This is an appendix to: On The Origin Of The Home Of COVID-19 - 35
Link: NZ_CP033460.1
Staphylococcus debuckii
Codon (Counts):
GCT(2616), GCC(2188), GCA(2703), GCG(2228), GCU(2616), TGT(2773), TGC(2713),Total Codons: 256,738
UGU(2773), UGC(2713), GAT(2910), GAC(2390), GAU(2910), GAA(3019), GAG(2323),
TTT(3182), TTC(3033), UUU(3182), UUC(3033), GGT(2412), GGC(2165), GGA(2454),
GGG(1724), GGU(2412), CAT(2921), CAC(2416), CAU(2921), ATT(3351), ATC(2910),
ATA(3195), AUU(3351), AUC(2910), AUA(3195), AAA(3211), AAG(2977), CTT(3002),
CTC(2223), CTA(2654), CTG(2569), TTA(3250), TTG(3022), CUU(3002), CUC(2223),
CUA(2654), CUG(2569), UUA(3250), UUG(3022), ATG(2948), AUG(2948), AAT(3420),
AAC(2896), AAU(3420), CCT(2429), CCC(1746), CCA(2524), CCG(2136), CCU(2429),
CAA(3037), CAG(2575), CGT(2409), CGC(2248), CGA(2437), CGG(2118), AGA(2799),
AGG(2434), CGU(2409), TCT(2798), TCC(2434), TCA(2969), TCG(2403), AGT(2745),
AGC(2626), UCU(2798), UCC(2434), UCA(2969), UCG(2403), AGU(2745), ACT(2767),
ACC(2467), ACA(2812), ACG(2427), ACU(2767), GTT(2860), GTC(2348), GTA(2748),
GTG(2407), GUU(2860), GUC(2348), GUA(2748), GUG(2407), TGG(2489), UGG(2489),
TAT(3131), TAC(2788), UAU(3131), UAC(2788),
Link: NZ_CP001668.1
Mycoplasma mycoides
Codon (Counts):
GCT(998), GCC(445), GCA(935), GCG(321), GCU(998), TGT(1157), TGC(935),Total Codons: 97,830
UGU(1157), UGC(935), GAT(1184), GAC(721), GAU(1184), GAA(1161), GAG(809),
TTT(1506), TTC(1277), UUU(1506), UUC(1277), GGT(887), GGC(435), GGA(850),
GGG(387), GGU(887), CAT(1213), CAC(865), CAU(1213), ATT(1541), ATC(1260),
ATA(1422), AUU(1541), AUC(1260), AUA(1422), AAA(1458), AAG(1198), CTT(1281),
CTC(854), CTA(1229), CTG(937), TTA(1522), TTG(1302), CUU(1281), CUC(854),
CUA(1229), CUG(937), UUA(1522), UUG(1302), ATG(1094), AUG(1094), AAT(1553),
AAC(1254), AAU(1553), CCT(874), CCC(436), CCA(958), CCG(271), CCU(874),
CAA(1276), CAG(959), CGT(544), CGC(313), CGA(449), CGG(285), AGA(1107),
AGG(831), CGU(544), TCT(1208), TCC(920), TCA(1298), TCG(473), AGT(1242),
AGC(1012), UCU(1208), UCC(920), UCA(1298), UCG(473), AGU(1242), ACT(1216),
ACC(884), ACA(1124), ACG(514), ACU(1216), GTT(1271), GTC(753), GTA(1105),
GTG(813), GUU(1271), GUC(753), GUA(1105), GUG(813), TGG(928), UGG(928),
TAT(1412), TAC(1077), UAU(1412), UAC(1077),
Link: NZ_CP013911.1
Staphylococcus haemolyticus
Codon (Counts):
GCT(2537), GCC(1951), GCA(2601), GCG(1929), GCU(2537), TGT(2948), TGC(2618),Total Codons: 258,921
UGU(2948), UGC(2618), GAT(2944), GAC(2320), GAU(2944), GAA(3024), GAG(2174),
TTT(3334), TTC(2989), UUU(3334), UUC(2989), GGT(2422), GGC(1902), GGA(2296),
GGG(1584), GGU(2422), CAT(3076), CAC(2491), CAU(3076), ATT(3603), ATC(2987),
ATA(3383), AUU(3603), AUC(2987), AUA(3383), AAA(3330), AAG(2987), CTT(3011),
CTC(2252), CTA(2878), CTG(2459), TTA(3527), TTG(3118), CUU(3011), CUC(2252),
CUA(2878), CUG(2459), UUA(3527), UUG(3118), ATG(3055), AUG(3055), AAT(3590),
AAC(3027), AAU(3590), CCT(2390), CCC(1648), CCA(2574), CCG(1700), CCU(2390),
CAA(3102), CAG(2397), CGT(2391), CGC(1953), CGA(2313), CGG(1620), AGA(2784),
AGG(2319), CGU(2391), TCT(2825), TCC(2332), TCA(3101), TCG(2293), AGT(2863),
AGC(2544), UCU(2825), UCC(2332), UCA(3101), UCG(2293), AGU(2863), ACT(2924),
ACC(2519), ACA(2901), ACG(2387), ACU(2924), GTT(2971), GTC(2340), GTA(2881),
GTG(2471), GUU(2971), GUC(2340), GUA(2881), GUG(2471), TGG(2486), UGG(2486),
TAT(3377), TAC(2896), UAU(3377), UAC(2896),
Link: NZ_CP047186.1
Rathayibacter tanaceti
Codon (Counts):
GCT(39), GCC(40), GCA(40), GCG(42), GCU(39), TGT(31), TGC(40),Total Codons: 3,344
UGU(31), UGC(40), GAT(37), GAC(37), GAU(37), GAA(34), GAG(40),
TTT(25), TTC(36), UUU(25), UUC(36), GGT(37), GGC(40), GGA(38),
GGG(36), GGU(37), CAT(35), CAC(39), CAU(35), ATT(30), ATC(37),
ATA(23), AUU(30), AUC(37), AUA(23), AAA(24), AAG(33), CTT(34),
CTC(42), CTA(30), CTG(34), TTA(22), TTG(32), CUU(34), CUC(42),
CUA(30), CUG(34), UUA(22), UUG(32), ATG(37), AUG(37), AAT(31),
AAC(33), AAU(31), CCT(38), CCC(35), CCA(38), CCG(39), CCU(38),
CAA(34), CAG(40), CGT(38), CGC(40), CGA(41), CGG(41), AGA(36),
AGG(37), CGU(38), TCT(35), TCC(39), TCA(39), TCG(41), AGT(35),
AGC(38), UCU(35), UCC(39), UCA(39), UCG(41), AGU(35), ACT(35),
ACC(35), ACA(35), ACG(37), ACU(35), GTT(36), GTC(40), GTA(32),
GTG(37), GUU(36), GUC(40), GUA(32), GUG(37), TGG(37), UGG(37),
TAT(23), TAC(34), UAU(23), UAC(34),
Link: NZ_CP047180.1
Rathayibacter festucae
Codon (Counts):
GCT(14), GCC(15), GCA(13), GCG(17), GCU(14), TGT(10), TGC(15),Total Codons: 1,186
UGU(10), UGC(15), GAT(17), GAC(15), GAU(17), GAA(15), GAG(15),
TTT(4), TTC(13), UUU(4), UUC(13), GGT(15), GGC(15), GGA(15),
GGG(14), GGU(15), CAT(12), CAC(12), CAU(12), ATT(11), ATC(15),
ATA(5), AUU(11), AUC(15), AUA(5), AAA(7), AAG(12), CTT(14),
CTC(15), CTA(10), CTG(15), TTA(6), TTG(9), CUU(14), CUC(15),
CUA(10), CUG(15), UUA(6), UUG(9), ATG(16), AUG(16), AAT(11),
AAC(10), AAU(11), CCT(13), CCC(12), CCA(11), CCG(15), CCU(13),
CAA(10), CAG(13), CGT(14), CGC(15), CGA(15), CGG(15), AGA(16),
AGG(13), CGU(14), TCT(13), TCC(15), TCA(13), TCG(16), AGT(10),
AGC(13), UCU(13), UCC(15), UCA(13), UCG(16), AGU(10), ACT(13),
ACC(13), ACA(11), ACG(13), ACU(13), GTT(10), GTC(16), GTA(8),
GTG(13), GUU(10), GUC(16), GUA(8), GUG(13), TGG(15), UGG(15),
TAT(6), TAC(11), UAU(6), UAC(11),
Link: NZ_CP085791.1
Pasteurella canis
Codon (Counts):
GCT(12924), GCC(10956), GCA(13407), GCG(11023), GCU(12924), TGT(13404), TGC(13342),Total Codons: 1,230,460
UGU(13404), UGC(13342), GAT(13783), GAC(10977), GAU(13783), GAA(13818), GAG(11420),
TTT(15383), TTC(13555), UUU(15383), UUC(13555), GGT(11854), GGC(10926), GGA(11384),
GGG(8992), GGU(11854), CAT(13767), CAC(12329), CAU(13767), ATT(16092), ATC(13838),
ATA(14798), AUU(16092), AUC(13838), AUA(14798), AAA(15601), AAG(14072), CTT(14045),
CTC(11116), CTA(12915), CTG(12469), TTA(15769), TTG(14675), CUU(14045), CUC(11116),
CUA(12915), CUG(12469), UUA(15769), UUG(14675), ATG(13804), AUG(13804), AAT(16170),
AAC(14113), AAU(16170), CCT(11455), CCC(9161), CCA(12556), CCG(9300), CCU(11455),
CAA(14849), CAG(12321), CGT(11634), CGC(10895), CGA(11423), CGG(9249), AGA(13012),
AGG(11711), CGU(11634), TCT(12948), TCC(11179), TCA(14055), TCG(11236), AGT(13367),
AGC(13029), UCU(12948), UCC(11179), UCA(14055), UCG(11236), AGU(13367), ACT(13330),
ACC(11986), ACA(13568), ACG(11516), ACU(13330), GTT(13900), GTC(11109), GTA(13182),
GTG(12089), GUU(13900), GUC(11109), GUA(13182), GUG(12089), TGG(12386), UGG(12386),
TAT(14772), TAC(13088), UAU(14772), UAC(13088),
Link: NC_007795.1
Staphylococcus aureus
Codon (Counts):
GCT(2645), GCC(2072), GCA(2709), GCG(2018), GCU(2645), TGT(3077), TGC(2764),Total Codons: 265,368
UGU(3077), UGC(2764), GAT(3013), GAC(2379), GAU(3013), GAA(2950), GAG(2082),
TTT(3429), TTC(3127), UUU(3429), UUC(3127), GGT(2457), GGC(2040), GGA(2271),
GGG(1552), GGU(2457), CAT(3201), CAC(2554), CAU(3201), ATT(3637), ATC(3089),
ATA(3435), AUU(3637), AUC(3089), AUA(3435), AAA(3388), AAG(2971), CTT(3136),
CTC(2268), CTA(2907), CTG(2556), TTA(3518), TTG(3228), CUU(3136), CUC(2268),
CUA(2907), CUG(2556), UUA(3518), UUG(3228), ATG(3079), AUG(3079), AAT(3605),
AAC(3064), AAU(3605), CCT(2502), CCC(1732), CCA(2625), CCG(1837), CCU(2502),
CAA(3174), CAG(2498), CGT(2498), CGC(2100), CGA(2380), CGG(1729), AGA(2735),
AGG(2313), CGU(2498), TCT(2907), TCC(2423), TCA(3168), TCG(2470), AGT(2855),
