Friday, January 21, 2022

Appendix IITG2 M

This is an appendix to: It's In The GenBank - 2


SARS-CoV-2 Gene Analysis (by Country, 2020-2021)

Legend:

Columns:
Country = where virus was collected;
Version = NIH GenBank Identifier;
A,C,T, and G = column of molecule type;
gene = gene number a molecule type is in;
(example: gene = '1', A column = '6445'
there are 6,445 'A' molecules in gene 1.)

Focus on changes:
Each virus per country, is compared to the
Wuhan China original SARS-CoV-2 virus. And when
the numbers don't match, the count number is bold
otherwise the molecule count matches the original.


Country Version A C T G gene number
Malawi OL778959.1 6424 3741 6893 4230 1
1122 722 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
108 78 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 OL778952.1 6423 3736 6896 4229 1
1123 722 1270 704 2
225 174 276 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 OL778955.1 6424 3741 6895 4229 1
1123 722 1270 704 2
226 174 276 151 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 OL779141.1 6424 3736 6900 4229 1
1125 717 1269 704 2
222 173 277 155 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
108 77 119 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
399 315 269 276 10
35 21 42 18 11

 OL779078.1 6425 3736 6899 4229 1
1125 716 1269 704 2
222 172 279 154 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
108 77 119 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
399 315 269 276 10
35 21 42 18 11

 OL779082.1 6424 3738 6898 4229 1
1124 718 1269 704 2
224 172 278 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
398 315 268 278 10
35 21 42 18 11

 OL779124.1 6425 3734 6902 4228 1
1125 717 1270 703 2
222 173 277 155 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
108 77 119 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
399 315 270 275 10
35 21 42 18 11

 OL779131.1 6423 3736 6900 4230 1
1125 717 1269 704 2
222 173 277 155 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
108 77 119 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
399 315 269 276 10
35 21 42 18 11

 OL779084.1 6424 3737 6901 4227 1
1125 718 1268 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
99 73 112 55 7
30 23 61 17 8
100 63 131 65 9
398 315 268 278 10
35 21 42 18 11

 OL779160.1 6419 3734 6893 4225 1
1124 718 1270 703 2
224 172 278 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 27 65 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
99 62 127 63 9
398 316 267 278 10
35 21 42 18 11

 OL779183.1 6425 3734 6902 4228 1
1122 717 1263 701 2
224 171 279 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
107 79 119 60 7
30 23 61 17 8
99 63 131 66 9
398 315 268 278 10
35 21 42 18 11

 OL779037.1 6422 3739 6892 4227 1
1120 720 1270 702 2
224 173 278 152 3
48 44 93 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 OL779038.1 6424 3736 6899 4230 1
1125 717 1269 704 2
222 174 276 155 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
108 77 119 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
399 315 269 276 10
35 21 42 18 11

 OL779040.1 6425 3736 6900 4228 1
1124 718 1269 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
398 315 268 278 10
35 21 42 18 11

 OL779074.1 6424 3735 6900 4230 1
1125 718 1268 704 2
222 173 277 155 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
108 77 119 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
398 317 269 275 10
35 21 42 18 11

 OL779075.1 6424 3738 6898 4229 1
1123 718 1269 705 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
398 315 268 278 10
35 21 42 18 11

 OL779076.1 6424 3736 6899 4230 1
1125 717 1269 704 2
222 173 277 155 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
108 77 119 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
399 315 269 276 10
35 21 42 18 11

 OL779085.1 6420 3736 6900 4233 1
1124 718 1269 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
107 80 117 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
398 314 269 278 10
35 21 42 18 11

 OL779102.1 6422 3738 6892 4228 1
1120 721 1269 702 2
224 173 278 152 3
48 44 93 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 136 66 9
399 313 268 279 10
35 21 42 18 11

 OL779104.1 6421 3738 6892 4229 1
1120 720 1270 702 2
224 173 278 152 3
48 44 93 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
399 313 266 281 10
35 21 42 18 11

 OL779146.1 6424 3735 6900 4230 1
1125 717 1269 704 2
222 173 277 155 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
108 77 119 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
399 315 270 275 10
35 21 42 18 11

