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Friday, January 21, 2022

Appendix IITG2 KLQNOVWXYZ

This is an appendix to: It's In The GenBank - 2


SARS-CoV-2 Gene Analysis (by Country, 2020-2021)

Legend:

Columns:
Country = where virus was collected;
Version = NIH GenBank Identifier;
A,C,T, and G = column of molecule type;
gene = gene number a molecule type is in;
(example: gene = '1', A column = '6445'
there are 6,445 'A' molecules in gene 1.)

Focus on changes:
Each virus per country, is compared to the
Wuhan China original SARS-CoV-2 virus. And when
the numbers don't match, the count number is bold
otherwise the molecule count matches the original.


Country Version A C T G gene number
Kenya MW751130.1 6424 3742 6894 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW751133.1 6424 3742 6894 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
101 65 133 66 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 MW751146.1 6424 3742 6894 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
101 65 133 66 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 MW751149.1 6424 3742 6893 4229 1
1122 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW751154.1 6424 3742 6894 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW751157.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW751165.1 6424 3741 6893 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 OK449067.1 6424 3738 6896 4231 1
1123 722 1270 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW751170.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW751183.1 6413 3729 6876 4218 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 MW751109.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW751111.1 6423 3741 6894 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
97 73 111 58 7
30 24 59 16 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MW751121.1 6424 3739 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 MW751257.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 OK449077.1 6424 3742 6895 4228 1
1124 722 1270 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 119 60 7
30 24 60 17 8
101 65 133 66 9
400 315 266 278 10
35 21 42 18 11

 MW751341.1 6424 3737 6896 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 OK449081.1 6423 3740 6893 4229 1
1123 722 1270 704 2
224 175 276 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 OK449082.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 722 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OK449085.1 6427 3739 6895 4226 1
1123 722 1268 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 20 43 18 11

 OK510445.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 OK510442.1 6424 3740 6895 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 315 266 277 10
35 21 42 18 11

 OK510444.1 6424 3740 6894 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 OK449096.1 6424 3738 6896 4229 1
1123 722 1270 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 315 266 278 10
35 21 42 18 11

 OK449104.1 6424 3737 6898 4230 1
1123 722 1270 704 2
224 174 278 151 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 OK449112.1 6423 3740 6894 4230 1
1123 722 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11
South Korea MT020782.1 6424 3744 6892 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT126746.1 6423 3744 6892 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
100 65 133 67 8
399 315 265 280 9
36 21 42 17 10

 MT134007.1 6424 3744 6892 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
100 65 133 67 8
399 315 265 280 9
35 21 42 18 10

 MT134008.1 6424 3742 6894 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
100 65 133 67 8
399 315 265 280 9
35 21 42 18 10

 MT134009.1 6424 3744 6891 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
100 64 134 67 8
399 315 265 280 9
35 21 42 18 10

 MT134010.1 6425 3743 6893 4228 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
100 65 133 67 8
399 315 265 280 9
35 21 42 18 10

 MW466791.1 6424 3744 6892 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT039890.1 6424 3742 6894 4229 1
1124 722 1271 704 2
224 174 278 151 3
49 45 91 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
100 64 134 67 8
399 315 265 280 9
35 21 42 18 10

 MT730002.1 6424 3744 6893 4228 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT304474.1 6424 3743 6894 4228 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MT304475.1 6424 3743 6894 4228 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MT304476.1 6424 3743 6894 4228 1
1124 723 1271 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

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 MZ054875.1 6423 3735 6893 4229 1
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 MZ054879.1 6423 3742 6895 4229 1
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 MZ054881.1 6407 3726 6867 4212 1
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35 20 43 18 11

 MZ054889.1 6414 3735 6901 4226 1
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
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401 317 264 277 10
35 21 42 18 11

 MZ054892.1 6423 3733 6896 4228 1
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30 24 60 17 8
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35 21 42 18 11
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT510999.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 722 1271 704 2
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48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ144583.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
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48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT705206.1 6424 3739 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
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48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT396266.1 6426 3741 6894 4228 1
1122 723 1271 705 2
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67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
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 MT457398.1 6424 3743 6891 4228 1
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 MT457399.1 6424 3743 6891 4228 1
1124 723 1272 702 2
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170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
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35 21 42 18 11

 MT457390.1 6425 3741 6895 4228 1
1122 723 1271 705 2
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35 21 42 18 11