AGC(2577), UCU(2907), UCC(2423), UCA(3168), UCG(2470), AGU(2855), ACT(2933),
ACC(2586), ACA(3021), ACG(2433), ACU(2933), GTT(3077), GTC(2445), GTA(2932),
GTG(2500), GUU(3077), GUC(2445), GUA(2932), GUG(2500), TGG(2536), UGG(2536),
TAT(3416), TAC(2956), UAU(3416), UAC(2956),
Link: CP030241.1
Moraxella bovis
Codon (Counts):
GCT(2153), GCC(2182), GCA(2245), GCG(1937), GCU(2153), TGT(2246), TGC(2229),Total Codons: 206,096
UGU(2246), UGC(2229), GAT(2287), GAC(2030), GAU(2287), GAA(2058), GAG(1831),
TTT(2514), TTC(2066), UUU(2514), UUC(2066), GGT(2130), GGC(2152), GGA(1874),
GGG(1877), GGU(2130), CAT(2374), CAC(2115), CAU(2374), ATT(2543), ATC(2342),
ATA(2381), AUU(2543), AUC(2342), AUA(2381), AAA(2554), AAG(2296), CTT(2305),
CTC(1872), CTA(1971), CTG(2042), TTA(2452), TTG(2472), CUU(2305), CUC(1872),
CUA(1971), CUG(2042), UUA(2452), UUG(2472), ATG(2402), AUG(2402), AAT(2605),
AAC(2270), AAU(2605), CCT(1987), CCC(1912), CCA(2333), CCG(1850), CCU(1987),
CAA(2531), CAG(2048), CGT(1978), CGC(1962), CGA(1949), CGG(1826), AGA(2042),
AGG(1990), CGU(1978), TCT(2080), TCC(1867), TCA(2399), TCG(1931), AGT(2059),
AGC(2146), UCU(2080), UCC(1867), UCA(2399), UCG(1931), AGU(2059), ACT(2056),
ACC(2180), ACA(2228), ACG(2000), ACU(2056), GTT(2215), GTC(2025), GTA(2089),
GTG(2076), GUU(2215), GUC(2025), GUA(2089), GUG(2076), TGG(2297), UGG(2297),
TAT(2354), TAC(2040), UAU(2354), UAC(2040),
Link: NC_002516.2
Pseudomonas aeruginosa
Codon (Counts):
GCT(659), GCC(711), GCA(675), GCG(676), GCU(659), TGT(575), TGC(659),Total Codons: 57,902
UGU(575), UGC(659), GAT(630), GAC(635), GAU(630), GAA(645), GAG(602),
TTT(525), TTC(660), UUU(525), UUC(660), GGT(629), GGC(707), GGA(630),
GGG(591), GGU(629), CAT(629), CAC(612), CAU(629), ATT(548), ATC(647),
ATA(506), AUU(548), AUC(647), AUA(506), AAA(533), AAG(612), CTT(624),
CTC(619), CTA(515), CTG(660), TTA(389), TTG(593), CUU(624), CUC(619),
CUA(515), CUG(660), UUA(389), UUG(593), ATG(617), AUG(617), AAT(557),
AAC(620), AAU(557), CCT(661), CCC(636), CCA(671), CCG(697), CCU(661),
CAA(625), CAG(664), CGT(626), CGC(687), CGA(672), CGG(681), AGA(574),
AGG(653), CGU(626), TCT(580), TCC(664), TCA(618), TCG(681), AGT(560),
AGC(657), UCU(580), UCC(664), UCA(618), UCG(681), AGU(560), ACT(575),
ACC(645), ACA(566), ACG(623), ACU(575), GTT(622), GTC(634), GTA(545),
GTG(588), GUU(622), GUC(634), GUA(545), GUG(588), TGG(644), UGG(644),
TAT(509), TAC(553), UAU(509), UAC(553),
Link: NZ_CP034725.1
Pseudomonas brassicacearum
Codon (Counts):
GCT(1185), GCC(1266), GCA(1229), GCG(1246), GCU(1185), TGT(1102), TGC(1223),Total Codons: 107,658
UGU(1102), UGC(1223), GAT(1187), GAC(1152), GAU(1187), GAA(1197), GAG(1112),
TTT(1077), TTC(1189), UUU(1077), UUC(1189), GGT(1156), GGC(1251), GGA(1140),
GGG(1099), GGU(1156), CAT(1168), CAC(1144), CAU(1168), ATT(1103), ATC(1180),
ATA(988), AUU(1103), AUC(1180), AUA(988), AAA(1091), AAG(1184), CTT(1129),
CTC(1102), CTA(890), CTG(1226), TTA(920), TTG(1169), CUU(1129), CUC(1102),
CUA(890), CUG(1226), UUA(920), UUG(1169), ATG(1168), AUG(1168), AAT(1102),
AAC(1164), AAU(1102), CCT(1149), CCC(1112), CCA(1203), CCG(1222), CCU(1149),
CAA(1201), CAG(1202), CGT(1172), CGC(1261), CGA(1217), CGG(1202), AGA(1087),
AGG(1161), CGU(1172), TCT(1046), TCC(1126), TCA(1183), TCG(1222), AGT(1054),
AGC(1204), UCU(1046), UCC(1126), UCA(1183), UCG(1222), AGU(1054), ACT(1059),
ACC(1176), ACA(1096), ACG(1155), ACU(1059), GTT(1158), GTC(1134), GTA(1008),
GTG(1160), GUU(1158), GUC(1134), GUA(1008), GUG(1160), TGG(1197), UGG(1197),
TAT(1001), TAC(1009), UAU(1001), UAC(1009),
Link: CP014945.1
Psychrobacter alimentarius
Codon (Counts):
GCT(6118), GCC(5528), GCA(6026), GCG(5402), GCU(6118), TGT(5904), TGC(6060),Total Codons: 559,460
UGU(5904), UGC(6060), GAT(6228), GAC(5584), GAU(6228), GAA(5738), GAG(5244),
TTT(6482), TTC(5852), UUU(6482), UUC(5852), GGT(5604), GGC(5494), GGA(4870),
GGG(4264), GGU(5604), CAT(6350), CAC(5524), CAU(6350), ATT(6712), ATC(6296),
ATA(6784), AUU(6712), AUC(6296), AUA(6784), AAA(6536), AAG(6288), CTT(6342),
CTC(5222), CTA(5782), CTG(5880), TTA(6600), TTG(6446), CUU(6342), CUC(5222),
CUA(5782), CUG(5880), UUA(6600), UUG(6446), ATG(6274), AUG(6274), AAT(6820),
AAC(6088), AAU(6820), CCT(5350), CCC(4304), CCA(5904), CCG(4680), CCU(5350),
CAA(6578), CAG(5998), CGT(5508), CGC(5370), CGA(5412), CGG(4638), AGA(5814),
AGG(5434), CGU(5508), TCT(5768), TCC(4844), TCA(6544), TCG(5368), AGT(5964),
AGC(6220), UCU(5768), UCC(4844), UCA(6544), UCG(5368), AGU(5964), ACT(6026),
ACC(5690), ACA(5990), ACG(5530), ACU(6026), GTT(5986), GTC(5546), GTA(5976),
GTG(5468), GUU(5986), GUC(5546), GUA(5976), GUG(5468), TGG(5828), UGG(5828),
TAT(6674), TAC(6050), UAU(6674), UAC(6050),
Link: NZ_CP042804.1
Pseudomonas amygdali
Codon (Counts):
GCT(1659), GCC(1695), GCA(1702), GCG(1672), GCU(1659), TGT(1514), TGC(1684),Total Codons: 148,757
UGU(1514), UGC(1684), GAT(1600), GAC(1581), GAU(1600), GAA(1631), GAG(1522),
TTT(1508), TTC(1626), UUU(1508), UUC(1626), GGT(1569), GGC(1706), GGA(1506),
GGG(1447), GGU(1569), CAT(1595), CAC(1559), CAU(1595), ATT(1551), ATC(1633),
ATA(1429), AUU(1551), AUC(1633), AUA(1429), AAA(1546), AAG(1623), CTT(1597),
CTC(1501), CTA(1297), CTG(1710), TTA(1362), TTG(1610), CUU(1597), CUC(1501),
CUA(1297), CUG(1710), UUA(1362), UUG(1610), ATG(1607), AUG(1607), AAT(1571),
AAC(1600), AAU(1571), CCT(1587), CCC(1490), CCA(1610), CCG(1630), CCU(1587),
CAA(1647), CAG(1702), CGT(1564), CGC(1675), CGA(1658), CGG(1597), AGA(1502),
AGG(1582), CGU(1564), TCT(1518), TCC(1522), TCA(1659), TCG(1625), AGT(1504),
AGC(1681), UCU(1518), UCC(1522), UCA(1659), UCG(1625), AGU(1504), ACT(1482),
ACC(1595), ACA(1532), ACG(1592), ACU(1482), GTT(1574), GTC(1576), GTA(1458),
GTG(1532), GUU(1574), GUC(1576), GUA(1458), GUG(1532), TGG(1612), UGG(1612),
TAT(1442), TAC(1459), UAU(1442), UAC(1459),
Link: NZ_CP026512.1
Candidatus Pseudomonas adelgestsugas
Codon (Counts):
GCT(1786), GCC(1463), GCA(1770), GCG(1476), GCU(1786), TGT(1711), TGC(1742),Total Codons: 157,455
UGU(1711), UGC(1742), GAT(1740), GAC(1448), GAU(1740), GAA(1579), GAG(1365),
TTT(1858), TTC(1610), UUU(1858), UUC(1610), GGT(1538), GGC(1472), GGA(1265),
GGG(974), GGU(1538), CAT(1773), CAC(1548), CAU(1773), ATT(1982), ATC(1729),
ATA(2007), AUU(1982), AUC(1729), AUA(2007), AAA(1852), AAG(1762), CTT(1767),
CTC(1391), CTA(1891), CTG(1665), TTA(2028), TTG(1792), CUU(1767), CUC(1391),
CUA(1891), CUG(1665), UUA(2028), UUG(1792), ATG(1752), AUG(1752), AAT(1968),
AAC(1770), AAU(1968), CCT(1479), CCC(954), CCA(1575), CCG(1173), CCU(1479),
CAA(1802), CAG(1688), CGT(1478), CGC(1483), CGA(1404), CGG(1209), AGA(1675),
AGG(1487), CGU(1478), TCT(1693), TCC(1274), TCA(1719), TCG(1398), AGT(1810),
AGC(1811), UCU(1693), UCC(1274), UCA(1719), UCG(1398), AGU(1810), ACT(1837),
ACC(1539), ACA(1721), ACG(1514), ACU(1837), GTT(1774), GTC(1459), GTA(1788),
GTG(1546), GUU(1774), GUC(1459), GUA(1788), GUG(1546), TGG(1558), UGG(1558),
TAT(1991), TAC(1804), UAU(1991), UAC(1804),
Link: NZ_CP021524.1
Acetobacter ascendens
Codon (Counts):
GCT(1455), GCC(1514), GCA(1532), GCG(1417), GCU(1455), TGT(1444), TGC(1540),Total Codons: 133,350
UGU(1444), UGC(1540), GAT(1454), GAC(1149), GAU(1454), GAA(1467), GAG(1220),
TTT(1500), TTC(1504), UUU(1500), UUC(1504), GGT(1397), GGC(1504), GGA(1368),
GGG(1318), GGU(1397), CAT(1506), CAC(1369), CAU(1506), ATT(1495), ATC(1451),
