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Friday, January 21, 2022

Appendix IITG2 U

This is an appendix to: It's In The GenBank - 2



SARS-CoV-2 Gene Analysis (by Country, 2020-2021)


Legend:

Columns:
Country = where virus was collected;
Version = NIH GenBank Identifier;
A,C,T, and G = column of molecule type;
gene = gene number a molecule type is in;
(example: gene = '1', A column = '6445'
there are 6,445 'A' molecules in gene 1.)

Focus on changes:
Each virus per country, is compared to the
Wuhan China original SARS-CoV-2 virus. And when
the numbers don't match, the count number is bold
otherwise the molecule count matches the original.



Country Version A C T G gene number
Uganda MZ287350.1 6424 3738 6897 4228 1


1124 721 1274 700 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


101 65 133 66 9


400 315 266 278 10


35 21 42 18 11

MZ287363.1 6424 3738 6897 4228 1


1124 721 1274 700 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


101 65 133 66 9


400 315 266 278 10


35 21 42 18 11

MZ287360.1 6422 3734 6895 4229 1


1123 723 1271 704 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 78 119 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 314 266 280 10


35 21 42 18 11

MZ287347.1 6424 3739 6899 4225 1


1124 720 1273 702 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


101 65 133 66 9


400 316 265 278 10


35 21 42 18 11

MZ287364.1 6424 3739 6897 4227 1


1124 720 1274 700 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


101 65 133 66 9


400 316 265 278 10


35 21 42 18 11

MZ287368.1 6424 3738 6898 4226 1


1124 720 1274 701 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 66 9


400 316 265 278 10


35 21 42 18 11

MZ287358.1 6426 3739 6894 4228 1


1104 717 1253 694 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 315 267 278 10


35 21 42 18 11

OL442161.1 6424 3739 6899 4227 1


1125 721 1274 701 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


68 26 65 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


101 65 133 66 9


400 316 265 278 10


35 21 42 18 11

MZ287352.1 6424 3738 6898 4226 1


1123 719 1272 699 2


224 174 277 152 3


48 45 92 42 4


170 145 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 66 9


400 316 265 278 10


35 21 42 18 11

MZ287367.1 6423 3733 6901 4229 1


1123 720 1273 702 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 78 119 61 7


30 24 60 17 8


101 65 133 66 9


402 315 265 277 10


35 21 42 18 11

MZ287359.1 6422 3739 6899 4226 1


1124 720 1274 701 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 78 119 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 66 9


400 316 265 278 10


35 21 42 18 11

MZ287354.1 6424 3738 6898 4226 1


1124 720 1274 701 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 66 9


400 316 265 278 10


35 21 42 18 11

MZ287369.1 6426 3739 6894 4228 1


1104 717 1253 694 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 315 267 278 10


35 21 42 18 11

MZ287362.1 6424 3740 6896 4227 1


1101 707 1247 686 2


224 174 277 152 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 67 25 6


107 79 118 61 7


30 24 61 16 8


101 65 133 66 9


400 315 266 278 10


35 21 42 18 11

MZ287361.1 6424 3735 6900 4229 1


1121 722 1269 703 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


169 146 213 139 5


67 26 66 25 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 314 266 280 10


35 20 43 18 11
United Kingdom MW059036.1 6424 3744 6891 4230 1


1121 716 1265 695 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 67 9


399 315 265 280 10


34 21 42 19 11

OK041127.1 6423 3743 6891 4231 1


1118 722 1271 705 2


224 174 276 153 3


49 45 91 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 67 9


399 314 266 280 10


34 21 42 19 11

OK041128.1 6422 3744 6890 4231 1


1123 720 1273 705 2


224 174 276 153 3


49 45 91 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 67 9


399 314 266 280 10


34 21 42 19 11

OK041129.1 6421 3744 6891 4231 1


1124 720 1273 704 2


224 174 276 153 3


49 45 91 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 67 9


399 314 266 280 10


34 21 42 19 11

OK041130.1 6422 3746 6889 4232 1


1122 721 1275 703 2


225 174 275 153 3


49 45 91 42 4


168 147 213 140 5


66 26 66 27 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 67 9


399 314 266 280 10


34 21 42 19 11

OK041131.1 6422 3743 6890 4232 1


1121 715 1264 697 2


224 174 276 153 3


48 46 91 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 67 9


398 315 265 280 10


34 21 42 19 11

OK041132.1 6423 3744 6887 4232 1


1123 722 1271 704 2


224 174 276 153 3


49 45 91 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 67 9


399 313 267 280 10


34 21 42 19 11

OK041133.1 6423 3743 6890 4232 1


1124 722 1269 704 2


224 174 276 153 3


49 45 91 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 67 9


399 314 266 280 10


34 21 42 19 11

OK041134.1 6423 3744 6891 4230 1


1124 722 1270 704 2


224 174 276 153 3


48 44 91 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 67 9


399 314 265 280 10


34 21 42 19 11

MT873892.1 6424 3741 6894 4230 1


1123 723 1271 704 2


224 174 277 152 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 315 265 280 10


35 21 42 18 11

MT882022.1 6424 3741 6893 4230 1


1122 723 1272 704 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 315 265 280 10


35 21 42 18 11

MW255832.1 6424 3741 6894 4230 1


1123 723 1271 704 2


224 175 275 153 3


49 45 91 42 4


170 146 213 139 5


67 27 65 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


401 316 265 277 10


35 21 42 18 11

MT906650.1 6424 3743 6892 4230 1


1124 722 1271 704 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 315 265 280 10


35 21 43 17 11

MW041156.1 6423 3744 6893 4229 1


1124 723 1271 703 2


224 173 277 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 63 135 67 9


399 315 265 280 10


35 21 42 18 11

MT906649.1 6422 3737 6890 4229 1


1122 720 1265 703 2


224 173 276 153 3


48 43 93 42 4


169 146 212 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 315 265 280 10


35 21 42 18 11

MZ376737.1 6423 3734 6892 4230 1


1121 720 1268 703 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


24 14 30 12 9


401 316 266 276 10


35 21 42 18 11
United States MT252714.1 6423 3741 6894 4231 1


1124 723 1271 703 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 67 9


399 315 265 280 10


35 21 42 18 11

MT252718.1 6368 3717 6821 4210 1


1118 723 1269 704 2


224 174 277 152 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 315 265 280 10


35 21 42 18 11

MT252720.1 6424 3741 6894 4230 1


1124 723 1271 703 2


224 174 277 152 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 27 65 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 67 9


399 315 265 280 10


35 21 42 18 11

MT252722.1 6424 3741 6889 4228 1


1123 723 1271 704 2


224 174 277 152 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 64 134 67 9


399 315 265 280 10


35 21 42 18 11

MT252724.1 6423 3741 6894 4230 1


1124 723 1271 703 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 26 66 26 6


107 79 118 61 7


30 24 60 17 8


100 65 133 67 9


399 315 265 280 10


35 21 42 18 11

MT252727.1 6424 3741 6896 4228 1


1124 723 1271 703 2


224 174 276 153 3


48 45 92 42 4


170 146 213 139 5


67 27 65 26 6


107 79 118 61 7


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MZ331872.1 6425 3742 6890 4227 1


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