Friday, January 21, 2022

Appendix IITG2 I

This is an appendix to: It's In The GenBank - 2


SARS-CoV-2 Gene Analysis (by Country, 2020-2021)

Legend:

Columns:
Country = where virus was collected;
Version = NIH GenBank Identifier;
A,C,T, and G = column of molecule type;
gene = gene number a molecule type is in;
(example: gene = '1', A column = '6445'
there are 6,445 'A' molecules in gene 1.)

Focus on changes:
Each virus per country, is compared to the
Wuhan China original SARS-CoV-2 virus. And when
the numbers don't match, the count number is bold
otherwise the molecule count matches the original.


Country Version A C T G gene number
India MT577009.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT577010.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT577011.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT577012.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT577013.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT577014.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT577015.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW425563.1 6424 3740 6897 4228 1
1122 722 1273 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
99 64 134 68 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW425837.1 6422 3737 6898 4232 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
28 24 60 16 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ203529.1 6425 3738 6896 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ203530.1 6424 3741 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ336023.1 6423 3739 6896 4231 1
1123 722 1272 704 2
225 172 279 151 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ336024.1 6425 3740 6895 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 135 66 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ336025.1 6426 3738 6896 4229 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
99 64 135 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ336026.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 27 65 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ336027.1 6424 3739 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 27 65 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ336028.1 6424 3737 6898 4230 1
1122 722 1272 705 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 27 65 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ336029.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 27 65 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ336030.1 6424 3740 6896 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 27 65 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MZ336031.1 6425 3740 6895 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 27 65 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
401 316 266 276 10
35 21 42 18 11

 MZ336032.1 6424 3742 6894 4229 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 MZ336033.1 6424 3737 6898 4230 1
1123 723 1272 703 2
223 174 277 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT012098.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1270 702 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
100 64 134 67 8
399 315 265 280 9
35 21 42 18 10

 MT050493.1 6423 3741 6894 4231 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
100 65 133 67 8
399 315 265 280 9
35 21 42 18 10

 MT415320.1 6423 3743 6892 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11
Iran MW737421.1 6420 3764 6889 4216 1
1123 724 1271 703 2
223 176 276 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 135 66 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MT320891.2 6425 3743 6893 4228 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 MT447177.1 6426 3745 6890 4228 1
1124 721 1273 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ359830.1 6425 3743 6892 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 315 264 280 10
35 21 42 18 11

 MT889692.1 6420 3744 6897 4228 1
1120 723 1271 707 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MT994286.1 6425 3746 6890 4228 1
1124 721 1273 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT994632.1 6425 3746 6893 4225 1
1125 723 1270 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
99 64 134 68 9
401 317 265 276 10
35 21 42 18 11

 MT994849.1 6427 3748 6889 4225 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 212 140 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 22 41 18 11

 MT994881.1 6425 3743 6893 4228 1
1124 724 1271 702 2
224 174 276 153 3
48 46 91 42 4
171 146 213 138 5
67 26 66 26 6
108 79 117 61 7
31 24 59 17 8
100 65 133 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 MZ314348.1 6424 3737 6891 4228 1
1123 722 1273 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ314345.1 6423 3740 6895 4231 1
1123 721 1272 705 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MZ314342.1 6422 3741 6897 4229 1
1123 723 1273 702 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
169 146 213 140 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
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 MW672663.1 6425 3742 6892 4230 1
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 MW672652.1 6424 3742 6893 4230 1
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 MW672657.1 6426 3743 6892 4228 1
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 MW672628.1 6424 3741 6895 4229 1
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 MW672622.1 6424 3741 6894 4230 1
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35 21 42 18 11

 MW672624.1 6424 3741 6894 4230 1
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35 21 42 18 11

 MW672647.1 6424 3744 6891 4230 1
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 MW672668.1 6425 3742 6892 4230 1
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 MW672627.1 6424 3741 6895 4229 1
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35 21 42 18 11

 MW672631.1 6424 3740 6896 4229 1
1123 723 1271 704 2
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW672645.1 6425 3742 6891 4231 1
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Italy MW134558.1 6425 3739 6895 4230 1
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 MT509662.1 6424 3744 6892 4229 1
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 MT077125.1 6424 3744 6892 4229 1
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 MT509653.1 6424 3744 6892 4229 1
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 MT509661.1 6423 3744 6893 4229 1
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 MT509660.1 6423 3744 6893 4229 1
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 MW530510.1 6424 3742 6893 4230 1
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 MT479216.1 6424 3742 6893 4230 1
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 MT483875.1 6424 3742 6893 4230 1
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35 21 42 18 11

 MT527178.1 6424 3742 6893 4230 1
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 MT509665.1 6424 3742 6893 4230 1
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35 21 42 18 11

 MT509666.1 6424 3742 6893 4230 1
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35 21 42 18 11

 MT525950.1 6424 3742 6893 4230 1
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35 21 42 18 11

 MT531537.2 6424 3743 6892 4230 1
1123 723 1271 704 2
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170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW530512.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT483867.1 6424 3740 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
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35 21 42 18 11

 MT483874.1 6424 3742 6893 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
169 146 213 140 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT483880.1 6424 3742 6894 4229 1
1123 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
169 146 213 140 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT509654.1 6407 3731 6873 4215 1
1122 722 1256 701 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
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