ATA(1484), AUU(1495), AUC(1451), AUA(1484), AAA(1488), AAG(1457), CTT(1448),
CTC(1186), CTA(1237), CTG(1530), TTA(1435), TTG(1462), CUU(1448), CUC(1186),
CUA(1237), CUG(1530), UUA(1435), UUG(1462), ATG(1501), AUG(1501), AAT(1477),
AAC(1452), AAU(1477), CCT(1375), CCC(1273), CCA(1485), CCG(1401), CCU(1375),
CAA(1460), CAG(1522), CGT(1341), CGC(1420), CGA(1179), CGG(1392), AGA(1438),
AGG(1377), CGU(1341), TCT(1418), TCC(1374), TCA(1412), TCG(1141), AGT(1265),
AGC(1463), UCU(1418), UCC(1374), UCA(1412), UCG(1141), AGU(1265), ACT(1239),
ACC(1368), ACA(1410), ACG(1353), ACU(1239), GTT(1481), GTC(1166), GTA(1332),
GTG(1405), GUU(1481), GUC(1166), GUA(1332), GUG(1405), TGG(1496), UGG(1496),
TAT(1472), TAC(1354), UAU(1472), UAC(1354),
Link: NC_007633.1
Mycoplasma capricolum
Codon (Counts):
GCT(962), GCC(441), GCA(886), GCG(311), GCU(962), TGT(1063), TGC(879),Total Codons: 89,922
UGU(1063), UGC(879), GAT(1082), GAC(672), GAU(1082), GAA(1056), GAG(721),
TTT(1355), TTC(1153), UUU(1355), UUC(1153), GGT(825), GGC(426), GGA(757),
GGG(389), GGU(825), CAT(1102), CAC(801), CAU(1102), ATT(1405), ATC(1150),
ATA(1298), AUU(1405), AUC(1150), AUA(1298), AAA(1350), AAG(1112), CTT(1180),
CTC(790), CTA(1128), CTG(851), TTA(1407), TTG(1192), CUU(1180), CUC(790),
CUA(1128), CUG(851), UUA(1407), UUG(1192), ATG(1005), AUG(1005), AAT(1415),
AAC(1157), AAU(1415), CCT(812), CCC(412), CCA(873), CCG(276), CCU(812),
CAA(1143), CAG(861), CGT(494), CGC(328), CGA(434), CGG(251), AGA(1004),
AGG(779), CGU(494), TCT(1127), TCC(835), TCA(1175), TCG(438), AGT(1128),
AGC(961), UCU(1127), UCC(835), UCA(1175), UCG(438), AGU(1128), ACT(1121),
ACC(835), ACA(1037), ACG(469), ACU(1121), GTT(1177), GTC(684), GTA(999),
GTG(755), GUU(1177), GUC(684), GUA(999), GUG(755), TGG(832), UGG(832),
TAT(1286), TAC(985), UAU(1286), UAC(985),
Link: NZ_CP074346.1
Pasteurella atlantica
Codon (Counts):
GCT(4508), GCC(3696), GCA(4626), GCG(3440), GCU(4508), TGT(4820), TGC(4636),Total Codons: 441,390
UGU(4820), UGC(4636), GAT(5032), GAC(3632), GAU(5032), GAA(4970), GAG(4016),
TTT(5728), TTC(5042), UUU(5728), UUC(5042), GGT(4416), GGC(3728), GGA(4118),
GGG(3326), GGU(4416), CAT(4816), CAC(4248), CAU(4816), ATT(5994), ATC(5026),
ATA(5514), AUU(5994), AUC(5026), AUA(5514), AAA(5776), AAG(5082), CTT(5154),
CTC(4020), CTA(4620), CTG(4352), TTA(5816), TTG(5364), CUU(5154), CUC(4020),
CUA(4620), CUG(4352), UUA(5816), UUG(5364), ATG(4882), AUG(4882), AAT(6028),
AAC(5100), AAU(6028), CCT(4260), CCC(3338), CCA(4442), CCG(3270), CCU(4260),
CAA(5344), CAG(4278), CGT(4040), CGC(3484), CGA(3796), CGG(3248), AGA(4690),
AGG(4240), CGU(4040), TCT(4840), TCC(4062), TCA(5108), TCG(3902), AGT(4764),
AGC(4424), UCU(4840), UCC(4062), UCA(5108), UCG(3902), AGU(4764), ACT(4744),
ACC(4414), ACA(4756), ACG(3980), ACU(4744), GTT(5074), GTC(3656), GTA(4750),
GTG(4266), GUU(5074), GUC(3656), GUA(4750), GUG(4266), TGG(4472), UGG(4472),
TAT(5550), TAC(4708), UAU(5550), UAC(4708),
Link: CP050313.1
Shewanella aestuarii
Codon (Counts):
GCT(6196), GCC(5726), GCA(6154), GCG(5432), GCU(6196), TGT(5958), TGC(6176),Total Codons: 560,956
UGU(5958), UGC(6176), GAT(6176), GAC(5198), GAU(6176), GAA(5830), GAG(5098),
TTT(6662), TTC(5914), UUU(6662), UUC(5914), GGT(5730), GGC(5706), GGA(4904),
GGG(4692), GGU(5730), CAT(6328), CAC(5646), CAU(6328), ATT(6928), ATC(6288),
ATA(6418), AUU(6928), AUC(6288), AUA(6418), AAA(6718), AAG(6310), CTT(6314),
CTC(5154), CTA(5800), CTG(5832), TTA(6884), TTG(6622), CUU(6314), CUC(5154),
CUA(5800), CUG(5832), UUA(6884), UUG(6622), ATG(6320), AUG(6320), AAT(6984),
AAC(6412), AAU(6984), CCT(5382), CCC(4702), CCA(6076), CCG(4922), CCU(5382),
CAA(6758), CAG(5842), CGT(5224), CGC(5468), CGA(5358), CGG(4918), AGA(5496),
AGG(5420), CGU(5224), TCT(5554), TCC(4860), TCA(6476), TCG(5380), AGT(5900),
AGC(6190), UCU(5554), UCC(4860), UCA(6476), UCG(5380), AGU(5900), ACT(6014),
ACC(5836), ACA(6040), ACG(5228), ACU(6014), GTT(6308), GTC(5186), GTA(5814),
GTG(5514), GUU(6308), GUC(5186), GUA(5814), GUG(5514), TGG(5952), UGG(5952),
TAT(6414), TAC(5776), UAU(6414), UAC(5776),
Link: LT906448.1
Pasteurella dagmatis
Codon (Counts):
GCT(3414), GCC(3018), GCA(3604), GCG(2974), GCU(3414), TGT(3528), TGC(3582),Total Codons: 331,440
UGU(3528), UGC(3582), GAT(3718), GAC(2882), GAU(3718), GAA(3794), GAG(3052),
TTT(4132), TTC(3740), UUU(4132), UUC(3740), GGT(3378), GGC(2964), GGA(3130),
GGG(2560), GGU(3378), CAT(3638), CAC(3362), CAU(3638), ATT(4332), ATC(3706),
ATA(3874), AUU(4332), AUC(3706), AUA(3874), AAA(4120), AAG(3818), CTT(3780),
CTC(3034), CTA(3394), CTG(3308), TTA(4144), TTG(3942), CUU(3780), CUC(3034),
CUA(3394), CUG(3308), UUA(4144), UUG(3942), ATG(3608), AUG(3608), AAT(4320),
AAC(3710), AAU(4320), CCT(3120), CCC(2562), CCA(3466), CCG(2736), CCU(3120),
CAA(3952), CAG(3340), CGT(3136), CGC(3030), CGA(3056), CGG(2670), AGA(3506),
AGG(3182), CGU(3136), TCT(3486), TCC(3106), TCA(3770), TCG(3090), AGT(3554),
AGC(3462), UCU(3486), UCC(3106), UCA(3770), UCG(3090), AGU(3554), ACT(3556),
ACC(3318), ACA(3576), ACG(3128), ACU(3556), GTT(3700), GTC(2900), GTA(3512),
GTG(3362), GUU(3700), GUC(2900), GUA(3512), GUG(3362), TGG(3454), UGG(3454),
TAT(3890), TAC(3526), UAU(3890), UAC(3526),
Link: NZ_CP066013.1
Staphylococcus equorum
Codon (Counts):
GCT(2708), GCC(2131), GCA(2748), GCG(2133), GCU(2708), TGT(3092), TGC(2791),Total Codons: 273,208
UGU(3092), UGC(2791), GAT(3121), GAC(2400), GAU(3121), GAA(3107), GAG(2286),
TTT(3551), TTC(3179), UUU(3551), UUC(3179), GGT(2553), GGC(2107), GGA(2448),
GGG(1712), GGU(2553), CAT(3229), CAC(2642), CAU(3229), ATT(3778), ATC(3122),
ATA(3616), AUU(3778), AUC(3122), AUA(3616), AAA(3549), AAG(3132), CTT(3183),
CTC(2293), CTA(2999), CTG(2593), TTA(3658), TTG(3257), CUU(3183), CUC(2293),
CUA(2999), CUG(2593), UUA(3658), UUG(3257), ATG(3218), AUG(3218), AAT(3792),
AAC(3162), AAU(3792), CCT(2516), CCC(1820), CCA(2766), CCG(1819), CCU(2516),
CAA(3289), CAG(2590), CGT(2506), CGC(2135), CGA(2421), CGG(1784), AGA(2887),
AGG(2483), CGU(2506), TCT(2975), TCC(2482), TCA(3247), TCG(2389), AGT(3016),
AGC(2693), UCU(2975), UCC(2482), UCA(3247), UCG(2389), AGU(3016), ACT(3033),
ACC(2671), ACA(3071), ACG(2532), ACU(3033), GTT(3091), GTC(2444), GTA(3033),
GTG(2596), GUU(3091), GUC(2444), GUA(3033), GUG(2596), TGG(2661), UGG(2661),
TAT(3574), TAC(3049), UAU(3574), UAC(3049),
Link: NC_013530.1
Xylanimonas cellulosilytica
Codon (Counts):
GCT(5), GCC(6), GCA(7), GCG(6), GCU(5), TGT(6), TGC(7),Total Codons: 530
UGU(6), UGC(7), GAT(5), GAC(5), GAU(5), GAA(6), GAG(5),
TTT(5), TTC(6), UUU(5), UUC(6), GGT(7), GGC(7), GGA(5),
GGG(5), GGU(7), CAT(6), CAC(7), CAU(6), ATT(7), ATC(5),
ATA(5), AUU(7), AUC(5), AUA(5), AAA(6), AAG(6), CTT(6),
CTC(5), CTA(5), CTG(5), TTA(3), TTG(6), CUU(6), CUC(5),
CUA(5), CUG(5), UUA(3), UUG(6), ATG(5), AUG(5), AAT(5),
AAC(5), AAU(5), CCT(5), CCC(5), CCA(6), CCG(7), CCU(5),
CAA(7), CAG(5), CGT(6), CGC(7), CGA(6), CGG(6), AGA(4),
AGG(6), CGU(6), TCT(5), TCC(6), TCA(6), TCG(5), AGT(6),
AGC(5), UCU(5), UCC(6), UCA(6), UCG(5), AGU(6), ACT(5),
ACC(5), ACA(5), ACG(6), ACU(5), GTT(3), GTC(7), GTA(6),
GTG(7), GUU(3), GUC(7), GUA(6), GUG(7), TGG(5), UGG(5),
TAT(4), TAC(7), UAU(4), UAC(7),
Link: NZ_CP033732.1
Staphylococcus hominis
Codon (Counts):
GCT(2263), GCC(1700), GCA(2336), GCG(1707), GCU(2263), TGT(2665), TGC(2302),Total Codons: 235,038
UGU(2665), UGC(2302), GAT(2743), GAC(2066), GAU(2743), GAA(2742), GAG(2035),
