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Thursday, December 1, 2022

appendix v-1000

This is an appendix to: On The Origin of The Containment Entity - 2


Link: KF650375.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 889

Link: MH891584.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 889

Link: MT978193.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 881

Link: KF411041.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(10), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(11),
UGU(9), UGC(11), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(10), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(10), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(10), ATC(8),
ATA(9), AUU(10), AUC(8), AUA(9), AAA(10), AAG(8), CTT(12),
CTC(9), CTA(11), CTG(10), TTA(10), TTG(10), CUU(12), CUC(9),
CUA(11), CUG(10), UUA(10), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(9),
AAC(10), AAU(9), CCT(11), CCC(8), CCA(10), CCG(8), CCU(11),
CAA(9), CAG(10), CGT(8), CGC(9), CGA(7), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(9), TCC(10), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(9), UCC(10), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(10), ACA(10), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(10), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 890

Link: MK644086.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(9), ATC(9),
ATA(11), AUU(9), AUC(9), AUA(11), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(8), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(10), CUU(11), CUC(8),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(7), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(9), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(10), UCU(9), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(9), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(10), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(11), UAU(10), UAC(11),
Total Codons: 878

Link: LC260045.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(12), GCC(9), GCA(8), GCG(10), GCU(12), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(9), TTC(11), UUU(9), UUC(11), GGT(10), GGC(10), GGA(9),
GGG(9), GGU(10), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(9), ATC(9),
ATA(8), AUU(9), AUC(9), AUA(8), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(10), TTA(9), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(10), UUA(9), UUG(10), ATG(7), AUG(7), AAT(9),
AAC(8), AAU(9), CCT(9), CCC(9), CCA(11), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(9), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(8),
AGG(10), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(8),
ACC(11), ACA(9), ACG(7), ACU(8), GTT(10), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),
Total Codons: 880

Link: KJ813439.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912

Link: KX247130.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(11), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 882

Link: MH006958.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(9), TGT(9), TGC(9),
UGU(9), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(9), TTC(12), UUU(9), UUC(12), GGT(10), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(10), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(9), ATC(8),
ATA(9), AUU(9), AUC(8), AUA(9), AAA(10), AAG(8), CTT(10),
CTC(9), CTA(12), CTG(10), TTA(9), TTG(10), CUU(10), CUC(9),
CUA(12), CUG(10), UUA(9), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(11), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(11),
CAA(9), CAG(10), CGT(11), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(11), TCT(11), TCC(11), TCA(8), TCG(9), AGT(10),
AGC(9), UCU(11), UCC(11), UCA(8), UCG(9), AGU(10), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(7), ACU(10), GTT(11), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(11), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(11), UGG(11),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 896

Link: MF598629.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 913

Link: MF598651.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912

Link: KR265798.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
ATA(8), AUU(11), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(11),
CTC(11), CTA(10), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(11), CUC(11),
CUA(10), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(11), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(11), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 904

Link: KY581696.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(8), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 913

Link: MH817484.1
Feline alphacoronavirus 1
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(8), GCA(8), GCG(9), GCU(10), TGT(11), TGC(9),
UGU(11), UGC(9), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(8), CAC(9), CAU(8), ATT(11), ATC(9),
ATA(9), AUU(11), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(9),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(9), TTG(12), CUU(9), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(9), UUG(12), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(10), AAU(9), CCT(9), CCC(8), CCA(10), CCG(8), CCU(9),
CAA(9), CAG(8), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(10), AGT(9),
AGC(9), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(10), AGU(9), ACT(10),
ACC(10), ACA(9), ACG(9), ACU(10), GTT(10), GTC(10), GTA(9),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(8), UAU(10), UAC(8),
Total Codons: 892

Link: KT368902.1
Camel alphacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(10), GAG(9),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(9), ATC(9),
ATA(10), AUU(9), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(10), CTT(12),
CTC(9), CTA(11), CTG(9), TTA(11), TTG(10), CUU(12), CUC(9),
CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(10), AAU(9), CCT(8), CCC(6), CCA(8), CCG(8), CCU(8),
CAA(9), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(9), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(8), TCA(9), TCG(9), AGT(11),
AGC(8), UCU(11), UCC(8), UCA(9), UCG(9), AGU(11), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(11), GTA(8),
GTG(10), GUU(9), GUC(11), GUA(8), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
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Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
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Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: KX348116.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
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Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 913

