Friday, January 21, 2022

Appendix IITG2 M

This is an appendix to: It's In The GenBank - 2



SARS-CoV-2 Gene Analysis (by Country, 2020-2021)


Legend:

Columns:
Country = where virus was collected;
Version = NIH GenBank Identifier;
A,C,T, and G = column of molecule type;
gene = gene number a molecule type is in;
(example: gene = '1', A column = '6445'
there are 6,445 'A' molecules in gene 1.)

Focus on changes:
Each virus per country, is compared to the
Wuhan China original SARS-CoV-2 virus. And when
the numbers don't match, the count number is bold
otherwise the molecule count matches the original.



Country Version A C T G gene number
Malawi OL778959.1 6424 3741 6893 4230 1


1122 722 1271 704 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


108 78 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 315 266 279 10


35 21 42 18 11

OL778952.1 6423 3736 6896 4229 1


1123 722 1270 704 2


225 174 276 152 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


400 315 265 279 10


35 21 42 18 11

OL778955.1 6424 3741 6895 4229 1


1123 722 1270 704 2


226 174 276 151 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


400 315 265 279 10


35 21 42 18 11

OL779141.1 6424 3736 6900 4229 1


1125 717 1269 704 2


222 173 277 155 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


108 77 119 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


399 315 269 276 10


35 21 42 18 11

OL779078.1 6425 3736 6899 4229 1


1125 716 1269 704 2


222 172 279 154 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


108 77 119 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


399 315 269 276 10


35 21 42 18 11

OL779082.1 6424 3738 6898 4229 1


1124 718 1269 704 2


224 172 278 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


398 315 268 278 10


35 21 42 18 11

OL779124.1 6425 3734 6902 4228 1


1125 717 1270 703 2


222 173 277 155 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


108 77 119 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


399 315 270 275 10


35 21 42 18 11

OL779131.1 6423 3736 6900 4230 1


1125 717 1269 704 2


222 173 277 155 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


108 77 119 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


399 315 269 276 10


35 21 42 18 11

OL779084.1 6424 3737 6901 4227 1


1125 718 1268 704 2


224 173 277 153 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


99 73 112 55 7


30 23 61 17 8


100 63 131 65 9


398 315 268 278 10


35 21 42 18 11

OL779160.1 6419 3734 6893 4225 1


1124 718 1270 703 2


224 172 278 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 27 65 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


99 62 127 63 9


398 316 267 278 10


35 21 42 18 11

OL779183.1 6425 3734 6902 4228 1


1122 717 1263 701 2


224 171 279 153 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


107 79 119 60 7


30 23 61 17 8


99 63 131 66 9


398 315 268 278 10


35 21 42 18 11

OL779037.1 6422 3739 6892 4227 1


1120 720 1270 702 2


224 173 278 152 3


48 44 93 42 4


170 145 214 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 63 135 67 9


399 314 266 280 10


35 21 42 18 11

OL779038.1 6424 3736 6899 4230 1


1125 717 1269 704 2


222 174 276 155 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


108 77 119 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


399 315 269 276 10


35 21 42 18 11

OL779040.1 6425 3736 6900 4228 1


1124 718 1269 704 2


224 173 277 153 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


398 315 268 278 10


35 21 42 18 11

OL779074.1 6424 3735 6900 4230 1


1125 718 1268 704 2


222 173 277 155 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


108 77 119 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


398 317 269 275 10


35 21 42 18 11

OL779075.1 6424 3738 6898 4229 1


1123 718 1269 705 2


224 173 277 153 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


398 315 268 278 10


35 21 42 18 11

OL779076.1 6424 3736 6899 4230 1


1125 717 1269 704 2


222 173 277 155 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


108 77 119 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


399 315 269 276 10


35 21 42 18 11

OL779085.1 6420 3736 6900 4233 1


1124 718 1269 704 2


224 173 277 153 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


107 80 117 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


398 314 269 278 10


35 21 42 18 11

OL779102.1 6422 3738 6892 4228 1


1120 721 1269 702 2


224 173 278 152 3


48 44 93 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 63 136 66 9


399 313 268 279 10


35 21 42 18 11

OL779104.1 6421 3738 6892 4229 1


1120 720 1270 702 2


224 173 278 152 3


48 44 93 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 63 135 67 9


399 313 266 281 10


35 21 42 18 11

OL779146.1 6424 3735 6900 4230 1


1125 717 1269 704 2


222 173 277 155 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


108 77 119 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


399 315 270 275 10


35 21 42 18 11

OL779086.1 6423 3738 6898 4224 1


1124 718 1269 704 2


224 172 278 153 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


398 314 269 278 10


35 21 42 18 11

OL779106.1 6420 3738 6892 4230 1


1120 720 1270 702 2


224 173 278 152 3


48 44 93 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 63 135 67 9


399 313 267 280 10


35 21 42 18 11

OL779128.1 6423 3736 6900 4230 1


1125 717 1269 704 2


222 173 277 155 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


108 77 119 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


399 315 269 276 10


35 21 42 18 11

OL779137.1 6423 3735 6900 4231 1


1125 717 1269 704 2


223 173 277 154 3


48 45 92 42 4


170 147 212 139 5


67 26 66 26 6


108 77 119 61 7


30 24 60 17 8


99 63 131 66 9


399 315 270 275 10


35 21 42 18 11
Malaysia MT372480.1 6426 3740 6894 4229 1


1124 722 1272 703 2


224 175 275 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 314 266 280 10


35 21 42 18 11

OK594604.1 6425 3741 6894 4229 1


1124 722 1272 703 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 314 266 280 10