TTT(3085), TTC(2745), UUU(3085), UUC(2745), GGT(2202), GGC(1687), GGA(2122),
GGG(1412), GGU(2202), CAT(2823), CAC(2200), CAU(2823), ATT(3280), ATC(2744),
ATA(3130), AUU(3280), AUC(2744), AUA(3130), AAA(3085), AAG(2741), CTT(2748),
CTC(2023), CTA(2548), CTG(2187), TTA(3234), TTG(2794), CUU(2748), CUC(2023),
CUA(2548), CUG(2187), UUA(3234), UUG(2794), ATG(2834), AUG(2834), AAT(3303),
AAC(2702), AAU(3303), CCT(2188), CCC(1435), CCA(2270), CCG(1399), CCU(2188),
CAA(2793), CAG(2210), CGT(2166), CGC(1713), CGA(2037), CGG(1399), AGA(2591),
AGG(2155), CGU(2166), TCT(2613), TCC(2175), TCA(2803), TCG(2067), AGT(2628),
AGC(2286), UCU(2613), UCC(2175), UCA(2803), UCG(2067), AGU(2628), ACT(2611),
ACC(2216), ACA(2659), ACG(2180), ACU(2611), GTT(2729), GTC(2075), GTA(2686),
GTG(2190), GUU(2729), GUC(2075), GUA(2686), GUG(2190), TGG(2237), UGG(2237),
TAT(3106), TAC(2653), UAU(3106), UAC(2653),
Link: NZ_CP006932.1
Candidatus Hepatoplasma crinochetorum
Codon (Counts):
GCT(661), GCC(314), GCA(699), GCG(304), GCU(661), TGT(818), TGC(725),Total Codons: 72,361
UGU(818), UGC(725), GAT(933), GAC(432), GAU(933), GAA(951), GAG(575),
TTT(1152), TTC(984), UUU(1152), UUC(984), GGT(569), GGC(313), GGA(690),
GGG(323), GGU(569), CAT(854), CAC(551), CAU(854), ATT(1229), ATC(958),
ATA(1101), AUU(1229), AUC(958), AUA(1101), AAA(1118), AAG(922), CTT(960),
CTC(613), CTA(801), CTG(677), TTA(1160), TTG(971), CUU(960), CUC(613),
CUA(801), CUG(677), UUA(1160), UUG(971), ATG(822), AUG(822), AAT(1211),
AAC(830), AAU(1211), CCT(674), CCC(365), CCA(664), CCG(310), CCU(674),
CAA(958), CAG(654), CGT(384), CGC(296), CGA(525), CGG(334), AGA(898),
AGG(636), CGU(384), TCT(937), TCC(725), TCA(960), TCG(520), AGT(795),
AGC(646), UCU(937), UCC(725), UCA(960), UCG(520), AGU(795), ACT(794),
ACC(575), ACA(813), ACG(399), ACU(794), GTT(830), GTC(463), GTA(797),
GTG(532), GUU(830), GUC(463), GUA(797), GUG(532), TGG(656), UGG(656),
TAT(1094), TAC(773), UAU(1094), UAC(773),
Link: NZ_CP062252.1
Pseudomonas allokribbensis
Codon (Counts):
GCT(1155), GCC(1220), GCA(1208), GCG(1209), GCU(1155), TGT(1049), TGC(1186),Total Codons: 104,631
UGU(1049), UGC(1186), GAT(1149), GAC(1148), GAU(1149), GAA(1152), GAG(1072),
TTT(1057), TTC(1163), UUU(1057), UUC(1163), GGT(1094), GGC(1218), GGA(1095),
GGG(1020), GGU(1094), CAT(1144), CAC(1115), CAU(1144), ATT(1080), ATC(1176),
ATA(927), AUU(1080), AUC(1176), AUA(927), AAA(1072), AAG(1127), CTT(1113),
CTC(1091), CTA(885), CTG(1164), TTA(891), TTG(1116), CUU(1113), CUC(1091),
CUA(885), CUG(1164), UUA(891), UUG(1116), ATG(1120), AUG(1120), AAT(1078),
AAC(1147), AAU(1078), CCT(1104), CCC(1078), CCA(1176), CCG(1186), CCU(1104),
CAA(1175), CAG(1215), CGT(1115), CGC(1224), CGA(1191), CGG(1178), AGA(1049),
AGG(1112), CGU(1115), TCT(1056), TCC(1110), TCA(1169), TCG(1178), AGT(1067),
AGC(1179), UCU(1056), UCC(1110), UCA(1169), UCG(1178), AGU(1067), ACT(1055),
ACC(1129), ACA(1112), ACG(1122), ACU(1055), GTT(1109), GTC(1124), GTA(975),
GTG(1092), GUU(1109), GUC(1124), GUA(975), GUG(1092), TGG(1129), UGG(1129),
TAT(930), TAC(1000), UAU(930), UAC(1000),
Link: NZ_CP065712.1
Staphylococcus auricularis
Codon (Counts):
GCT(2213), GCC(1820), GCA(2297), GCG(1984), GCU(2213), TGT(2517), TGC(2277),Total Codons: 224,969
UGU(2517), UGC(2277), GAT(2655), GAC(2198), GAU(2655), GAA(2598), GAG(2050),
TTT(2729), TTC(2542), UUU(2729), UUC(2542), GGT(2164), GGC(1855), GGA(2122),
GGG(1581), GGU(2164), CAT(2612), CAC(2270), CAU(2612), ATT(2897), ATC(2626),
ATA(2726), AUU(2897), AUC(2626), AUA(2726), AAA(2819), AAG(2594), CTT(2495),
CTC(1999), CTA(2281), CTG(2186), TTA(2818), TTG(2605), CUU(2495), CUC(1999),
CUA(2281), CUG(2186), UUA(2818), UUG(2605), ATG(2673), AUG(2673), AAT(2898),
AAC(2584), AAU(2898), CCT(2058), CCC(1586), CCA(2203), CCG(1774), CCU(2058),
CAA(2628), CAG(2212), CGT(2263), CGC(1999), CGA(2266), CGG(1777), AGA(2419),
AGG(2103), CGU(2263), TCT(2388), TCC(2038), TCA(2680), TCG(2228), AGT(2397),
AGC(2235), UCU(2388), UCC(2038), UCA(2680), UCG(2228), AGU(2397), ACT(2363),
ACC(2180), ACA(2520), ACG(2287), ACU(2363), GTT(2548), GTC(2110), GTA(2422),
GTG(2270), GUU(2548), GUC(2110), GUA(2422), GUG(2270), TGG(2204), UGG(2204),
TAT(2719), TAC(2403), UAU(2719), UAC(2403),
Link: NZ_CP077080.1
Pseudomonas alvandae
Codon (Counts):
GCT(1231), GCC(1313), GCA(1268), GCG(1287), GCU(1231), TGT(1114), TGC(1266),Total Codons: 111,679
UGU(1114), UGC(1266), GAT(1226), GAC(1202), GAU(1226), GAA(1234), GAG(1177),
TTT(1109), TTC(1217), UUU(1109), UUC(1217), GGT(1193), GGC(1308), GGA(1197),
GGG(1145), GGU(1193), CAT(1218), CAC(1186), CAU(1218), ATT(1130), ATC(1242),
ATA(1023), AUU(1130), AUC(1242), AUA(1023), AAA(1121), AAG(1192), CTT(1182),
CTC(1138), CTA(943), CTG(1270), TTA(955), TTG(1208), CUU(1182), CUC(1138),
CUA(943), CUG(1270), UUA(955), UUG(1208), ATG(1217), AUG(1217), AAT(1154),
AAC(1208), AAU(1154), CCT(1197), CCC(1187), CCA(1265), CCG(1281), CCU(1197),
CAA(1239), CAG(1262), CGT(1205), CGC(1292), CGA(1264), CGG(1259), AGA(1126),
AGG(1202), CGU(1205), TCT(1093), TCC(1199), TCA(1213), TCG(1254), AGT(1077),
AGC(1250), UCU(1093), UCC(1199), UCA(1213), UCG(1254), AGU(1077), ACT(1092),
ACC(1219), ACA(1168), ACG(1205), ACU(1092), GTT(1180), GTC(1178), GTA(1050),
GTG(1165), GUU(1180), GUC(1178), GUA(1050), GUG(1165), TGG(1252), UGG(1252),
TAT(1052), TAC(1068), UAU(1052), UAC(1068),
Link: NZ_CP027770.1
Staphylococcus felis
Codon (Counts):
GCT(2434), GCC(2040), GCA(2491), GCG(2072), GCU(2434), TGT(2786), TGC(2506),Total Codons: 246,551
UGU(2786), UGC(2506), GAT(2881), GAC(2318), GAU(2881), GAA(2860), GAG(2222),
TTT(3120), TTC(2829), UUU(3120), UUC(2829), GGT(2294), GGC(1993), GGA(2313),
GGG(1685), GGU(2294), CAT(2890), CAC(2389), CAU(2890), ATT(3278), ATC(2848),
ATA(3117), AUU(3278), AUC(2848), AUA(3117), AAA(3142), AAG(2861), CTT(2817),
CTC(2182), CTA(2548), CTG(2302), TTA(3140), TTG(2957), CUU(2817), CUC(2182),
CUA(2548), CUG(2302), UUA(3140), UUG(2957), ATG(2914), AUG(2914), AAT(3300),
AAC(2764), AAU(3300), CCT(2339), CCC(1718), CCA(2431), CCG(1761), CCU(2339),
CAA(2928), CAG(2337), CGT(2403), CGC(2054), CGA(2311), CGG(1746), AGA(2612),
AGG(2318), CGU(2403), TCT(2586), TCC(2301), TCA(2965), TCG(2334), AGT(2679),
AGC(2444), UCU(2586), UCC(2301), UCA(2965), UCG(2334), AGU(2679), ACT(2631),
ACC(2355), ACA(2756), ACG(2342), ACU(2631), GTT(2800), GTC(2322), GTA(2639),
GTG(2394), GUU(2800), GUC(2322), GUA(2639), GUG(2394), TGG(2381), UGG(2381),
TAT(3092), TAC(2635), UAU(3092), UAC(2635),
Link: NZ_CP046378.1
Shewanella algae
Codon (Counts):
GCT(9536), GCC(9817), GCA(9578), GCG(8827), GCU(9536), TGT(8758), TGC(9552),Total Codons: 855,298
UGU(8758), UGC(9552), GAT(9401), GAC(8454), GAU(9401), GAA(9202), GAG(8690),
TTT(9221), TTC(9159), UUU(9221), UUC(9159), GGT(8894), GGC(9658), GGA(8583),
GGG(8106), GGU(8894), CAT(9128), CAC(8682), CAU(9128), ATT(9320), ATC(9314),
ATA(9114), AUU(9320), AUC(9314), AUA(9114), AAA(9449), AAG(9572), CTT(9551),
CTC(8645), CTA(7647), CTG(9775), TTA(8763), TTG(9857), CUU(9551), CUC(8645),
CUA(7647), CUG(9775), UUA(8763), UUG(9857), ATG(9220), AUG(9220), AAT(9436),
AAC(9410), AAU(9436), CCT(9012), CCC(8229), CCA(9643), CCG(8932), CCU(9012),
CAA(9991), CAG(9780), CGT(7703), CGC(8905), CGA(8475), CGG(8859), AGA(8823),
AGG(8975), CGU(7703), TCT(8711), TCC(8548), TCA(9616), TCG(8598), AGT(8937),
