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Friday, January 21, 2022

Appendix IITG2 T

This is an appendix to: It's In The GenBank - 2


SARS-CoV-2 Gene Analysis (by Country, 2020-2021)

Legend:

Columns:
Country = where virus was collected;
Version = NIH GenBank Identifier;
A,C,T, and G = column of molecule type;
gene = gene number a molecule type is in;
(example: gene = '1', A column = '6445'
there are 6,445 'A' molecules in gene 1.)

Focus on changes:
Each virus per country, is compared to the
Wuhan China original SARS-CoV-2 virus. And when
the numbers don't match, the count number is bold
otherwise the molecule count matches the original.


Country Version A C T G gene number
Taiwan OL739246.1 6423 3744 6890 4231 1
1111 713 1260 695 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 OL739269.1 6423 3743 6892 4231 1
1110 714 1260 695 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MT192759.1 6424 3744 6891 4231 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
100 64 134 67 8
399 315 265 280 9
35 21 42 18 10

 MT066175.1 6424 3743 6892 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
100 65 133 67 8
399 315 265 280 9
35 21 42 18 10

 MT374101.1 6423 3743 6892 4231 1
1124 721 1273 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
16 14 50 11 8
5 4 14 6 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT066176.1 6423 3743 6892 4231 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
100 64 134 67 8
399 315 265 280 9
35 21 42 18 10

 MT370516.1 6425 3743 6893 4228 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 317 263 280 10
35 21 42 18 11

 MT370518.1 6425 3743 6893 4228 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 317 263 280 10
35 21 42 18 11

 MT479223.1 6424 3743 6894 4228 1
1124 721 1273 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 317 263 280 10
35 21 42 18 11

 MT374102.1 6425 3743 6893 4228 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 317 263 280 10
35 21 42 18 11

 MT374103.1 6425 3742 6894 4228 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 317 263 280 10
35 21 42 18 11

 MT374104.1 6425 3743 6893 4228 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 317 263 280 10
35 21 42 18 11

 MT374105.1 6424 3744 6892 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT374106.1 6423 3744 6893 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 147 213 138 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 135 66 9
399 317 263 280 10
35 21 42 18 11

 MT374107.1 6423 3744 6893 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 147 213 138 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 135 66 9
399 317 263 280 10
35 21 42 18 11

 MT374108.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT374112.1 6424 3740 6896 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 278 151 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT374109.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT374110.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT374111.1 6423 3742 6893 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 MT374113.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT590598.1 6424 3742 6893 4230 1
1124 722 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT374114.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT374115.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT374116.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11
Thailand MT447155.1 6424 3744 6891 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT447156.1 6424 3744 6891 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 27 65 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT447166.1 6423 3741 6896 4229 1
1125 723 1271 702 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT447157.1 6424 3744 6891 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT447158.1 6424 3742 6894 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT447159.1 6424 3743 6892 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT447154.1 6424 3743 6892 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT447161.1 6424 3744 6891 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT447162.1 6424 3743 6893 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MT447163.1 6424 3742 6895 4228 1
1125 723 1271 702 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT447165.1 6423 3743 6896 4227 1
1125 723 1271 702 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT781415.1 6423 3742 6894 4230 1
1125 723 1271 702 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
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 MT447169.1 6423 3741 6896 4229 1
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 MT447176.1 6423 3741 6896 4229 1
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 MZ401455.1 6424 3736 6892 4228 1
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24 14 30 12 9
401 316 266 276 10
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 OK555092.3 6424 3737 6897 4230 1
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Tunisia MW366724.1 6424 3742 6893 4230 1
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 MT499215.1 6422 3743 6892 4232 1
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 MT559038.1 6423 3742 6892 4231 1
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 MT499219.1 6424 3741 6895 4229 1
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 MT499217.1 6424 3737 6899 4229 1
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 MT499218.1 6423 3740 6898 4228 1
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 MW428253.1 6424 3742 6893 4230 1
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30 24 60 17 8
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 MW366750.1 6424 3738 6899 4228 1
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 MT955168.1 6423 3742 6893 4231 1
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35 21 42 18 11

 MT955169.1 6424 3738 6896 4230 1
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 MT955170.1 6424 3738 6897 4230 1
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35 21 42 18 11

 MT955171.1 6423 3741 6893 4230 1
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35 21 42 18 11

 MT955172.1 6424 3740 6896 4229 1
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67 26 66 26 6
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30 23 61 17 8
100 64 134 67 9
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35 21 42 18 11

 MT955173.1 6424 3739 6896 4230 1
1123 722 1272 704 2
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 267 279 10
35 21 42 18 11

 MT955174.1 6424 3736 6901 4227 1
1123 723 1271 703 2
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170 146 214 138 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 23 61 17 8
100 64 134 67 9
400 314 265 280 10
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Turkey MT478018.1 6424 3740 6895 4230 1
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 MT478019.1 6424 3742 6893 4230 1
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 MT560531.1 6424 3743 6892 4230 1
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 MW199149.1 6424 3740 6895 4230 1
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 MT786329.1 6424 3738 6897 4230 1
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35 21 42 18 11

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 MT786335.1 6423 3738 6897 4231 1
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 MT786336.1 6425 3738 6898 4228 1
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35 21 42 18 11
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