35 21 42 18 11

MT372481.1 6428 3740 6893 4228 1


1124 722 1272 703 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 314 266 280 10


35 21 42 18 11

MT372482.1 6376 3718 6831 4189 1


1110 702 1260 698 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 144 212 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 314 266 280 10


35 21 42 18 11

MW079428.1 6392 3730 6859 4206 1


1108 710 1252 693 2


224 174 277 152 3


48 45 92 42 4


170 145 214 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 63 135 67 9


399 315 265 280 10


35 21 42 18 11

MW079429.1 6425 3740 6893 4229 1


1124 722 1273 702 2


224 173 277 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 314 266 280 10


35 21 42 18 11

MW757191.1 6423 3738 6897 4231 1


1124 721 1272 704 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


99 64 135 67 9


399 314 266 280 10


35 21 42 18 11

OK594606.1 6424 3741 6896 4228 1


1123 722 1272 704 2


224 174 278 151 3


48 45 92 42 4


170 145 214 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 314 266 280 10


35 21 42 18 11

MW757192.1 6377 3707 6838 4185 1


1104 704 1246 689 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


99 64 135 67 9


399 314 266 280 10


35 21 42 18 11

OK594594.1 6424 3741 6896 4228 1


1123 722 1272 704 2


224 174 278 151 3


48 45 92 42 4


170 145 214 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 313 267 280 10


35 21 42 18 11

MZ461920.1 6400 3721 6869 4208 1


1124 721 1272 704 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


99 64 135 67 9


399 314 266 280 10


35 21 42 18 11

OK594611.1 6368 3716 6842 4190 1


1123 722 1272 704 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


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30 24 60 17 8


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MZ643440.1 6423 3742 6893 4231 1


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67 26 66 26 6


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MZ643411.1 6423 3741 6894 4231 1


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MZ643412.1 6424 3740 6895 4230 1


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MT731327.1 6424 3739 6897 4229 1


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MT731746.1 6424 3741 6894 4230 1


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67 26 66 26 6


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MT733120.1 6424 3740 6895 4230 1


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MT731292.1 6424 3741 6894 4230 1


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MT513758.1 6424 3741 6895 4229 1


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67 26 66 26 6


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35 21 42 18 11

MT568645.1 6412 3729 6885 4225 1


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107 79 118 61 7


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MW582699.1 6422 3739 6897 4231 1


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MW803167.1 6424 3735 6892 4229 1


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35 21 42 18 11

MZ571142.1 6422 3738 6898 4231 1


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MT921778.1 6425 3742 6893 4229 1


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67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


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399 314 266 280 10


35 21 42 18 11

MT921779.1 6425 3745 6890 4229 1


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48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 314 266 280 10


35 21 42 18 11

MT921780.1 6424 3742 6893 4230 1


1124 722 1272 703 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 313 267 280 10


35 21 42 18 11

MT921781.1 6424 3742 6894 4229 1


1123 723 1271 704 2


224 174 276 153 3


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66 26 66 27 6


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30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


401 316 265 277 10


35 21 42 18 11

MT921782.1 6424 3741 6894 4230 1


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67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


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35 21 42 18 11

MT921783.1 6425 3737 6899 4228 1


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48 45 92 42 4


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67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


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35 21 42 18 11

MT921784.1 6424 3741 6894 4230 1


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399 314 266 280 10


35 21 42 18 11

MT921785.1 6424 3741 6894 4230 1


1123 722 1271 705 2


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30 24 60 17 8


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35 21 42 18 11

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MW491244.1 6424 3741 6896 4228 1


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48 45 92 42 4


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67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


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48 45 92 42 4


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67 26 66 26 6


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30 24 60 17 8


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35 21 42 18 11

MW491246.1 6424 3739 6898 4228 1


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67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


398 314 266 281 10


35 21 42 18 11

MW491247.1 6423 3740 6898 4228 1


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67 26 66 26 6


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30 24 60 17 8


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35 21 42 18 11

MW491248.1 6423 3741 6896 4229 1


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67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


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35 21 42 18 11

MW491249.1 6424 3738 6899 4228 1


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67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


398 314 267 280 10


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MW491250.1 6424 3739 6898 4228 1


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67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


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35 21 42 18 11

MW491251.1 6424 3740 6897 4228 1


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67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


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398 314 266 281 10


35 21 42 18 11

MZ397177.1 6422 3738 6897 4232 1


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67 26 66 26 6


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30 24 60 17 8


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35 21 42 18 11

MZ397171.1 6423 3739 6898 4229 1


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35 21 42 18 11

MZ397172.1 6428 3734 6898 4229 1


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35 21 42 18 11

MZ397173.1 6422 3738 6897 4232 1


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MZ397175.1 6422 3738 6897 4232 1


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35 21 42 18 11

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