AGC(9642), UCU(8711), UCC(8548), UCA(9616), UCG(8598), AGU(8937), ACT(9044),
ACC(9009), ACA(8933), ACG(7726), ACU(9044), GTT(9282), GTC(8350), GTA(8193),
GTG(8574), GUU(9282), GUC(8350), GUA(8193), GUG(8574), TGG(9518), UGG(9518),
TAT(9021), TAC(8276), UAU(9021), UAC(8276),
Link: NC_015588.1
Isoptericola variabilis
Codon (Counts):
GCT(9), GCC(13), GCA(9), GCG(13), GCU(9), TGT(8), TGC(10),Total Codons: 864
UGU(8), UGC(10), GAT(9), GAC(12), GAU(9), GAA(11), GAG(10),
TTT(5), TTC(8), UUU(5), UUC(8), GGT(11), GGC(13), GGA(12),
GGG(13), GGU(11), CAT(9), CAC(10), CAU(9), ATT(5), ATC(10),
ATA(4), AUU(5), AUC(10), AUA(4), AAA(6), AAG(8), CTT(8),
CTC(11), CTA(6), CTG(9), TTA(3), TTG(8), CUU(8), CUC(11),
CUA(6), CUG(9), UUA(3), UUG(8), ATG(9), AUG(9), AAT(6),
AAC(10), AAU(6), CCT(11), CCC(12), CCA(11), CCG(12), CCU(11),
CAA(6), CAG(11), CGT(10), CGC(11), CGA(12), CGG(13), AGA(9),
AGG(10), CGU(10), TCT(8), TCC(10), TCA(9), TCG(11), AGT(9),
AGC(11), UCU(8), UCC(10), UCA(9), UCG(11), AGU(9), ACT(9),
ACC(10), ACA(10), ACG(12), ACU(9), GTT(9), GTC(11), GTA(9),
GTG(11), GUU(9), GUC(11), GUA(9), GUG(11), TGG(10), UGG(10),
TAT(3), TAC(9), UAU(3), UAC(9),
Link: NZ_CP015515.1
Rathayibacter tritici
Codon (Counts):
GCT(87), GCC(94), GCA(85), GCG(89), GCU(87), TGT(75), TGC(84),Total Codons: 7,540
UGU(75), UGC(84), GAT(81), GAC(86), GAU(81), GAA(79), GAG(85),
TTT(68), TTC(88), UUU(68), UUC(88), GGT(79), GGC(90), GGA(86),
GGG(79), GGU(79), CAT(81), CAC(87), CAU(81), ATT(66), ATC(79),
ATA(61), AUU(66), AUC(79), AUA(61), AAA(59), AAG(74), CTT(82),
CTC(88), CTA(72), CTG(85), TTA(55), TTG(78), CUU(82), CUC(88),
CUA(72), CUG(85), UUA(55), UUG(78), ATG(79), AUG(79), AAT(68),
AAC(81), AAU(68), CCT(91), CCC(87), CCA(84), CCG(94), CCU(91),
CAA(76), CAG(83), CGT(82), CGC(96), CGA(90), CGG(93), AGA(80),
AGG(82), CGU(82), TCT(75), TCC(88), TCA(80), TCG(87), AGT(77),
AGC(83), UCU(75), UCC(88), UCA(80), UCG(87), AGU(77), ACT(84),
ACC(86), ACA(73), ACG(89), ACU(84), GTT(78), GTC(83), GTA(71),
GTG(75), GUU(78), GUC(83), GUA(71), GUG(75), TGG(80), UGG(80),
TAT(56), TAC(72), UAU(56), UAC(72),
Link: NZ_CP023044.1
Mannheimia haemolytica
Codon (Counts):
GCT(1874), GCC(1761), GCA(1949), GCG(1665), GCU(1874), TGT(1861), TGC(1950),Total Codons: 179,196
UGU(1861), UGC(1950), GAT(1969), GAC(1540), GAU(1969), GAA(2026), GAG(1703),
TTT(2198), TTC(2017), UUU(2198), UUC(2017), GGT(1829), GGC(1750), GGA(1717),
GGG(1508), GGU(1829), CAT(1929), CAC(1786), CAU(1929), ATT(2277), ATC(1983),
ATA(2072), AUU(2277), AUC(1983), AUA(2072), AAA(2240), AAG(2043), CTT(2022),
CTC(1680), CTA(1817), CTG(1759), TTA(2188), TTG(2106), CUU(2022), CUC(1680),
CUA(1817), CUG(1759), UUA(2188), UUG(2106), ATG(1933), AUG(1933), AAT(2310),
AAC(2018), AAU(2310), CCT(1736), CCC(1496), CCA(1870), CCG(1702), CCU(1736),
CAA(2138), CAG(1791), CGT(1725), CGC(1633), CGA(1733), CGG(1710), AGA(1883),
AGG(1772), CGU(1725), TCT(1845), TCC(1711), TCA(2019), TCG(1755), AGT(1859),
AGC(1904), UCU(1845), UCC(1711), UCA(2019), UCG(1755), AGU(1859), ACT(1858),
ACC(1859), ACA(1895), ACG(1682), ACU(1858), GTT(2014), GTC(1555), GTA(1853),
GTG(1799), GUU(2014), GUC(1555), GUA(1853), GUG(1799), TGG(1814), UGG(1814),
TAT(2056), TAC(1838), UAU(2056), UAC(1838),
Link: NZ_AP018587.1
Staphylococcus caprae
Codon (Counts):
GCT(2651), GCC(2129), GCA(2753), GCG(2163), GCU(2651), TGT(3046), TGC(2731),Total Codons: 275,738
UGU(3046), UGC(2731), GAT(3196), GAC(2495), GAU(3196), GAA(3265), GAG(2473),
TTT(3505), TTC(3249), UUU(3505), UUC(3249), GGT(2601), GGC(2095), GGA(2537),
GGG(1753), GGU(2601), CAT(3253), CAC(2621), CAU(3253), ATT(3754), ATC(3184),
ATA(3557), AUU(3754), AUC(3184), AUA(3557), AAA(3592), AAG(3288), CTT(3207),
CTC(2472), CTA(2968), CTG(2550), TTA(3656), TTG(3239), CUU(3207), CUC(2472),
CUA(2968), CUG(2550), UUA(3656), UUG(3239), ATG(3268), AUG(3268), AAT(3794),
AAC(3195), AAU(3794), CCT(2554), CCC(1758), CCA(2732), CCG(1790), CCU(2554),
CAA(3339), CAG(2564), CGT(2583), CGC(2208), CGA(2559), CGG(1817), AGA(3045),
AGG(2598), CGU(2583), TCT(3031), TCC(2511), TCA(3322), TCG(2544), AGT(3047),
AGC(2714), UCU(3031), UCC(2511), UCA(3322), UCG(2544), AGU(3047), ACT(3057),
ACC(2644), ACA(3058), ACG(2631), ACU(3057), GTT(3127), GTC(2481), GTA(3034),
GTG(2578), GUU(3127), GUC(2481), GUA(3034), GUG(2578), TGG(2660), UGG(2660),
TAT(3517), TAC(3034), UAU(3517), UAC(3034),
Link: NZ_CP045927.1
Staphylococcus agnetis
Codon (Counts):
GCT(2206), GCC(1932), GCA(2336), GCG(2010), GCU(2206), TGT(2560), TGC(2356),Total Codons: 227,440
UGU(2560), UGC(2356), GAT(2638), GAC(2149), GAU(2638), GAA(2599), GAG(1954),
TTT(2845), TTC(2544), UUU(2845), UUC(2544), GGT(2233), GGC(1898), GGA(2092),
GGG(1591), GGU(2233), CAT(2714), CAC(2284), CAU(2714), ATT(2993), ATC(2594),
ATA(2810), AUU(2993), AUC(2594), AUA(2810), AAA(2875), AAG(2565), CTT(2570),
CTC(1970), CTA(2315), CTG(2089), TTA(2899), TTG(2696), CUU(2570), CUC(1970),
CUA(2315), CUG(2089), UUA(2899), UUG(2696), ATG(2716), AUG(2716), AAT(2992),
AAC(2586), AAU(2992), CCT(2153), CCC(1676), CCA(2273), CCG(1745), CCU(2153),
CAA(2676), CAG(2094), CGT(2287), CGC(2046), CGA(2160), CGG(1746), AGA(2355),
AGG(2137), CGU(2287), TCT(2353), TCC(2087), TCA(2683), TCG(2163), AGT(2392),
AGC(2185), UCU(2353), UCC(2087), UCA(2683), UCG(2163), AGU(2392), ACT(2382),
ACC(2248), ACA(2567), ACG(2299), ACU(2382), GTT(2573), GTC(2136), GTA(2459),
GTG(2271), GUU(2573), GUC(2136), GUA(2459), GUG(2271), TGG(2258), UGG(2258),
TAT(2783), TAC(2461), UAU(2783), UAC(2461),
Link: NZ_CP006944.1
Mannheimia varigena
Codon (Counts):
GCT(1547), GCC(1391), GCA(1580), GCG(1343), GCU(1547), TGT(1500), TGC(1558),Total Codons: 143,417
UGU(1500), UGC(1558), GAT(1582), GAC(1184), GAU(1582), GAA(1633), GAG(1370),
TTT(1773), TTC(1599), UUU(1773), UUC(1599), GGT(1462), GGC(1387), GGA(1349),
GGG(1168), GGU(1462), CAT(1515), CAC(1386), CAU(1515), ATT(1843), ATC(1575),
ATA(1670), AUU(1843), AUC(1575), AUA(1670), AAA(1821), AAG(1655), CTT(1635),
CTC(1367), CTA(1488), CTG(1414), TTA(1785), TTG(1695), CUU(1635), CUC(1367),
CUA(1488), CUG(1414), UUA(1785), UUG(1695), ATG(1544), AUG(1544), AAT(1855),
AAC(1618), AAU(1855), CCT(1396), CCC(1183), CCA(1480), CCG(1297), CCU(1396),
CAA(1727), CAG(1425), CGT(1362), CGC(1332), CGA(1364), CGG(1310), AGA(1522),
AGG(1371), CGU(1362), TCT(1508), TCC(1344), TCA(1589), TCG(1381), AGT(1498),
AGC(1560), UCU(1508), UCC(1344), UCA(1589), UCG(1381), AGU(1498), ACT(1495),
ACC(1435), ACA(1494), ACG(1358), ACU(1495), GTT(1596), GTC(1200), GTA(1498),
GTG(1415), GUU(1596), GUC(1200), GUA(1498), GUG(1415), TGG(1484), UGG(1484),
TAT(1680), TAC(1484), UAU(1680), UAC(1484),
Link: NZ_CP077097.1
Pseudomonas anuradhapurensis
Codon (Counts):
GCT(701), GCC(740), GCA(733), GCG(717), GCU(701), TGT(627), TGC(722),Total Codons: 62,755
UGU(627), UGC(722), GAT(668), GAC(672), GAU(668), GAA(699), GAG(653),
TTT(600), TTC(694), UUU(600), UUC(694), GGT(690), GGC(747), GGA(654),
GGG(648), GGU(690), CAT(693), CAC(659), CAU(693), ATT(617), ATC(674),
ATA(558), AUU(617), AUC(674), AUA(558), AAA(605), AAG(677), CTT(679),
CTC(647), CTA(555), CTG(724), TTA(517), TTG(662), CUU(679), CUC(647),
CUA(555), CUG(724), UUA(517), UUG(662), ATG(689), AUG(689), AAT(607),
AAC(690), AAU(607), CCT(694), CCC(651), CCA(722), CCG(714), CCU(694),
CAA(696), CAG(733), CGT(662), CGC(715), CGA(708), CGG(703), AGA(624),
AGG(693), CGU(662), TCT(598), TCC(669), TCA(666), TCG(701), AGT(621),
