 6891 4228 1
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 MT419814.1 6424 3741 6895 4229 1
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399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT419818.1 6424 3738 6897 4230 1
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35 21 42 18 11

 MT419815.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
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48 45 92 42 4
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
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35 21 42 18 11

 MT419816.1 6420 3741 6891 4228 1
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
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399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT419820.1 6423 3741 6895 4230 1
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30 24 60 17 8
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400 314 265 280 10
35 21 42 18 11

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35 21 42 18 11

 MW638355.1 6423 3735 6903 4228 1
1123 724 1270 704 2
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 62 136 67 9
399 313 268 279 10
35 21 42 18 11

 MW583365.1 6423 3737 6898 4231 1
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
99 65 134 67 9
399 313 267 280 10
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48 45 92 42 4
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
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35 21 42 18 11

 MW638445.1 6420 3739 6899 4231 1
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30 24 60 17 8
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399 312 268 280 10
35 21 42 18 11

 MW585976.1 6420 3739 6891 4221 1
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
399 315 268 277 10
34 21 42 19 11

 MW636593.1 6423 3736 6901 4229 1
1123 723 1271 704 2
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW586517.1 6424 3738 6897 4230 1
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30 24 60 17 8
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35 21 42 18 11

 MW640746.1 6424 3740 6895 4230 1
1124 722 1271 704 2
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 314 266 279 10
35 21 42 18 11

 MW586292.1 6418 3733 6894 4227 1
1122 724 1272 703 2
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30 24 60 17 8
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399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW850920.1 6423 3735 6903 4228 1
1123 725 1271 702 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 135 66 9
399 314 267 279 10
35 21 42 18 11

 MW850984.1 6424 3735 6901 4229 1
1122 721 1273 705 2
225 172 279 151 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
399 312 270 278 10
35 21 42 18 11

 MZ258995.1 6423 3739 6890 4228 1
1122 723 1268 704 2
225 171 280 151 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
78 54 86 44 7
28 24 60 17 8
100 63 136 66 9
400 314 266 279 10
35 21 42 18 11

 MZ259020.1 6423 3739 6891 4227 1
1122 724 1268 704 2
225 171 280 151 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 136 66 9
400 314 266 279 10
35 21 42 18 11

 MW851102.1 6423 3734 6901 4231 1
1124 720 1273 704 2
224 175 277 151 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
399 311 269 280 10
35 21 42 18 11

 MW844896.1 6423 3734 6893 4230 1
1121 720 1269 702 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
24 14 30 12 9
401 316 266 276 10
35 21 42 18 11

 MW905200.1 6424 3735 6891 4230 1
1121 720 1269 702 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
24 14 30 12 9
401 316 266 276 10
35 21 42 18 11
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