 OL779086.1 6423 3738 6898 4224 1
1124 718 1269 704 2
224 172 278 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
398 314 269 278 10
35 21 42 18 11

 OL779106.1 6420 3738 6892 4230 1
1120 720 1270 702 2
224 173 278 152 3
48 44 93 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
399 313 267 280 10
35 21 42 18 11

 OL779128.1 6423 3736 6900 4230 1
1125 717 1269 704 2
222 173 277 155 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
108 77 119 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
399 315 269 276 10
35 21 42 18 11

 OL779137.1 6423 3735 6900 4231 1
1125 717 1269 704 2
223 173 277 154 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
108 77 119 61 7
30 24 60 17 8
99 63 131 66 9
399 315 270 275 10
35 21 42 18 11
Malaysia MT372480.1 6426 3740 6894 4229 1
1124 722 1272 703 2
224 175 275 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 OK594604.1 6425 3741 6894 4229 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MT372481.1 6428 3740 6893 4228 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MT372482.1 6376 3718 6831 4189 1
1110 702 1260 698 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 144 212 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MW079428.1 6392 3730 6859 4206 1
1108 710 1252 693 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW079429.1 6425 3740 6893 4229 1
1124 722 1273 702 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MW757191.1 6423 3738 6897 4231 1
1124 721 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
99 64 135 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 OK594606.1 6424 3741 6896 4228 1
1123 722 1272 704 2
224 174 278 151 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MW757192.1 6377 3707 6838 4185 1
1104 704 1246 689 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
99 64 135 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 OK594594.1 6424 3741 6896 4228 1
1123 722 1272 704 2
224 174 278 151 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 313 267 280 10
35 21 42 18 11

 MZ461920.1 6400 3721 6869 4208 1
1124 721 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
99 64 135 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 OK594611.1 6368 3716 6842 4190 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
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 OL601948.1 6423 3737 6892 4228 1
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35 21 42 18 11

 OK436433.1 6424 3739 6897 4229 1
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 OK435452.1 6400 3730 6878 4221 1
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 MZ643408.1 6415 3736 6883 4228 1
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 OK435602.1 6382 3724 6844 4202 1
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 MZ643440.1 6423 3742 6893 4231 1
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 OK548930.1 6423 3740 6896 4230 1
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 MZ643411.1 6423 3741 6894 4231 1
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 MZ643412.1 6424 3740 6895 4230 1
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 MT731746.1 6424 3741 6894 4230 1
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 MT733120.1 6424 3740 6895 4230 1
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 MT568645.1 6412 3729 6885 4225 1
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 MW803167.1 6424 3735 6892 4229 1
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35 21 42 18 11

 MZ571142.1 6422 3738 6898 4231 1
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Myanmar MT921777.1 6424 3745 6887 4229 1
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35 21 42 18 11

 MT921778.1 6425 3742 6893 4229 1
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35 21 42 18 11

 MT921779.1 6425 3745 6890 4229 1
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 MT921781.1 6424 3742 6894 4229 1
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35 21 42 18 11

 MT921782.1 6424 3741 6894 4230 1
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35 21 42 18 11

 MT921783.1 6425 3737 6899 4228 1
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107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
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35 21 42 18 11

 MT921784.1 6424 3741 6894 4230 1
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100 64 134 67 9
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35 21 42 18 11

 MT921785.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 722 1271 705 2
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35 21 42 18 11

 MW491250.1 6424 3739 6898 4228 1
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100 64 134 67 9
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 MW491251.1 6424 3740 6897 4228 1
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100 64 134 67 9
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
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35 21 42 18 11

 MZ397171.1 6423 3739 6898 4229 1
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30 24 60 17 8
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35 21 42 18 11

 MZ397172.1 6428 3734 6898 4229 1
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 MZ397173.1 6422 3738 6897 4232 1
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 MZ397174.1 6428 3734 6898 4229 1
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400 316 267 276 10
35 21 42 18 11

 MZ397175.1 6422 3738 6897 4232 1
1124 723 1272 702 2
224 174 277 152 3
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67 26 66 26 6
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100 64 134 67 9
399 314 269 277 10
35 21 42 18 11
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