Friday, January 21, 2022

Appendix IITG2 HJ

This is an appendix to: It's In The GenBank - 2


SARS-CoV-2 Gene Analysis (by Country, 2020-2021)

Legend:

Columns:
Country = where virus was collected;
Version = NIH GenBank Identifier;
A,C,T, and G = column of molecule type;
gene = gene number a molecule type is in;
(example: gene = '1', A column = '6445'
there are 6,445 'A' molecules in gene 1.)

Focus on changes:
Each virus per country, is compared to the
Wuhan China original SARS-CoV-2 virus. And when
the numbers don't match, the count number is bold
otherwise the molecule count matches the original.


Country Version A C T G gene number
Hong Kong MT186683.1 6424 3746 6889 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT621560.1 6423 3742 6893 4231 1
1119 714 1265 693 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 66 133 66 9
399 314 265 281 10
35 21 42 18 11

 MT786446.1 6423 3744 6891 4231 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MT230904.1 6424 3742 6893 4230 1
1124 722 1273 702 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 66 133 66 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT547814.1 6424 3741 6894 4230 1
1125 720 1274 702 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
60 23 53 22 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 66 133 66 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT644268.1 6424 3742 6893 4230 1
1125 721 1274 701 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
60 23 53 22 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 66 133 66 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT114412.1 6424 3744 6891 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 316 264 280 10
35 21 42 18 11

 MT232662.1 6393 3720 6859 4211 1
1123 721 1272 701 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 66 133 66 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT114413.1 6424 3744 6891 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 316 264 280 10
35 21 42 18 11

 MT114414.1 6425 3744 6892 4228 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 316 264 280 10
35 21 42 18 11

 MT365028.1 6425 3744 6892 4228 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 316 264 280 10
35 21 42 18 11

 MT232664.1 6424 3743 6892 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT114415.1 6425 3744 6892 4228 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 316 264 280 10
35 21 42 18 11

 MT114416.1 6424 3742 6893 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT114418.1 6424 3743 6893 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT114417.1 6424 3742 6893 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT114419.1 6424 3743 6893 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT365029.1 6424 3743 6892 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT365032.1 6424 3741 6894 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT365030.1 6422 3744 6891 4232 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MT232672.1 6424 3743 6892 4230 1
1124 723 1270 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT365031.1 6423 3744 6891 4231 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MT232667.1 6424 3745 6890 4230 1
1099 702 1241 682 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT232673.1 6424 3743 6892 4230 1
1124 723 1270 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT232671.1 6424 3744 6891 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11
Japan MW219695.1 6424 3741 6893 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 OL636004.1 6424 3736 6900 4229 1
1123 723 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 315 267 276 10
35 21 42 18 11

 LC594644.1 3949 2329 4283 2656 1
2384 1360 2522 1521 2
1135 727 1280 706 3
224 174 276 153 4
48 45 92 42 5
170 146 213 139 6
67 26 66 26 7
107 79 118 61 8
30 24 60 17 9
100 64 134 67 10
399 314 266 280 11

 OL468553.1 6424 3741 6894 4230 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 LC630936.1 6424 3739 6896 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL468554.1 6424 3740 6895 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 25 66 27 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL468566.1 6424 3740 6895 4229 1
1123 722 1270 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 LC594645.1 3949 2327 4285 2656 1
2384 1359 2523 1521 2
1134 728 1279 707 3
224 174 276 153 4
48 45 92 42 5
170 146 213 139 6
67 26 66 26 7
107 79 118 61 8
30 24 60 17 9
100 64 134 67 10
401 316 265 277 11

 LC594646.1 3949 2328 4284 2656 1
2384 1359 2523 1521 2
1134 728 1279 707 3
224 174 276 153 4
48 45 92 42 5
170 146 213 139 6
67 26 66 26 7
107 79 118 61 8
30 24 60 17 9
100 64 134 67 10
401 316 265 277 11

 MZ853926.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL468567.1 6424 3739 6894 4230 1
1123 722 1270 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL468568.1 6424 3739 6894 4230 1
1123 722 1270 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
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 OL588208.1 6424 3738 6895 4230 1
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 MZ710323.1 6424 3740 6895 4230 1
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35 21 42 18 11

 MZ710325.1 6425 3740 6895 4229 1
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 314 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ710326.1 6425 3740 6895 4229 1
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 MZ710327.1 6425 3740 6895 4229 1
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 MT795870.1 6422 3742 6896 4228 1
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30 24 60 17 8
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399 314 267 279 10
35 21 42 18 11

 MW495984.1 6424 3740 6896 4229 1
1123 723 1271 704 2
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48 45 92 42 4
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30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MW495983.1 6423 3738 6896 4231 1
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48 45 92 42 4
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67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 313 267 280 10
35 21 42 18 11

 MW495985.1 6424 3740 6895 4230 1
1124 723 1270 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
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35 21 42 18 11

 MW634028.1 6422 3742 6893 4232 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
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35 21 42 18 11

 MW634414.1 6422 3737 6899 4231 1
1123 722 1272 704 2
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107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
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35 21 42 18 11

 MW634636.1 6423 3739 6898 4229 1
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170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
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35 21 42 18 11

 MW634274.1 6423 3740 6896 4230 1
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35 21 42 18 11

 MW634432.1 6424 3738 6898 4229 1
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 MW634433.1 6423 3738 6900 4228 1
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 MW634262.1 6424 3737 6898 4230 1
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35 21 42 18 11
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