Link: MF598674.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
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Link: KR265782.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
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AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(11), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 905

Link: KY354363.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
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Link: MW086538.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Total Codons: 901

Link: MF095123.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
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Total Codons: 865

Link: MF593268.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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Link: MH891590.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 889

Link: KP790144.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(9), UUU(11), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
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CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(8), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(8), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 882

Link: KX550281.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(8), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
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CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(8), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(12), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(12), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 891

Link: MW248465.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(11), GAC(8), GAU(11), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
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CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
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CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(8), CGA(7), CGG(8), AGA(10),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(10), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 885

Link: KT368826.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 913

Link: MK071626.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(9), GAC(10), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(9), ATC(9),
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CUA(12), CUG(10), UUA(9), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(12), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(12), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(10),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(10), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 897

Link: MT066175.1
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(8), GCA(9), GCG(8), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
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CUA(9), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(11), AAU(9), CCT(9), CCC(9), CCA(9), CCG(8), CCU(9),
CAA(10), CAG(10), CGT(8), CGC(8), CGA(10), CGG(8), AGA(9),
AGG(11), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(10), TCG(10), AGT(9),
AGC(8), UCU(10), UCC(9), UCA(10), UCG(10), AGU(9), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(9), ACU(10), GTT(10), GTC(9), GTA(10),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(10), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 899

Link: MW532106.1
Human coronavirus 229E
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(10), GAG(9),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(8),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(10),
ATA(9), AUU(10), AUC(10), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(10),
CTC(8), CTA(11), CTG(8), TTA(10), TTG(10), CUU(10), CUC(8),
CUA(11), CUG(8), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
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CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(11),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(8), TCA(9), TCG(8), AGT(11),
AGC(8), UCU(11), UCC(8), UCA(9), UCG(8), AGU(11), ACT(9),
ACC(9), ACA(9), ACG(8), ACU(9), GTT(10), GTC(10), GTA(9),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(11), UAU(10), UAC(11),
Total Codons: 880

Link: KM975736.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(8),
ATA(9), AUU(10), AUC(8), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(8), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 886

Link: KY065120.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(8), TGC(9),
UGU(8), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(9), TTC(10), UUU(9), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(9), GGU(9), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(10), ATC(9),
ATA(10), AUU(10), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(9), CTT(9),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(9), CUU(9), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(9), CCC(9), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(10), TCA(9), TCG(7), AGT(10),
AGC(10), UCU(10), UCC(10), UCA(9), UCG(7), AGU(10), ACT(9),
ACC(10), ACA(10), ACG(7), ACU(9), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 866

Link: KU900738.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
TTT(9), TTC(9), UUU(9), UUC(9), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(11), AUU(11), AUC(9), AUA(11), AAA(11), AAG(8), CTT(10),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
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GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 879

Link: MT367412.1
Turkey coronavirus
Codon (Counts):
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CUA(10), CUG(10), UUA(9), UUG(9), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
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CAA(9), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(7), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(10), TCT(10), TCC(10), TCA(11), TCG(8), AGT(10),
AGC(11), UCU(10), UCC(10), UCA(11), UCG(8), AGU(10), ACT(9),
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GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(10), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 893

Link: JF893452.2
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
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AGC(10), UCU(9), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(9), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(10), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(11), UAU(10), UAC(11),
Total Codons: 879

Link: KJ645643.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
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CTC(11), CTA(11), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
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AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
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GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 900

Link: MN654981.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912

Link: MK472070.1
Alphacoronavirus sp.
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(10), GCA(8), GCG(7), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
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CAA(11), CAG(9), CGT(9), CGC(7), CGA(7), CGG(8), AGA(9),
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ACC(8), ACA(10), ACG(7), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(9), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(11), TAC(9), UAU(11), UAC(9),
Total Codons: 889

Link: MN692774.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
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GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 900

Link: KP036505.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(9), TGC(11),
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TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 881

Link: KP036502.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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Total Codons: 879

Link: KR265804.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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Link: KY073745.1
NL63-related bat coronavirus
Codon (Counts):
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CAA(10), CAG(9), CGT(9), CGC(9), CGA(9), CGG(8), AGA(7),
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Total Codons: 896