AGC(710), UCU(598), UCC(669), UCA(666), UCG(701), AGU(621), ACT(636),
ACC(696), ACA(659), ACG(665), ACU(636), GTT(653), GTC(655), GTA(619),
GTG(677), GUU(653), GUC(655), GUA(619), GUG(677), TGG(709), UGG(709),
TAT(568), TAC(634), UAU(568), UAC(634),
Link: CP000082.1
Psychrobacter arcticus
Codon (Counts):
GCT(5292), GCC(4650), GCA(5148), GCG(4642), GCU(5292), TGT(4810), TGC(5154),Total Codons: 467,526
UGU(4810), UGC(5154), GAT(5244), GAC(4670), GAU(5244), GAA(4646), GAG(4324),
TTT(5462), TTC(4706), UUU(5462), UUC(4706), GGT(4762), GGC(4658), GGA(3926),
GGG(3594), GGU(4762), CAT(5236), CAC(4594), CAU(5236), ATT(5652), ATC(5280),
ATA(5658), AUU(5652), AUC(5280), AUA(5658), AAA(5540), AAG(5226), CTT(5334),
CTC(4308), CTA(4918), CTG(5004), TTA(5634), TTG(5392), CUU(5334), CUC(4308),
CUA(4918), CUG(5004), UUA(5634), UUG(5392), ATG(5172), AUG(5172), AAT(5762),
AAC(5078), AAU(5762), CCT(4432), CCC(3598), CCA(4886), CCG(4072), CCU(4432),
CAA(5504), CAG(5010), CGT(4510), CGC(4670), CGA(4526), CGG(4054), AGA(4768),
AGG(4412), CGU(4510), TCT(4782), TCC(3840), TCA(5398), TCG(4530), AGT(4966),
AGC(5268), UCU(4782), UCC(3840), UCA(5398), UCG(4530), AGU(4966), ACT(5068),
ACC(4806), ACA(4900), ACG(4568), ACU(5068), GTT(4954), GTC(4660), GTA(4984),
GTG(4568), GUU(4954), GUC(4660), GUA(4984), GUG(4568), TGG(4848), UGG(4848),
TAT(5626), TAC(4948), UAU(5626), UAC(4948),
Link: NZ_CP028129.1
Rathayibacter rathayi
Codon (Counts):
GCT(100), GCC(115), GCA(108), GCG(113), GCU(100), TGT(92), TGC(102),Total Codons: 9,355
UGU(92), UGC(102), GAT(108), GAC(108), GAU(108), GAA(105), GAG(110),
TTT(76), TTC(102), UUU(76), UUC(102), GGT(105), GGC(115), GGA(109),
GGG(101), GGU(105), CAT(101), CAC(108), CAU(101), ATT(81), ATC(108),
ATA(79), AUU(81), AUC(108), AUA(79), AAA(81), AAG(96), CTT(96),
CTC(109), CTA(79), CTG(100), TTA(70), TTG(87), CUU(96), CUC(109),
CUA(79), CUG(100), UUA(70), UUG(87), ATG(98), AUG(98), AAT(86),
AAC(97), AAU(86), CCT(103), CCC(106), CCA(110), CCG(114), CCU(103),
CAA(94), CAG(105), CGT(103), CGC(115), CGA(121), CGG(116), AGA(95),
AGG(106), CGU(103), TCT(99), TCC(106), TCA(99), TCG(117), AGT(93),
AGC(109), UCU(99), UCC(106), UCA(99), UCG(117), AGU(93), ACT(91),
ACC(107), ACA(90), ACG(111), ACU(91), GTT(92), GTC(110), GTA(89),
GTG(104), GUU(92), GUC(110), GUA(89), GUG(104), TGG(100), UGG(100),
TAT(76), TAC(84), UAU(76), UAC(84),
Link: NC_016941.1
Staphylococcus argenteus
Codon (Counts):
GCT(2598), GCC(2054), GCA(2660), GCG(1991), GCU(2598), TGT(3036), TGC(2686),Total Codons: 261,367
UGU(3036), UGC(2686), GAT(2967), GAC(2317), GAU(2967), GAA(2957), GAG(2106),
TTT(3409), TTC(3081), UUU(3409), UUC(3081), GGT(2433), GGC(1979), GGA(2321),
GGG(1576), GGU(2433), CAT(3160), CAC(2529), CAU(3160), ATT(3596), ATC(3042),
ATA(3422), AUU(3596), AUC(3042), AUA(3422), AAA(3363), AAG(2936), CTT(3045),
CTC(2171), CTA(2822), CTG(2508), TTA(3480), TTG(3174), CUU(3045), CUC(2171),
CUA(2822), CUG(2508), UUA(3480), UUG(3174), ATG(3074), AUG(3074), AAT(3605),
AAC(3020), AAU(3605), CCT(2379), CCC(1672), CCA(2612), CCG(1777), CCU(2379),
CAA(3140), CAG(2426), CGT(2443), CGC(2062), CGA(2360), CGG(1746), AGA(2699),
AGG(2279), CGU(2443), TCT(2855), TCC(2389), TCA(3128), TCG(2405), AGT(2825),
AGC(2578), UCU(2855), UCC(2389), UCA(3128), UCG(2405), AGU(2825), ACT(2877),
ACC(2490), ACA(2960), ACG(2419), ACU(2877), GTT(3031), GTC(2393), GTA(2885),
GTG(2423), GUU(3031), GUC(2393), GUA(2885), GUG(2423), TGG(2513), UGG(2513),
TAT(3407), TAC(2907), UAU(3407), UAC(2907),
Link: NZ_CP072387.1
Cellulosimicrobium cellulans
Codon (Counts):
GCT(7), GCC(8), GCA(4), GCG(6), GCU(7), TGT(6), TGC(6),Total Codons: 521
UGU(6), UGC(6), GAT(6), GAC(6), GAU(6), GAA(6), GAG(7),
TTT(2), TTC(6), UUU(2), UUC(6), GGT(5), GGC(6), GGA(7),
GGG(5), GGU(5), CAT(7), CAC(5), CAU(7), ATT(6), ATC(6),
ATA(4), AUU(6), AUC(6), AUA(4), AAA(3), AAG(6), CTT(4),
CTC(8), CTA(5), CTG(5), TTA(2), TTG(6), CUU(4), CUC(8),
CUA(5), CUG(5), UUA(2), UUG(6), ATG(4), AUG(4), AAT(4),
AAC(6), AAU(4), CCT(7), CCC(4), CCA(7), CCG(6), CCU(7),
CAA(5), CAG(5), CGT(6), CGC(6), CGA(6), CGG(6), AGA(6),
AGG(6), CGU(6), TCT(7), TCC(6), TCA(7), TCG(6), AGT(5),
AGC(6), UCU(7), UCC(6), UCA(7), UCG(6), AGU(5), ACT(5),
ACC(6), ACA(5), ACG(6), ACU(5), GTT(6), GTC(5), GTA(5),
GTG(6), GUU(6), GUC(5), GUA(5), GUG(6), TGG(5), UGG(5),
TAT(4), TAC(4), UAU(4), UAC(4),
Link: NC_022538.1
Alteracholeplasma palmae
Codon (Counts):
GCT(1558), GCC(1144), GCA(1578), GCG(959), GCU(1558), TGT(1770), TGC(1575),Total Codons: 157,338
UGU(1770), UGC(1575), GAT(1861), GAC(1362), GAU(1861), GAA(1879), GAG(1357),
TTT(2148), TTC(1868), UUU(2148), UUC(1868), GGT(1462), GGC(1115), GGA(1480),
GGG(1006), GGU(1462), CAT(1857), CAC(1409), CAU(1857), ATT(2226), ATC(1859),
ATA(2162), AUU(2226), AUC(1859), AUA(2162), AAA(2139), AAG(1944), CTT(1951),
CTC(1348), CTA(1880), CTG(1482), TTA(2201), TTG(1902), CUU(1951), CUC(1348),
CUA(1880), CUG(1482), UUA(2201), UUG(1902), ATG(1836), AUG(1836), AAT(2229),
AAC(1868), AAU(2229), CCT(1497), CCC(1038), CCA(1585), CCG(806), CCU(1497),
CAA(1887), CAG(1519), CGT(1150), CGC(959), CGA(1097), CGG(820), AGA(1847),
AGG(1505), CGU(1150), TCT(1837), TCC(1473), TCA(1864), TCG(1093), AGT(1827),
AGC(1568), UCU(1837), UCC(1473), UCA(1864), UCG(1093), AGU(1827), ACT(1872),
ACC(1494), ACA(1764), ACG(1159), ACU(1872), GTT(1856), GTC(1324), GTA(1737),
GTG(1438), GUU(1856), GUC(1324), GUA(1737), GUG(1438), TGG(1518), UGG(1518),
TAT(2126), TAC(1738), UAU(2126), UAC(1738),
Link: NZ_CP035288.1
Staphylococcus epidermidis
Codon (Counts):
GCT(2698), GCC(1991), GCA(2714), GCG(1926), GCU(2698), TGT(3117), TGC(2721),Total Codons: 273,769
UGU(3117), UGC(2721), GAT(3160), GAC(2476), GAU(3160), GAA(3200), GAG(2445),
TTT(3564), TTC(3200), UUU(3564), UUC(3200), GGT(2584), GGC(2005), GGA(2488),
GGG(1729), GGU(2584), CAT(3287), CAC(2561), CAU(3287), ATT(3803), ATC(3211),
ATA(3608), AUU(3803), AUC(3211), AUA(3608), AAA(3594), AAG(3184), CTT(3211),
CTC(2394), CTA(3017), CTG(2583), TTA(3703), TTG(3296), CUU(3211), CUC(2394),
CUA(3017), CUG(2583), UUA(3703), UUG(3296), ATG(3259), AUG(3259), AAT(3807),
AAC(3213), AAU(3807), CCT(2567), CCC(1746), CCA(2636), CCG(1698), CCU(2567),
CAA(3289), CAG(2542), CGT(2440), CGC(1972), CGA(2403), CGG(1664), AGA(2998),
AGG(2542), CGU(2440), TCT(3003), TCC(2465), TCA(3326), TCG(2354), AGT(3042),
AGC(2648), UCU(3003), UCC(2465), UCA(3326), UCG(2354), AGU(3042), ACT(3088),
ACC(2609), ACA(3105), ACG(2497), ACU(3088), GTT(3128), GTC(2453), GTA(3032),
GTG(2589), GUU(3128), GUC(2453), GUA(3032), GUG(2589), TGG(2617), UGG(2617),
TAT(3586), TAC(3034), UAU(3586), UAC(3034),
Link: NZ_CP028130.1
Rathayibacter iranicus
Codon (Counts):
GCT(189), GCC(198), GCA(181), GCG(200), GCU(189), TGT(171), TGC(189),Total Codons: 16,551
UGU(171), UGC(189), GAT(179), GAC(189), GAU(179), GAA(188), GAG(194),
TTT(145), TTC(185), UUU(145), UUC(185), GGT(182), GGC(201), GGA(183),
GGG(164), GGU(182), CAT(180), CAC(166), CAU(180), ATT(160), ATC(187),
ATA(128), AUU(160), AUC(187), AUA(128), AAA(138), AAG(172), CTT(173),
CTC(194), CTA(143), CTG(191), TTA(127), TTG(169), CUU(173), CUC(194),
CUA(143), CUG(191), UUA(127), UUG(169), ATG(176), AUG(176), AAT(160),
AAC(168), AAU(160), CCT(185), CCC(167), CCA(177), CCG(195), CCU(185),
CAA(167), CAG(188), CGT(187), CGC(192), CGA(202), CGG(201), AGA(170),
AGG(188), CGU(187), TCT(179), TCC(186), TCA(178), TCG(203), AGT(157),
