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Friday, January 21, 2022

Appendix IITG2 B

This is an appendix to: It's In The GenBank - 2


SARS-CoV-2 Gene Analysis (by Country, 2020-2021)

Legend:

Columns:
Country = where virus was collected;
Version = NIH GenBank Identifier;
A,C,T, and G = column of molecule type;
gene = gene number a molecule type is in;
(example: gene = '1', A column = '6445'
there are 6,445 'A' molecules in gene 1.)

Focus on changes:
Each virus per country, is compared to the
Wuhan China original SARS-CoV-2 virus. And when
the numbers don't match, the count number is bold
otherwise the molecule count matches the original.


Country Version A C T G gene number
Bahrain MW228280.1 6425 3739 6896 4228 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 315 266 277 10
35 21 42 18 11

 MW228054.1 6425 3739 6894 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 151 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW228055.1 6424 3741 6894 4229 1
1123 722 1272 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 MT745584.1 6424 3740 6897 4228 1
1123 723 1271 704 2
224 175 277 151 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT745767.1 6424 3740 6896 4229 1
1123 722 1272 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT731346.1 6424 3740 6896 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT742782.1 6425 3741 6894 4229 1
1123 723 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT742783.1 6424 3740 6896 4229 1
1122 723 1271 705 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT742784.1 6425 3736 6899 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT789712.1 6424 3739 6899 4227 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 135 66 9
399 314 266 280 10
35 21 42 18 11

 MT745875.1 6429 3739 6893 4227 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT745836.1 6424 3740 6896 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW655537.1 6425 3739 6895 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW228050.1 6424 3739 6898 4227 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 144 214 139 5
67 26 66 26 6
108 79 118 60 7
30 24 60 17 8
99 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW227484.1 6426 3738 6895 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 173 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW228279.1 6424 3739 6896 4229 1
1122 723 1271 705 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 27 65 26 6
106 79 118 62 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 MW228056.1 6426 3739 6896 4228 1
1122 722 1272 705 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 25 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 MW228051.1 6425 3737 6896 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW655535.1 6425 3738 6897 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW227483.1 6424 3740 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW228052.1 6427 3739 6897 4223 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
398 315 265 281 10
35 21 42 18 11

 MW227482.1 6426 3738 6895 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 173 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW655536.1 6425 3737 6896 4230 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW655538.1 6425 3738 6895 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW332552.1 6426 3739 6895 4228 1
1122 723 1272 704 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11
Bangladesh MT476385.1 6423 3742 6895 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT577359.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT566435.1 6423 3743 6895 4228 1
1123 724 1270 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 316 265 278 10
35 21 42 18 11

 MT566436.1 6423 3741 6897 4228 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 316 265 278 10
35 21 42 18 11

 MT566437.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT581410.1 6423 3740 6896 4230 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT581411.1 6423 3742 6895 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 315 266 277 10
35 21 42 18 11

 MT581412.1 6425 3742 6893 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT581413.1 6423 3739 6897 4230 1
1123 723 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT581414.1 6423 3742 6895 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 63 134 68 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT581415.1 6424 3740 6896 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 267 279 10
35 21 42 18 11

 MT581416.1 6425 3739 6895 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
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35 21 42 18 11

 MT581417.1 6424 3740 6895 4230 1
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48 45 92 42 4
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67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT581418.1 6425 3740 6895 4229 1
1123 722 1271 705 2
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT581419.1 6425 3739 6896 4228 1
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT581420.1 6423 3742 6896 4228 1
1123 723 1271 704 2
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48 45 92 42 4
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67 26 66 26 6
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35 21 42 18 11

 MT581421.1 6423 3742 6896 4228 1
1123 723 1271 704 2
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67 26 66 26 6
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400 316 265 278 10
35 21 42 18 11

 MT581422.1 6423 3742 6896 4228 1
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400 316 265 278 10
35 21 42 18 11

 MT581423.1 6423 3742 6896 4228 1
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35 21 42 18 11

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30 24 60 17 8
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35 21 42 18 11

 MT581427.1 6423 3741 6896 4229 1
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67 26 66 26 6
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35 21 42 18 11

 MT581428.1 6414 3736 6881 4224 1
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
400 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MT581429.1 6424 3741 6896 4228 1
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
36 21 42 17 11

 MT581430.1 6424 3741 6895 4228 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
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170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT581431.1 6425 3741 6895 4228 1
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67 26 66 26 6
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100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11
Benin MT653071.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 723 1272 703 2
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67 26 66 26 6
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100 64 134 67 9
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35 21 42 18 11

 MT653072.1 6425 3739 6895 4230 1
1123 724 1271 703 2
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67 26 66 26 6
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100 64 134 67 9
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35 21 42 18 11