Link: KM012168.1
Porcine coronavirus HKU15
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(8), TGC(9),
UGU(8), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(10), ATC(10),
ATA(11), AUU(10), AUC(10), AUA(11), AAA(10), AAG(10), CTT(10),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(10), TTG(9), CUU(10), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(7), AUG(7), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(9), CCC(9), CCA(10), CCG(9), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(11), TCC(10), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
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Link: MT505388.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 877

Link: KX302874.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
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CUA(11), CUG(10), UUA(11), UUG(10), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(11), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 883

Link: KT323980.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 894

Link: KJ645699.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(8),
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CUA(11), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
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GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 899

Link: KJ829365.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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Total Codons: 913

Link: KR265793.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(11), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
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AGC(10), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(11), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 905

Link: NC_028833.1
BtNv-AlphaCoV/SC2013
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(8), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(12), TGC(10),
UGU(12), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(10), GGC(8), GGA(8),
GGG(8), GGU(10), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(8),
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CTC(9), CTA(9), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(9), CUC(9),
CUA(9), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(8), AAU(9), CCT(9), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(9),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(7), AGA(7),
AGG(9), CGU(10), TCT(9), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(8), UCU(9), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(9),
ACC(9), ACA(10), ACG(8), ACU(9), GTT(11), GTC(10), GTA(9),
GTG(12), GUU(11), GUC(10), GUA(9), GUG(12), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 884

Link: MG781192.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(11), GAC(9), GAU(11), GAA(9), GAG(8),
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ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
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CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(8), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(8), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 893

Link: MF598666.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
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GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(11), ATC(9),
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CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
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Total Codons: 912

Link: MK606368.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
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CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
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GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 893

Link: JX112709.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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Total Codons: 895

Link: MN512437.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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Link: MG011361.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
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AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(9), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
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GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 907

Link: KP981395.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(8), TGC(9),
UGU(8), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
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Link: MF598707.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
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TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912

Link: KY407556.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(9), TGC(10),
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AAC(9), AAU(10), CCT(10), CCC(8), CCA(9), CCG(8), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
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GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
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Total Codons: 882

Link: MF642325.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(8), TGC(9),
UGU(8), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(8), GAG(9),
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GGG(9), GGU(9), CAT(11), CAC(9), CAU(11), ATT(10), ATC(9),
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GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(9), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 875

Link: KR265848.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(8), GCG(9), GCU(10), TGT(8), TGC(10),
UGU(8), UGC(10), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(8), GAG(8),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(10), CAU(10), ATT(11), ATC(10),
ATA(9), AUU(11), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(10),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(11), TTG(9), CUU(10), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(9), ATG(7), AUG(7), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(10), CCC(10), CCA(10), CCG(9), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(8), AGA(8),
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GTG(9), GUU(10), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 880

Link: MG605091.1
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
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GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 883

Link: MG757601.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
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TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 905

Link: NC_046965.1
Canada goose coronavirus
Codon (Counts):
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Total Codons: 875

Link: MT263013.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
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GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 870

Link: MZ367369.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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AGC(10), UCU(8), UCC(10), UCA(9), UCG(7), AGU(10), ACT(10),
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TAT(10), TAC(10), UAU(10), UAC(10),
Total Codons: 879

Link: KX034096.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(11),
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CTC(10), CTA(9), CTG(10), TTA(11), TTG(12), CUU(12), CUC(10),
CUA(9), CUG(10), UUA(11), UUG(12), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(9), CCC(8), CCA(8), CCG(8), CCU(9),
CAA(9), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(9), CGG(9), AGA(9),
AGG(9), CGU(10), TCT(10), TCC(8), TCA(9), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(10), UCC(8), UCA(9), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(11), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(11), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 906

Link: MF598618.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
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ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
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AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 912

Link: MN262644.1
Avian coronavirus (ACoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(10),
UGU(11), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
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AGG(9), CGU(8), TCT(8), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(10), UCU(8), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(10),
ACC(9), ACA(10), ACG(9), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(11), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(11), TGG(9), UGG(9),
TAT(11), TAC(10), UAU(11), UAC(10),
Total Codons: 883