AGC(196), UCU(179), UCC(186), UCA(178), UCG(203), AGU(157), ACT(169),
ACC(177), ACA(165), ACG(180), ACU(169), GTT(173), GTC(188), GTA(148),
GTG(183), GUU(173), GUC(188), GUA(148), GUG(183), TGG(170), UGG(170),
TAT(137), TAC(151), UAU(137), UAC(151),
Link: NZ_CP077078.1
Pseudomonas azerbaijanoriens
Codon (Counts):
GCT(1196), GCC(1275), GCA(1224), GCG(1231), GCU(1196), TGT(1107), TGC(1216),Total Codons: 107,515
UGU(1107), UGC(1216), GAT(1174), GAC(1149), GAU(1174), GAA(1176), GAG(1110),
TTT(1081), TTC(1176), UUU(1081), UUC(1176), GGT(1157), GGC(1262), GGA(1115),
GGG(1102), GGU(1157), CAT(1159), CAC(1141), CAU(1159), ATT(1115), ATC(1178),
ATA(943), AUU(1115), AUC(1178), AUA(943), AAA(1088), AAG(1155), CTT(1137),
CTC(1114), CTA(903), CTG(1219), TTA(922), TTG(1173), CUU(1137), CUC(1114),
CUA(903), CUG(1219), UUA(922), UUG(1173), ATG(1146), AUG(1146), AAT(1112),
AAC(1150), AAU(1112), CCT(1153), CCC(1111), CCA(1192), CCG(1242), CCU(1153),
CAA(1191), CAG(1224), CGT(1148), CGC(1233), CGA(1218), CGG(1226), AGA(1063),
AGG(1144), CGU(1148), TCT(1074), TCC(1119), TCA(1181), TCG(1228), AGT(1068),
AGC(1201), UCU(1074), UCC(1119), UCA(1181), UCG(1228), AGU(1068), ACT(1079),
ACC(1158), ACA(1088), ACG(1120), ACU(1079), GTT(1153), GTC(1165), GTA(1009),
GTG(1154), GUU(1153), GUC(1165), GUA(1009), GUG(1154), TGG(1206), UGG(1206),
TAT(964), TAC(1034), UAU(964), UAC(1034),
Link: NZ_CP014209.1
Isoptericola dokdonensis
Codon (Counts):
GCT(23), GCC(24), GCA(26), GCG(25), GCU(23), TGT(22), TGC(22),Total Codons: 2,067
UGU(22), UGC(22), GAT(21), GAC(27), GAU(21), GAA(23), GAG(24),
TTT(15), TTC(24), UUU(15), UUC(24), GGT(26), GGC(27), GGA(25),
GGG(24), GGU(26), CAT(21), CAC(24), CAU(21), ATT(15), ATC(24),
ATA(12), AUU(15), AUC(24), AUA(12), AAA(12), AAG(19), CTT(21),
CTC(24), CTA(19), CTG(22), TTA(11), TTG(19), CUU(21), CUC(24),
CUA(19), CUG(22), UUA(11), UUG(19), ATG(21), AUG(21), AAT(15),
AAC(22), AAU(15), CCT(24), CCC(25), CCA(24), CCG(27), CCU(24),
CAA(22), CAG(24), CGT(23), CGC(26), CGA(28), CGG(28), AGA(19),
AGG(25), CGU(23), TCT(22), TCC(25), TCA(25), TCG(25), AGT(22),
AGC(23), UCU(22), UCC(25), UCA(25), UCG(25), AGU(22), ACT(21),
ACC(24), ACA(21), ACG(25), ACU(21), GTT(22), GTC(25), GTA(21),
GTG(24), GUU(22), GUC(25), GUA(21), GUG(24), TGG(21), UGG(21),
TAT(14), TAC(21), UAU(14), UAC(21),
Link: NZ_CP046621.1
Pseudomonas alkylphenolica
Codon (Counts):
GCT(788), GCC(807), GCA(787), GCG(787), GCU(788), TGT(700), TGC(788),Total Codons: 69,311
UGU(700), UGC(788), GAT(760), GAC(725), GAU(760), GAA(755), GAG(710),
TTT(698), TTC(763), UUU(698), UUC(763), GGT(738), GGC(811), GGA(721),
GGG(688), GGU(738), CAT(755), CAC(742), CAU(755), ATT(702), ATC(771),
ATA(623), AUU(702), AUC(771), AUA(623), AAA(695), AAG(746), CTT(745),
CTC(709), CTA(607), CTG(794), TTA(605), TTG(747), CUU(745), CUC(709),
CUA(607), CUG(794), UUA(605), UUG(747), ATG(739), AUG(739), AAT(717),
AAC(748), AAU(717), CCT(755), CCC(709), CCA(779), CCG(769), CCU(755),
CAA(767), CAG(781), CGT(717), CGC(792), CGA(771), CGG(771), AGA(687),
AGG(746), CGU(717), TCT(683), TCC(718), TCA(771), TCG(776), AGT(691),
AGC(780), UCU(683), UCC(718), UCA(771), UCG(776), AGU(691), ACT(704),
ACC(759), ACA(726), ACG(718), ACU(704), GTT(728), GTC(720), GTA(675),
GTG(732), GUU(728), GUC(720), GUA(675), GUG(732), TGG(764), UGG(764),
TAT(645), TAC(689), UAU(645), UAC(689),
Link: NZ_CP070503.1
Pseudomonas atacamensis
Codon (Counts):
GCT(1052), GCC(1090), GCA(1071), GCG(1078), GCU(1052), TGT(936), TGC(1063),Total Codons: 92,272
UGU(936), UGC(1063), GAT(1012), GAC(989), GAU(1012), GAA(1027), GAG(938),
TTT(924), TTC(1001), UUU(924), UUC(1001), GGT(1011), GGC(1086), GGA(961),
GGG(897), GGU(1011), CAT(992), CAC(993), CAU(992), ATT(932), ATC(1021),
ATA(783), AUU(932), AUC(1021), AUA(783), AAA(946), AAG(991), CTT(969),
CTC(943), CTA(773), CTG(1065), TTA(769), TTG(1009), CUU(969), CUC(943),
CUA(773), CUG(1065), UUA(769), UUG(1009), ATG(1003), AUG(1003), AAT(951),
AAC(996), AAU(951), CCT(967), CCC(937), CCA(1021), CCG(1065), CCU(967),
CAA(1024), CAG(1059), CGT(982), CGC(1109), CGA(1048), CGG(1052), AGA(916),
AGG(975), CGU(982), TCT(918), TCC(948), TCA(1014), TCG(1065), AGT(915),
AGC(1038), UCU(918), UCC(948), UCA(1014), UCG(1065), AGU(915), ACT(933),
ACC(1004), ACA(948), ACG(991), ACU(933), GTT(1002), GTC(992), GTA(855),
GTG(985), GUU(1002), GUC(992), GUA(855), GUG(985), TGG(1034), UGG(1034),
TAT(812), TAC(880), UAU(812), UAC(880),
Link: NZ_LR215050.1
Acholeplasma hippikon
Codon (Counts):
GCT(1252), GCC(957), GCA(1328), GCG(904), GCU(1252), TGT(1499), TGC(1349),Total Codons: 132,680
UGU(1499), UGC(1349), GAT(1590), GAC(1129), GAU(1590), GAA(1591), GAG(1077),
TTT(1781), TTC(1583), UUU(1781), UUC(1583), GGT(1290), GGC(906), GGA(1223),
GGG(834), GGU(1290), CAT(1579), CAC(1219), CAU(1579), ATT(1853), ATC(1572),
ATA(1723), AUU(1853), AUC(1572), AUA(1723), AAA(1770), AAG(1613), CTT(1595),
CTC(1124), CTA(1428), CTG(1261), TTA(1811), TTG(1630), CUU(1595), CUC(1124),
CUA(1428), CUG(1261), UUA(1811), UUG(1630), ATG(1584), AUG(1584), AAT(1855),
AAC(1552), AAU(1855), CCT(1231), CCC(884), CCA(1365), CCG(788), CCU(1231),
CAA(1606), CAG(1254), CGT(1110), CGC(901), CGA(1106), CGG(782), AGA(1497),
AGG(1198), CGU(1110), TCT(1499), TCC(1229), TCA(1616), TCG(1098), AGT(1490),
AGC(1265), UCU(1499), UCC(1229), UCA(1616), UCG(1098), AGU(1490), ACT(1499),
ACC(1286), ACA(1476), ACG(1117), ACU(1499), GTT(1570), GTC(1136), GTA(1462),
GTG(1222), GUU(1570), GUC(1136), GUA(1462), GUG(1222), TGG(1349), UGG(1349),
TAT(1707), TAC(1449), UAU(1707), UAC(1449),
Link: NZ_CP035495.1
Xylanimonas allomyrinae
Codon (Counts):
GCT(27), GCC(31), GCA(29), GCG(34), GCU(27), TGT(24), TGC(31),Total Codons: 2,603
UGU(24), UGC(31), GAT(30), GAC(31), GAU(30), GAA(28), GAG(31),
TTT(16), TTC(26), UUU(16), UUC(26), GGT(32), GGC(33), GGA(28),
GGG(31), GGU(32), CAT(29), CAC(31), CAU(29), ATT(19), ATC(31),
ATA(20), AUU(19), AUC(31), AUA(20), AAA(20), AAG(28), CTT(27),
CTC(31), CTA(24), CTG(30), TTA(14), TTG(25), CUU(27), CUC(31),
CUA(24), CUG(30), UUA(14), UUG(25), ATG(28), AUG(28), AAT(23),
AAC(28), AAU(23), CCT(32), CCC(30), CCA(30), CCG(32), CCU(32),
CAA(27), CAG(27), CGT(32), CGC(32), CGA(34), CGG(31), AGA(29),
AGG(29), CGU(32), TCT(26), TCC(31), TCA(29), TCG(32), AGT(24),
AGC(28), UCU(26), UCC(31), UCA(29), UCG(32), AGU(24), ACT(27),
ACC(31), ACA(27), ACG(31), ACU(27), GTT(24), GTC(32), GTA(23),
GTG(31), GUU(24), GUC(32), GUA(23), GUG(31), TGG(31), UGG(31),
TAT(14), TAC(26), UAU(14), UAC(26),
Link: NZ_CP018804.1
Histophilus somni
Codon (Counts):
GCT(1951), GCC(1738), GCA(2040), GCG(1603), GCU(1951), TGT(2015), TGC(2039),Total Codons: 189,993
UGU(2015), UGC(2039), GAT(2128), GAC(1668), GAU(2128), GAA(2195), GAG(1700),
TTT(2395), TTC(2166), UUU(2395), UUC(2166), GGT(1916), GGC(1719), GGA(1823),
GGG(1443), GGU(1916), CAT(2087), CAC(1833), CAU(2087), ATT(2479), ATC(2130),
ATA(2298), AUU(2479), AUC(2130), AUA(2298), AAA(2388), AAG(2175), CTT(2175),
CTC(1728), CTA(1955), CTG(1870), TTA(2410), TTG(2280), CUU(2175), CUC(1728),
CUA(1955), CUG(1870), UUA(2410), UUG(2280), ATG(2109), AUG(2109), AAT(2516),
AAC(2190), AAU(2516), CCT(1816), CCC(1454), CCA(1906), CCG(1716), CCU(1816),
CAA(2319), CAG(1847), CGT(1759), CGC(1638), CGA(1760), CGG(1716), AGA(2010),
AGG(1829), CGU(1759), TCT(1995), TCC(1835), TCA(2164), TCG(1765), AGT(1983),