 MT457391.1 6428 3741 6894 4226 1
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48 45 92 42 4
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT457392.1 6424 3740 6895 4230 1
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT457393.1 6427 3741 6894 4227 1
1122 723 1271 705 2
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48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT457394.1 6424 3744 6890 4228 1
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 316 264 280 10
35 21 42 18 11

 MT457395.1 6424 3744 6890 4228 1
1124 723 1272 702 2
224 175 275 153 3
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67 26 66 26 6
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100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT457396.1 6424 3744 6890 4228 1
1124 724 1270 703 2
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48 45 92 42 4
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT457397.1 6423 3744 6890 4229 1
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399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW577029.1 6425 3739 6896 4229 1
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48 46 91 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 MT457400.1 6425 3741 6895 4228 1
1122 723 1271 705 2
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48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT457401.1 6425 3738 6897 4229 1
1122 723 1272 704 2
224 174 275 154 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW947280.1 6423 3735 6893 4229 1
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67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
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401 316 266 276 10
35 21 42 18 11

 OK356627.1 6425 3734 6893 4228 1
1121 720 1268 703 2
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67 26 66 26 6
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24 14 30 12 9
401 315 267 276 10
35 21 42 18 11

 OK356626.1 6425 3733 6894 4228 1
1121 719 1269 703 2
224 174 276 153 3
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170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
24 14 30 12 9
401 315 267 276 10
35 21 42 18 11

 OK356625.1 6424 3734 6894 4228 1
1121 720 1267 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
24 14 30 12 9
401 315 267 276 10
35 21 42 18 11

 OK356630.1 6425 3734 6895 4226 1
1121 719 1269 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
24 14 30 12 9
401 316 267 275 10
35 21 42 18 11

 OL555796.1 6423 3733 6895 4229 1
1121 720 1268 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 211 138 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
24 14 30 12 9
401 316 266 276 10
35 21 42 18 11

 OL548845.1 6413 3727 6885 4217 1
1122 720 1267 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
24 14 30 12 9
401 316 266 276 10
35 21 42 18 11
Niger MT576584.1 6423 3741 6894 4231 1
1123 723 1271 704 2
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170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT994707.1 6423 3741 6894 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL601623.1 6426 3740 6896 4227 1
1122 722 1272 700 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL601624.1 6424 3740 6896 4229 1
1106 715 1257 698 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
66 27 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 61 16 8
99 63 131 66 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL601627.1 6423 3744 6891 4231 1
1117 716 1257 693 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL601629.1 6425 3738 6897 4229 1
1095 708 1241 686 2
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48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL601631.1 6424 3739 6898 4228 1
1118 718 1262 696 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL601633.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 721 1273 704 2
225 174 276 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL601634.1 6423 3740 6895 4231 1
1094 707 1237 685 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL601636.1 6423 3744 6891 4231 1
1123 722 1272 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 25 59 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL601637.1 6425 3743 6892 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 OL601638.1 6425 3743 6892 4229 1
1123 724 1270 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 119 60 7
30 24 60 17 8
100 63 135 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 OL601640.1 6398 3724 6861 4208 1
1122 724 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 23 61 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL601641.1 6424 3742 6893 4230 1
1104 711 1257 697 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 266 276 10
35 21 42 18 11

 OL601642.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 315 265 276 10
35 21 42 18 11

 OL601643.1 6421 3741 6894 4229 1
1122 723 1272 703 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
99 64 134 68 9
402 316 265 276 10
36 20 42 18 11

 OL601644.1 6398 3728 6869 4217 1
1119 718 1262 694 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 25 60 16 8
100 64 134 67 9
401 316 266 276 10
35 21 42 18 11

 OL601645.1 6424 3741 6895 4229 1
1110 721 1261 702 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
99 64 134 68 9
402 316 265 276 10
36 20 42 18 11

 OL601574.1 6425 3735 6893 4227 1
1118 718 1261 699 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
24 14 30 12 9
401 316 266 276 10
35 21 42 18 11

 OL601565.1 6423 3736 6893 4228 1
1120 722 1268 702 2
224 174 276 153 3
48 44 93 42 4
170 147 212 139 5
67 26 63 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
398 312 265 281 10
35 21 42 18 11

 OL601577.1 6425 3735 6892 4228 1
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 MZ331872.1 6425 3742 6890 4227 1
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 MZ331872.1 6425 3742 6890 4227 1
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