Link: KY369909.2
Human coronavirus 229E
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(8), GCA(10), GCG(8), GCU(10), TGT(11), TGC(11),
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TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(10), GGC(8), GGA(8),
GGG(9), GGU(10), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(7),
ATA(9), AUU(10), AUC(7), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(9),
CTC(8), CTA(10), CTG(9), TTA(8), TTG(10), CUU(9), CUC(8),
CUA(10), CUG(9), UUA(8), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(9), AAU(10), CCT(8), CCC(6), CCA(8), CCG(8), CCU(8),
CAA(10), CAG(8), CGT(10), CGC(9), CGA(9), CGG(7), AGA(9),
AGG(9), CGU(10), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(10), AGT(11),
AGC(9), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(10), AGU(11), ACT(8),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(8), GTT(11), GTC(10), GTA(10),
GTG(11), GUU(11), GUC(10), GUA(10), GUG(11), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 884

Link: MF769433.1
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(9),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(8), GGC(8), GGA(8),
GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(9), ATC(10),
ATA(9), AUU(9), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(9), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(9), CUU(11), CUC(9),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(9), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(8), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(8),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(7), AGA(10),
AGG(9), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(8), UCU(11), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(10), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 879

Link: MN690610.1
Bottlenose dolphin coronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(8), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(11), TGC(8),
UGU(11), UGC(8), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(9), GAG(9),
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CUA(9), CUG(9), UUA(10), UUG(11), ATG(7), AUG(7), AAT(11),
AAC(9), AAU(11), CCT(10), CCC(10), CCA(9), CCG(9), CCU(10),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(9), CGA(9), CGG(9), AGA(8),
AGG(9), CGU(9), TCT(9), TCC(9), TCA(10), TCG(10), AGT(9),
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ACC(10), ACA(10), ACG(9), ACU(9), GTT(10), GTC(9), GTA(8),
GTG(11), GUU(10), GUC(9), GUA(8), GUG(11), TGG(10), UGG(10),
TAT(11), TAC(9), UAU(11), UAC(9),
Total Codons: 899

Link: MW086531.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(10), GCG(10), GCU(10), TGT(12), TGC(11),
UGU(12), UGC(11), GAT(8), GAC(9), GAU(8), GAA(8), GAG(9),
TTT(10), TTC(9), UUU(10), UUC(9), GGT(10), GGC(10), GGA(10),
GGG(9), GGU(10), CAT(10), CAC(11), CAU(10), ATT(11), ATC(9),
ATA(9), AUU(11), AUC(9), AUA(9), AAA(8), AAG(8), CTT(10),
CTC(10), CTA(10), CTG(11), TTA(9), TTG(11), CUU(10), CUC(10),
CUA(10), CUG(11), UUA(9), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(9), CCC(7), CCA(8), CCG(8), CCU(9),
CAA(9), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(9), AGA(8),
AGG(9), CGU(10), TCT(11), TCC(8), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(8), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(10), ACG(8), ACU(10), GTT(12), GTC(10), GTA(10),
GTG(11), GUU(12), GUC(10), GUA(10), GUG(11), TGG(11), UGG(11),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 915

Link: MK071635.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(9), GAC(10), GAU(9), GAA(9), GAG(8),
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ATA(9), AUU(9), AUC(9), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
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CUA(12), CUG(10), UUA(9), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
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CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(12), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(12), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(10),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(10), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 897

Link: KF650371.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 889

Link: KY674919.1
Human coronavirus 229E
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(8), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(10), GAG(9),
TTT(12), TTC(11), UUU(12), UUC(11), GGT(10), GGC(8), GGA(9),
GGG(9), GGU(10), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(7),
ATA(8), AUU(11), AUC(7), AUA(8), AAA(9), AAG(10), CTT(9),
CTC(8), CTA(10), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(9), CUC(8),
CUA(10), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(10), AAU(9), CCT(9), CCC(6), CCA(8), CCG(9), CCU(9),
CAA(11), CAG(8), CGT(10), CGC(9), CGA(9), CGG(7), AGA(8),
AGG(9), CGU(10), TCT(10), TCC(9), TCA(9), TCG(9), AGT(10),
AGC(9), UCU(10), UCC(9), UCA(9), UCG(9), AGU(10), ACT(8),
ACC(8), ACA(10), ACG(9), ACU(8), GTT(11), GTC(10), GTA(8),
GTG(10), GUU(11), GUC(10), GUA(8), GUG(10), TGG(11), UGG(11),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 883