 MT653073.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 173 278 152 3
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67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT653081.1 6424 3743 6893 4229 1
1124 723 1271 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
101 65 133 66 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 MT653082.1 6421 3739 6893 4231 1
1123 723 1271 704 2
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48 45 92 42 4
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67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT653078.1 6424 3743 6890 4230 1
1124 723 1271 703 2
224 173 276 153 3
48 45 92 42 4
170 145 214 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 MT653075.1 6423 3738 6896 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 133 66 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT653076.1 6424 3739 6893 4229 1
1122 723 1272 703 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 133 66 9
399 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 MT653074.1 6424 3742 6892 4230 1
1123 722 1271 704 2
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48 45 92 42 4
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67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT653077.1 6422 3740 6892 4231 1
1123 724 1269 704 2
224 173 278 152 3
48 45 92 42 4
170 145 212 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 314 265 280 10
35 21 42 18 11

 MT653079.1 6422 3742 6889 4232 1
1124 723 1272 702 2
224 174 275 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11

 MT653080.1 6423 3743 6893 4230 1
1124 723 1272 702 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 65 133 67 9
400 315 265 279 10
35 21 42 18 11
Saba MW485930.1 6423 3740 6895 4231 1
1123 723 1271 704 2
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48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 135 66 9
399 315 266 279 10
35 21 42 18 11

 MW485244.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW485929.1 6424 3740 6895 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW485245.1 6424 3739 6897 4229 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW485248.1 6425 3740 6897 4227 1
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW485247.1 6425 3740 6897 4227 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW485931.1 6425 3740 6899 4225 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 315 266 277 10
35 21 42 18 11

 MW485249.1 6425 3739 6899 4226 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW485246.1 6425 3739 6898 4227 1
1123 722 1272 704 2
224 174 276 153 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 315 266 277 10
35 21 42 18 11

 MW485243.1 6424 3740 6897 4228 1
1123 722 1272 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 OL801329.1 6408 3728 6870 4204 1
1076 693 1211 682 2
224 173 277 153 3
48 45 92 42 4
170 147 212 139 5
67 26 66 26 6
107 78 119 61 7
30 23 61 17 8
89 58 106 53 9
398 314 269 278 10
35 21 42 18 11

 MW485930.1 6423 3740 6895 4231 1
1123 723 1271 704 2
224 174 277 152 3
48 45 92 42 4
170 146 213 139 5
67 26 66 26 6
107 79 118 61 7
30 24 60 17 8
100 64 135 66 9
399 315 266 279 10
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 MW485244.1 6424 3740 6895 4230 1
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35 21 42 18 11

 MW485929.1 6424 3740 6895 4230 1
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MW485245.1 6424 3739 6897 4229 1
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67 26 66 26 6
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399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

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 MW485247.1 6425 3740 6897 4227 1
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401 316 265 277 10
35 21 42 18 11

 MW485931.1 6425 3740 6899 4225 1
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 MW485249.1 6425 3739 6899 4226 1
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 MW485246.1 6425 3739 6898 4227 1
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100 64 134 67 9
401 315 266 277 10
35 21 42 18 11

 MW485243.1 6424 3740 6897 4228 1
1123 722 1272 704 2
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
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67 26 66 26 6
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100 64 134 67 9
399 316 264 280 10
35 21 42 18 11

 MZ331872.1 6425 3742 6890 4227 1
1124 723 1271 703 2
225 174 276 152 3
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67 26 66 26 6
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35 21 42 18 11

 MT710714.1 6424 3739 6897 4229 1
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 MT827202.1 6424 3739 6897 4229 1
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30 24 60 17 8
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401 317 264 277 10
35 21 42 18 11

 MZ419857.1 6424 3742 6893 4230 1
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401 317 264 277 10
35 21 42 18 11

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35 21 42 18 11

 MZ419861.1 6424 3742 6893 4230 1
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401 317 264 277 10
35 21 42 18 11

 MZ419866.1 6424 3742 6893 4230 1
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 MZ419867.1 6424 3742 6893 4230 1
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 MZ419859.1 6424 3743 6892 4230 1
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35 21 42 18 11

 MZ419872.1 6423 3742 6894 4230 1
1123 723 1271 704 2
224 174 276 153 3
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67 26 66 26 6
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
399 315 265 280 10
35 21 42 18 11

 MZ419873.1 6424 3742 6893 4230 1
1123 723 1271 704 2
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30 24 60 17 8
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399 316 264 280 10
35 21 42 18 11

 MT939654.1 6424 3741 6894 4230 1
1123 724 1270 704 2
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30 24 60 17 8
100 64 134 67 9
401 317 264 277 10
35 21 42 18 11
at

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