AGC(1960), UCU(1995), UCC(1835), UCA(2164), UCG(1765), AGU(1983), ACT(2004),
ACC(1889), ACA(2076), ACG(1780), ACU(2004), GTT(2172), GTC(1675), GTA(1954),
GTG(1821), GUU(2172), GUC(1675), GUA(1954), GUG(1821), TGG(1899), UGG(1899),
TAT(2286), TAC(2014), UAU(2286), UAC(2014),
Link: NZ_CP018776.1
Staphylococcus condimenti
Codon (Counts):
GCT(2674), GCC(2121), GCA(2759), GCG(2159), GCU(2674), TGT(2969), TGC(2790),Total Codons: 265,259
UGU(2969), UGC(2790), GAT(3066), GAC(2409), GAU(3066), GAA(3131), GAG(2277),
TTT(3352), TTC(3122), UUU(3352), UUC(3122), GGT(2562), GGC(2108), GGA(2484),
GGG(1743), GGU(2562), CAT(3060), CAC(2490), CAU(3060), ATT(3520), ATC(3026),
ATA(3325), AUU(3520), AUC(3026), AUA(3325), AAA(3383), AAG(3083), CTT(3075),
CTC(2222), CTA(2703), CTG(2690), TTA(3401), TTG(3134), CUU(3075), CUC(2222),
CUA(2703), CUG(2690), UUA(3401), UUG(3134), ATG(3059), AUG(3059), AAT(3557),
AAC(3029), AAU(3557), CCT(2453), CCC(1739), CCA(2622), CCG(2088), CCU(2453),
CAA(3179), CAG(2674), CGT(2478), CGC(2168), CGA(2471), CGG(2077), AGA(2890),
AGG(2489), CGU(2478), TCT(2875), TCC(2455), TCA(3130), TCG(2427), AGT(2879),
AGC(2673), UCU(2875), UCC(2455), UCA(3130), UCG(2427), AGU(2879), ACT(2850),
ACC(2572), ACA(2955), ACG(2496), ACU(2850), GTT(3065), GTC(2387), GTA(2902),
GTG(2526), GUU(3065), GUC(2387), GUA(2902), GUG(2526), TGG(2569), UGG(2569),
TAT(3291), TAC(2901), UAU(3291), UAC(2901),
Link: NZ_CP077079.1
Pseudomonas asgharzadehiana
Codon (Counts):
GCT(1291), GCC(1379), GCA(1311), GCG(1345), GCU(1291), TGT(1176), TGC(1329),Total Codons: 115,780
UGU(1176), UGC(1329), GAT(1257), GAC(1218), GAU(1257), GAA(1258), GAG(1196),
TTT(1161), TTC(1257), UUU(1161), UUC(1257), GGT(1266), GGC(1373), GGA(1193),
GGG(1194), GGU(1266), CAT(1228), CAC(1252), CAU(1228), ATT(1154), ATC(1259),
ATA(1065), AUU(1154), AUC(1259), AUA(1065), AAA(1161), AAG(1234), CTT(1234),
CTC(1194), CTA(976), CTG(1325), TTA(1022), TTG(1272), CUU(1234), CUC(1194),
CUA(976), CUG(1325), UUA(1022), UUG(1272), ATG(1251), AUG(1251), AAT(1182),
AAC(1246), AAU(1182), CCT(1259), CCC(1192), CCA(1291), CCG(1322), CCU(1259),
CAA(1261), CAG(1308), CGT(1214), CGC(1365), CGA(1281), CGG(1323), AGA(1118),
AGG(1246), CGU(1214), TCT(1143), TCC(1195), TCA(1257), TCG(1292), AGT(1154),
AGC(1287), UCU(1143), UCC(1195), UCA(1257), UCG(1292), AGU(1154), ACT(1136),
ACC(1266), ACA(1184), ACG(1244), ACU(1136), GTT(1242), GTC(1220), GTA(1129),
GTG(1233), GUU(1242), GUC(1220), GUA(1129), GUG(1233), TGG(1303), UGG(1303),
TAT(1066), TAC(1124), UAU(1066), UAC(1124),
Link: NZ_CP014784.1
Pseudomonas alcaligenes
Codon (Counts):
GCT(510), GCC(540), GCA(518), GCG(523), GCU(510), TGT(430), TGC(505),Total Codons: 44,227
UGU(430), UGC(505), GAT(479), GAC(463), GAU(479), GAA(488), GAG(473),
TTT(403), TTC(490), UUU(403), UUC(490), GGT(466), GGC(530), GGA(470),
GGG(438), GGU(466), CAT(492), CAC(487), CAU(492), ATT(422), ATC(491),
ATA(398), AUU(422), AUC(491), AUA(398), AAA(423), AAG(478), CTT(461),
CTC(471), CTA(414), CTG(515), TTA(353), TTG(440), CUU(461), CUC(471),
CUA(414), CUG(515), UUA(353), UUG(440), ATG(480), AUG(480), AAT(432),
AAC(464), AAU(432), CCT(495), CCC(474), CCA(512), CCG(516), CCU(495),
CAA(471), CAG(520), CGT(463), CGC(528), CGA(492), CGG(505), AGA(457),
AGG(487), CGU(463), TCT(456), TCC(486), TCA(478), TCG(501), AGT(430),
AGC(509), UCU(456), UCC(486), UCA(478), UCG(501), AGU(430), ACT(455),
ACC(490), ACA(458), ACG(459), ACU(455), GTT(442), GTC(464), GTA(413),
GTG(456), GUU(442), GUC(464), GUA(413), GUG(456), TGG(499), UGG(499),
TAT(399), TAC(438), UAU(399), UAC(438),
Link: AB476400.1
mitochondrion Leiolepis guttata
Codon (Counts):
GCT(15), GCC(19), GCA(17), GCG(9), GCU(15), TGT(15), TGC(14),Total Codons: 1,682
UGU(15), UGC(14), GAT(16), GAC(16), GAU(16), GAA(17), GAG(15),
TTT(17), TTC(20), UUU(17), UUC(20), GGT(9), GGC(17), GGA(16),
GGG(11), GGU(9), CAT(21), CAC(23), CAU(21), ATT(23), ATC(23),
ATA(22), AUU(23), AUC(23), AUA(22), AAA(20), AAG(16), CTT(19),
CTC(18), CTA(22), CTG(15), TTA(20), TTG(18), CUU(19), CUC(18),
CUA(22), CUG(15), UUA(20), UUG(18), ATG(17), AUG(17), AAT(21),
AAC(22), AAU(21), CCT(23), CCC(19), CCA(21), CCG(14), CCU(23),
CAA(21), CAG(18), CGT(15), CGC(15), CGA(15), CGG(14), AGA(14),
AGG(15), CGU(15), TCT(17), TCC(21), TCA(22), TCG(16), AGT(15),
AGC(21), UCU(17), UCC(21), UCA(22), UCG(16), AGU(15), ACT(22),
ACC(22), ACA(21), ACG(16), ACU(22), GTT(15), GTC(15), GTA(15),
GTG(10), GUU(15), GUC(15), GUA(15), GUG(10), TGG(16), UGG(16),
TAT(22), TAC(20), UAU(22), UAC(20),
Link: AB537555.1
mitochondrion Leiolepis boehmei
Codon (Counts):
GCT(15), GCC(18), GCA(17), GCG(10), GCU(15), TGT(13), TGC(14),Total Codons: 1,537
UGU(13), UGC(14), GAT(14), GAC(14), GAU(14), GAA(18), GAG(14),
TTT(16), TTC(16), UUU(16), UUC(16), GGT(10), GGC(15), GGA(16),
GGG(12), GGU(10), CAT(19), CAC(19), CAU(19), ATT(20), ATC(19),
ATA(20), AUU(20), AUC(19), AUA(20), AAA(19), AAG(18), CTT(17),
CTC(14), CTA(19), CTG(14), TTA(19), TTG(17), CUU(17), CUC(14),
CUA(19), CUG(14), UUA(19), UUG(17), ATG(15), AUG(15), AAT(20),
AAC(20), AAU(20), CCT(22), CCC(19), CCA(18), CCG(13), CCU(22),
CAA(19), CAG(16), CGT(15), CGC(14), CGA(13), CGG(13), AGA(15),
AGG(15), CGU(15), TCT(14), TCC(17), TCA(18), TCG(15), AGT(15),
AGC(20), UCU(14), UCC(17), UCA(18), UCG(15), AGU(15), ACT(17),
ACC(21), ACA(20), ACG(15), ACU(17), GTT(15), GTC(13), GTA(15),
GTG(10), GUU(15), GUC(13), GUA(15), GUG(10), TGG(14), UGG(14),
TAT(17), TAC(20), UAU(17), UAC(20),
Link: AB537553.1
mitochondrion Leiolepis reevesii rubritaeniata
Codon (Counts):
GCT(7), GCC(10), GCA(8), GCG(6), GCU(7), TGT(7), TGC(9),Total Codons: 856
UGU(7), UGC(9), GAT(6), GAC(8), GAU(6), GAA(12), GAG(7),
TTT(10), TTC(8), UUU(10), UUC(8), GGT(6), GGC(7), GGA(9),
GGG(7), GGU(6), CAT(10), CAC(11), CAU(10), ATT(10), ATC(12),
ATA(11), AUU(10), AUC(12), AUA(11), AAA(12), AAG(11), CTT(10),
CTC(8), CTA(11), CTG(9), TTA(10), TTG(9), CUU(10), CUC(8),
CUA(11), CUG(9), UUA(10), UUG(9), ATG(7), AUG(7), AAT(11),
AAC(11), AAU(11), CCT(12), CCC(12), CCA(11), CCG(7), CCU(12),
CAA(12), CAG(9), CGT(8), CGC(5), CGA(7), CGG(7), AGA(10),
AGG(9), CGU(8), TCT(8), TCC(10), TCA(11), TCG(8), AGT(9),
AGC(10), UCU(8), UCC(10), UCA(11), UCG(8), AGU(9), ACT(11),
ACC(12), ACA(12), ACG(8), ACU(11), GTT(5), GTC(8), GTA(11),
GTG(5), GUU(5), GUC(8), GUA(11), GUG(5), TGG(6), UGG(6),
TAT(8), TAC(12), UAU(8), UAC(12),
Link: AB537554.1
mitochondrion Leiolepis belliana belliana
Codon (Counts):
GCT(12), GCC(13), GCA(14), GCG(8), GCU(12), TGT(11), TGC(14),Total Codons: 1,220
UGU(11), UGC(14), GAT(13), GAC(14), GAU(13), GAA(15), GAG(8),
TTT(12), TTC(12), UUU(12), UUC(12), GGT(7), GGC(12), GGA(12),
GGG(7), GGU(7), CAT(16), CAC(15), CAU(16), ATT(15), ATC(17),
ATA(15), AUU(15), AUC(17), AUA(15), AAA(18), AAG(14), CTT(15),
CTC(13), CTA(14), CTG(10), TTA(16), TTG(13), CUU(15), CUC(13),
CUA(14), CUG(10), UUA(16), UUG(13), ATG(13), AUG(13), AAT(19),
AAC(18), AAU(19), CCT(12), CCC(15), CCA(18), CCG(11), CCU(12),
CAA(19), CAG(14), CGT(10), CGC(11), CGA(9), CGG(9), AGA(13),
AGG(12), CGU(10), TCT(14), TCC(14), TCA(15), TCG(9), AGT(13),
AGC(12), UCU(14), UCC(14), UCA(15), UCG(9), AGU(13), ACT(15),
ACC(17), ACA(17), ACG(11), ACU(15), GTT(10), GTC(8), GTA(9),
GTG(11), GUU(10), GUC(8), GUA(9), GUG(11), TGG(10), UGG(10),
TAT(13), TAC(12), UAU(13), UAC(12),
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