Link: KT026456.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(10), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(10), GAC(8), GAU(10), GAA(11), GAG(8),
TTT(11), TTC(10), UUU(11), UUC(10), GGT(9), GGC(10), GGA(9),
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ATA(10), AUU(11), AUC(9), AUA(10), AAA(9), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(11), CUU(11), CUC(10),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(9), CGT(10), CGC(8), CGA(8), CGG(8), AGA(9),
AGG(8), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(10), TAC(8), UAU(10), UAC(8),
Total Codons: 910

Link: MH539766.1
Porcine enteric alphacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
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TAT(11), TAC(10), UAU(11), UAC(10),
Total Codons: 884

Link: MK140811.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
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ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 891

Link: KJ184549.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 889

Link: KJ425498.1
Infectious bronchitis virus
Codon (Counts):
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GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 889

Link: MH061339.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(8), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(12), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(12), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(8), CCU(9),
CAA(10), CAG(9), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(12), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(10), UCU(12), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 898

Link: MG757602.1
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (MERS-CoV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(10), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(10),
UGU(10), UGC(10), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(10), GAG(8),
TTT(10), TTC(11), UUU(10), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(9), GGU(9), CAT(9), CAC(11), CAU(9), ATT(10), ATC(10),
ATA(9), AUU(10), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(12),
CTC(11), CTA(9), CTG(10), TTA(10), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
CUA(9), CUG(10), UUA(10), UUG(11), ATG(9), AUG(9), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(9), CCA(8), CCG(7), CCU(10),
CAA(8), CAG(10), CGT(10), CGC(8), CGA(9), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(10), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(10), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(10), UGG(10),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 907

Link: KJ645656.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(8),
ATA(8), AUU(10), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(12),
CTC(11), CTA(11), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
CUA(11), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 899

Link: MN692792.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(7), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(10), CCC(6), CCA(9), CCG(9), CCU(10),
CAA(10), CAG(9), CGT(9), CGC(9), CGA(7), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(8), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 889

Link: MH025763.1
Porcine deltacoronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(8), TGC(9),
UGU(8), UGC(9), GAT(9), GAC(9), GAU(9), GAA(8), GAG(8),
TTT(9), TTC(10), UUU(9), UUC(10), GGT(9), GGC(9), GGA(10),
GGG(9), GGU(9), CAT(10), CAC(9), CAU(10), ATT(10), ATC(9),
ATA(10), AUU(10), AUC(9), AUA(10), AAA(10), AAG(10), CTT(9),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(9), CUU(9), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(8), AUG(8), AAT(10),
AAC(8), AAU(10), CCT(9), CCC(9), CCA(10), CCG(9), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(9), CGA(7), CGG(8), AGA(9),
AGG(9), CGU(8), TCT(10), TCC(10), TCA(9), TCG(7), AGT(10),
AGC(10), UCU(10), UCC(10), UCA(9), UCG(7), AGU(10), ACT(9),
ACC(10), ACA(10), ACG(7), ACU(9), GTT(9), GTC(9), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(9), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(9), UAU(9), UAC(9),
Total Codons: 866

Link: KX839247.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(9), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(11), ATC(8),
ATA(9), AUU(11), AUC(8), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(9), CTA(10), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(9),
CUA(10), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(10), CCC(7), CCA(8), CCG(9), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(10), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(10),
AGC(9), UCU(10), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(11), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(11), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(8), TAC(10), UAU(8), UAC(10),
Total Codons: 894

Link: MH726380.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(9), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(10), UCU(11), UCC(9), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(10), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(10), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 892

Link: MF769421.1
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(9), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(9), TGC(10),
UGU(9), UGC(10), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(9),
TTT(10), TTC(10), UUU(10), UUC(10), GGT(8), GGC(8), GGA(8),
GGG(8), GGU(8), CAT(9), CAC(9), CAU(9), ATT(9), ATC(10),
ATA(9), AUU(9), AUC(10), AUA(9), AAA(9), AAG(9), CTT(11),
CTC(9), CTA(10), CTG(9), TTA(11), TTG(9), CUU(11), CUC(9),
CUA(10), CUG(9), UUA(11), UUG(9), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(8), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(8),
CAA(9), CAG(9), CGT(9), CGC(8), CGA(9), CGG(7), AGA(10),
AGG(9), CGU(9), TCT(11), TCC(9), TCA(9), TCG(8), AGT(10),
AGC(8), UCU(11), UCC(9), UCA(9), UCG(8), AGU(10), ACT(11),
ACC(8), ACA(10), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(9),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(9), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(10), TAC(9), UAU(10), UAC(9),
Total Codons: 879

Link: KY070587.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(9), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(10), GAC(10), GAU(10), GAA(9), GAG(8),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(10), ATC(9),
ATA(9), AUU(10), AUC(9), AUA(9), AAA(10), AAG(10), CTT(11),
CTC(10), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(10), CUU(11), CUC(10),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(9),
AAC(9), AAU(9), CCT(9), CCC(7), CCA(9), CCG(9), CCU(9),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(10),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(11),
ACC(8), ACA(8), ACG(9), ACU(11), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(9), UGG(9),
TAT(9), TAC(10), UAU(9), UAC(10),
Total Codons: 893

Link: KJ645682.1
Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)
Codon (Counts):
GCT(10), GCC(10), GCA(9), GCG(8), GCU(10), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(8), GAC(10), GAU(8), GAA(10), GAG(8),
TTT(11), TTC(12), UUU(11), UUC(12), GGT(9), GGC(9), GGA(9),
GGG(8), GGU(9), CAT(10), CAC(8), CAU(10), ATT(10), ATC(8),
ATA(8), AUU(10), AUC(8), AUA(8), AAA(10), AAG(9), CTT(12),
CTC(11), CTA(11), CTG(10), TTA(9), TTG(11), CUU(12), CUC(11),
CUA(11), CUG(10), UUA(9), UUG(11), ATG(10), AUG(10), AAT(10),
AAC(10), AAU(10), CCT(10), CCC(7), CCA(9), CCG(10), CCU(10),
CAA(10), CAG(8), CGT(9), CGC(9), CGA(8), CGG(9), AGA(9),
AGG(8), CGU(9), TCT(11), TCC(10), TCA(10), TCG(9), AGT(9),
AGC(9), UCU(11), UCC(10), UCA(10), UCG(9), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(10), GTA(8),
GTG(9), GUU(9), GUC(10), GUA(8), GUG(9), TGG(10), UGG(10),
TAT(8), TAC(9), UAU(8), UAC(9),
Total Codons: 899

Link: MK334046.1
Human coronavirus NL63 (HCoV-NL63)
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(7), GCA(9), GCG(7), GCU(9), TGT(10), TGC(9),
UGU(10), UGC(9), GAT(9), GAC(8), GAU(9), GAA(11), GAG(7),
TTT(11), TTC(11), UUU(11), UUC(11), GGT(9), GGC(8), GGA(8),
GGG(7), GGU(9), CAT(9), CAC(8), CAU(9), ATT(11), ATC(8),
ATA(9), AUU(11), AUC(8), AUA(9), AAA(9), AAG(10), CTT(10),
CTC(8), CTA(11), CTG(9), TTA(11), TTG(10), CUU(10), CUC(8),
CUA(11), CUG(9), UUA(11), UUG(10), ATG(9), AUG(9), AAT(11),
AAC(10), AAU(11), CCT(9), CCC(6), CCA(8), CCG(6), CCU(9),
CAA(9), CAG(9), CGT(8), CGC(7), CGA(7), CGG(6), AGA(10),
AGG(8), CGU(8), TCT(12), TCC(9), TCA(10), TCG(7), AGT(9),
AGC(8), UCU(12), UCC(9), UCA(10), UCG(7), AGU(9), ACT(10),
ACC(8), ACA(9), ACG(8), ACU(10), GTT(9), GTC(9), GTA(9),
GTG(10), GUU(9), GUC(9), GUA(9), GUG(10), TGG(9), UGG(9),
TAT(11), TAC(10), UAU(11), UAC(10),
Total Codons: 868

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